小麦育种历史揭示了植株构型和籽粒产量多性状基因组位点的协同选择

作物种质的多样性调查对于深入了解植物结构和谷物产量提高的基因组基础非常重要,这在小麦中仍然知之甚少。在这里,我们对过去 100 年收集的 287 个小麦种质进行了外显子组测序。群体遗传学分析确定了 6.7% 的小麦基因组在地方品种和具有提高产量的基因的品种之间的选择扫描中下降。这些扫描不对称地分布在 A 和 B 亚基因组上,调节基因被有利地选择。全基因组关联研究 (GWAS) 确定了与产量潜力性状相关的基因组位点,并定位了两个潜在基因,一个生长素响应因子 TaARF12 和一个 G 蛋白 γ 亚基基因 TaDEP1,其特征是多效调节植物高度和谷物重量。与地方品种相比,品种中等位基因频率增加的精英单核苷酸单倍型被鉴定并发现在育种过程中积累,TaARF12 和 TaDEP1 在经典植物高度 Rht-1 基因座的上位性中起作用,导致基于绿色革命的工作历史小麦育种模型。因此,我们的研究为选择特征提供了线索,以微调现代小麦育种工作的赤霉素途径,并为小麦研究界提供了丰富的基因组多样性资源。

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