脂质组研究工具 | MS-DIAL 4中的脂质组图谱

为加速脂质组研究，来自日本、中国、美国、西班牙和捷克的研究团队共同开发了一种非靶向的脂质组学平台，并将它包装在MS-DIAL 4软件中，同时分析获得117个类型的8051种不同脂质的目录。此项研究成果已发表在《Nature Biotechnology》杂志。

研究团队在人体血液、小鼠组织、其他哺乳动物细胞、藻类和植物等一系列来源的1056个生物样本中分析了117个脂质亚类中的8051种独特脂质，其中6570种在分子物种水平上具有特征。

为什么要构建脂质组图谱？

脂质作为细胞膜的关键成分、信号分子和能量储存分子和底物，在生物学中扮演着重要的角色，它们的生物功能很大程度上是由脂质结构多样性（超过40000种化合物）驱动的。

目前尽管有各种脂质鉴定软件工具，但仍需要改进和系统的脂质注释和定量，特别是使用统计方法，如保留时间(RT)、碰撞横截面(CCS)、质量/电荷比(m/z)等。脂质组学数据的标准化将增加脂质注释、定量和命名的可信度。此外，自动化数据处理工作流将使科学界能够检索历史日志，并加速脂质体分析中的透明数据科学。

MS-DIAL 4中的脂质组图谱

研究团队共同开发了一种非靶向的脂质组学平台，将它包装在MS-DIAL 4软件中，并符合脂质体标准倡议(LSI)半定量定义和脂质结构简写标记系统。同时结合离子迁移率MS/MS，提供了一个包含RT、CCS和其他MS信息的全面脂质组图谱。

通过表征生物样品中的脂质组信息，并根据实验数据而非计算机模拟进行配制，MS-DIAL 4覆盖范围优于现有脂质组学软件。

使用来自8个独立平台（包括Waters、SCIEX、Thermo Fisher、Bruker和Agilent Technologies的机器）上用不同的提取方法、内部标准和仪器获得的3个LC-MS研究子集验证MS-DIAL 4。

MS-DIAL 4是无供应商的代谢组学和脂质组学软件，支持LC-IM-MS / MS（Agilent，Waters和Bruker平台）数据的所有处理程序。

研究团队分析了117个脂质亚类中的8051种独特脂质，其中6570种在分子物种水平上具有特征，包括确认的酰基链特异性片段。所有结果，包括MS-DIAL源代码、质谱库和定义为LSI 2级或3级的半定量值，都在RIKEN PRIMe网站上进行管理，为推进生物标记物、药物开发和临床应用提供数据资源。

本次研究中所有的数据资源、程序包、源代码都可以在如下网址获取：

http://prime.psc.riken.jp/

PRIMe平台：http://prime.psc.riken.jp/

首发公号：国家基因库大数据平台

参考文献

Tsugawa H, Ikeda K, Takahashi M, et al. A lipidome atlas in MS-DIAL 4[J]. Nature Biotechnology, 2020: 1-5.

图片来源：参考文献和PRIMe平台，如有侵权请联系删除。