因为资历。
在分析联合舰队司令长官的遴选前先要了解日本高级将领的晋升原则：
海军大臣、军令部总长、联合舰队司令三大要职绝大多数情况下提拔自横须贺镇守府司令、吴镇守府司令、海军次官、军令部次长、第二舰队司令。
只能提拔后辈（海军兵学校期数在卸任将领之后），不能提拔学长（海军兵学校期数在卸任将领之前者），除非极端情况如后辈尚不符合条件（未能担任横须贺镇守府司令、吴镇守府司令、海军次官、军令部次长、第二舰队司令）。
依照吊床号顺序（毕业名次）进行晋升，不能颠倒顺序。
如果出现了海兵期数/吊床号顺序自后向前的特例，海兵期数/吊床号居于前者必须离开现役。
一个人的命运啊,当然要靠自我奋斗,但是也要考虑到历史的行程。出身地、亲戚、姻亲、老领导、政治立场等等也都是很重要滴。
山本五十六大将出自海兵第32期/海大14期，因此海兵第32期以前者不能接任联合舰队司令长官。31期的三个大将及川古志郎、加藤隆义和长谷川清就提前出局了。值得注意的是这三位在39年4月1日就已经晋升了大将，而山本恰恰是39年8月30日接任联合舰队司令长官的，因此这次晋升就是为了山本挪位置。31期三人众里的长谷川清（海兵31期/海大12期）是在虹口被德械师围殴出名气的，加藤隆义（海兵31期/海大12期）的义父是海军大佬加藤友三郎。出自盛冈的及川古志郎（海兵31期/海大13期），背景则更加雄厚，中学校友是板垣征四郎和米内光政（海兵29期/海大12期），东条英机的父亲东条英教也出自旧盛冈藩。因此及川在离开现役后并没有被束之高阁当军事参议官，而是把三大要职中的海军大臣和军令部总长玩了个遍。
再看与山本同期的32期，这部分人比较倒霉，因为山本上任时他们已经大多被赶出了现役。一方面是因为山本吊床号是第11名，所以排在他前面的盐泽幸一等人被赶去当了军事参议官；另一部分人则是因为当年打压条约派的“大角人事”遭了难，比如山本极为敬重的堀悌吉（海兵32期第1名/海大16期优等）只做到了中将就被勒令退役回家养老。
33期毕业生中最耀眼的是山本最看不上的两丰田——丰田副武（海兵33期/海大15期优等）和丰田贞次郎（海兵33期第1名/海大17期优等）。可惜的是山本死时丰田副武已经由吴镇守府司令晋升到了军事参议官（42年11月10日就任），因此为了让丰田副武继任只能先将他调回横须贺镇守府司令（43年4月23日就任）再调去当联合舰队司令长官。这么一折腾使得丰田接班的时间推迟到了44年5月3日（在任不满一年不能调动）。丰田贞次郎在41年4月4日已经离开现役，进入内阁担任商工大臣、外务大臣、拓务大臣等职。山本死时他还在内阁，因此顶多能担任海军大臣，不符合联合舰队司令长官的条件。
33期和34期的其他毕业生中，海大毕业的大多在山本死前就已离开了现役，比如：
有马宽中将（海兵33期第4名/海大14期）：1934年转入预备役。
有地十五郎中将（海兵33期第74名/海大15期）：1939年转入预备役。
出光万兵卫中将（海兵33期第8名/海大14期）：1939年转入预备役。
原敬太郎中将（海兵33期第34名/海大18期）：1938年转入预备役。
山下兼满中将（海兵33期第44名/海大15期）：1935年转入预备役。
此外，有不少旧日本海军公认的希望之星还没能等到开战就已经亡故：
佐藤三郎中将（海兵34期第2名/海大16期优等）：时任海大校长，1935年病死。
阿武清中将（海兵33期第3名/海大14期优等）：时任军令部第一部长，1938年病死。
井上肇治中将（海兵33期第19名/海大16期）：1938年病死。
小槙和辅少将（海兵33期第16名/海大16期）：曾任战舰「山城」舰长、第二舰队参谋长，1932年病死。
因此在山本死时晋升联合舰队司令长官的人选分别为：
横须贺镇守府司令：古贺峰一大将（海兵34期/海大15期）
吴镇守府司令：高桥伊望中将（海兵36期/海大17期）
海军次官：泽本赖雄中将（海兵36期第3名/海大17期）
军令部次长：伊藤整一中将（海兵39期/海大21期优等）
第二舰队司令：近藤信竹中将（海兵35期第1名/海大17期）
从资历看古贺峰一符合所有条件：身为横须贺镇守府司令、已经担任过军令部次长和第二舰队司令、对军令部和一线部队都很熟悉、参加过中日战争（担任支那方面舰队司令长官）。因此古贺峰一在山本死后继任联合舰队司令长官也变得顺理成章。
如果对旧日本海军高级将领的晋升有兴趣可以参见国务顾问的大作：
〔技术帖〕提督是怎么炼成的——旧日海高级将领晋升的路径
其实因为期数和吊床号的硬性规定，也有一些沧海遗珠被旧日本海军所错过，比如下面这些适合担任航空舰队/战队司令长官的人选：
秋山虎六（海兵33期第13名/海大14期）：曾任横须贺航空队附/教官/副长、霞浦航空队航空队教官、大村航空队司令心得、水上飞机母舰「若宫」舰长、航空本部教育部长。1934年转入预备役。
和田秀穗（海兵34期第17名/海大17期）：曾任横须贺镇守府附/航空术研究委员/副官/司令、霞浦航空队航空队教头/副长/司令、佐世保航空队司令、水上飞机母舰「若宫」航海长、空母「凤翔」舰长、空母「赤城」舰长、航空厂飞行机部长。1937年转入预备役。
原五郎（海兵35期第4名/海大17期）：曾任横须贺航空队附/司令、空母「凤翔」舰长、空母「赤城」舰长、航空本部技术部员/技术部长/、航空厂长。1940年病亡。