2021-02-18用ggprism包标注P值

ggplot2标注P值的方法有很多种，大多比较繁琐，今天发现一种简便的！！！
ggrism是ggplot2的扩展包，熟悉 GraphPad Prism小朋友应该知道，这个包是在R中实现 GraphPad Prism图形的包，可以改为Prism形式的坐标轴、颜色、填充等。
这都不是重点，这里重点介绍一下它为ggplot图形添加P值的功能。

加载包

library(ggplot2)
library(ggprism)
library(patchwork)

做一个P值的表

df_p_val <- data.frame(
  group1 = "OJ",
  group2 = "VC",
  p.adj = 0.0606,
  y.position = 36
)

绘图

p1 <- ggplot(ToothGrowth, aes(x = factor(supp), y = len)) + 
  geom_boxplot(aes(fill = factor(supp))) + 
  scale_fill_prism(palette = "candy_bright") + 
  theme_prism() + 
  theme(legend.position = "none")

加P值

p2 <- p1 + add_pvalue(df_p_val)
p1 + p2

image.png

感觉简单易行，比添加segment的线好多了！
（人太懒了，就得找懒办法）