女性生殖系统（FRS）的菌群对人类健康最重要贡献之一是保护人类免受性传播疾病感染（STI）、细菌性阴道炎和真菌感染。免受病毒和细菌感染的能力被归因于阴道的低pH值，但也有一些其他机制参与其中。
1. FRS菌群可以防止一些性传播疾病的发生
人类免疫缺陷病毒（HIV）是一种慢病毒，它攻击免疫系统并最终导致获得性免疫缺陷综合症（AIDS）的发生。每年大约有180万新的HIV感染者和大约130万与HIV有关的死亡。无细胞的HIV在低pH值下会迅速失活。此外，在酸性条件下，T淋巴细胞的激活也会减少，这就降低了细胞对HIV的易感性。与水相比，FRS的粘液能捕获HIV颗粒并使其扩散速度降低1000倍以上。许多乳酸菌株产生的过氧化氢可以杀死HIV，乳酸在pH值<4.5时可以迅速杀死一系列的HIV亚型。HIV感染T淋巴细胞的第一阶段涉及其与CD4受体的结合，防止这种结合是预防HIV感染的一个重要手段。已经证明L.casei在其表面有一个类似CD4的受体，可以结合HIV，从而阻止其进入宿主细胞。
诱导NF-κB信号传导会导致HIV的生成增加，一些乳酸菌（鼠李糖乳杆菌和罗伊氏乳杆菌）能够抑制这种信号传导，因此，可能能够抑制HIV感染的进展。
生殖器疱疹是由单纯疱疹病毒1型（HSV-1）或2型（HSV-2）引起的，但从全球来看，大多数病例是由HSV-2引起的。2012年，全世界15-49岁的人中已有HSV-2感染的人数约为4.17亿，每年约有1920万新病例发生。HSV-2在低pH值下会迅速失活。乳酸在pH值<4.0时可杀死HSV-1和HSV-2。一些乳酸菌，如L. fermentum和L. brevis，产生小分子质量的蛋白质，可以杀死HSV-2。L. brevis对阴道上皮细胞有很高的亲和力，能够防止HSV-2感染这些细胞。
淋病是一种由外源性病原体淋病奈瑟菌引起的性传播疾病，全世界每年约有1.06亿个新病例发生在成年人中。如果感染没有被发现和治疗，会导致严重的并发症和后遗症，如盆腔炎、不孕症、异位妊娠、第一胎流产、新生儿结膜炎（导致失明）和传播性感染。该病还促进了艾滋病毒的传播和获得。乳酸菌可以抑制淋病菌生长，或杀死淋病菌。L. fermentum和L. rhamnosus产生的细菌素对淋病菌有效。淋病菌也被乳酸菌产生的乳酸和过氧化氢所抑制。此外，L. jensenii和L. gasseri不仅能够防止淋病菌粘附在人类上皮细胞上，而且在已经粘附在上皮细胞的淋病菌上时促使其移位。
沙眼衣原体是全世界最常见的性传播细菌感染性疾病，每年约有9200万新病例，它是妇女宫颈炎和输卵管炎的常见原因。该病原微生物只能在宿主细胞内复制，一些乳酸菌（L. brevis和Lactobacillus salivarius）能够阻止其与上皮细胞结合并被其吸收，以及抑制其在细胞内复制。乳酸菌产生的乳酸也被证明可以迅速杀死细胞外的沙眼衣原体。
2. 乳酸菌与造成细菌性阴道炎的微生物有拮抗作用
一些乳酸菌能够抑制与细菌性阴道炎（BV）发病机制有关的微生物生长，即Prev.bivia、G.vaginalis和Mobiluncus spp。在一项研究中，隶属15个不同物种的158株阴道乳酸菌中，有很大一部分被证明对三种主要BV病原体中的一种或多种具有拮抗作用。
3. 乳酸菌可以保护人们免受尿路病原体的侵害
阴道被致病菌定植是尿毒症（UTI）的一个常见前兆。许多乳酸菌可以抑制尿路病原体的生长，如E. coli，Pr. Vulgaris，Ps. Aeruginosa，Can. Albicans，K. pneumoniae, 和Ent. faecalis，从而帮助减少在阴道内的定植和随后发生的UTI。一些乳酸菌还可以抑制大肠杆菌等尿路病原体对上皮细胞的粘附，并取代已经粘附的细菌。一些乳酸菌（L. jensenii和L. rhamnosus）产生的生物表面活性剂可以抑制包括E. coli、Ent. faecalis、Can. albicans和Staph. epidermidis在内的各种尿路病原体在表面的附着。
4. 乳酸菌显示出对白色念珠菌的拮抗作用
FRS感染念珠菌的情况经常发生。L. crispatus可以下调白色念珠菌和其他念珠菌诱发的炎症，并可以抑制几种念珠菌的生长，包括Can. Albicans，Candida tropicalis，Can. glabrata和Can. krusei。这可归因于乳酸和过氧化氢的产生。L. fermentum产生一种抗菌蛋白，可以杀死白色念珠菌（也可以对Strep. agalactiae有杀伤力），也能够抑制白念珠菌对上皮细胞的粘附。L. jensenii也产生一种蛋白质，可以杀死白色念珠菌。L. crispatus和L. jensenii能够粘附在阴道上皮细胞上，并能竞争性地抑制白色念珠菌对这些细胞的粘附。
女性生殖系统菌群系列：
1.女性生殖系统主要结构：
【女性生殖系统菌群之一】女性生殖系统结构、生理与内环境
2.女性生殖系统检测到的微生物：
【女性生殖系统菌群之二】生殖系统菌群受年龄和系统生理学变化的影响
【女性生殖系统菌群之二】女性性成熟时期生殖系统菌群
【女性生殖系统菌群之二】阴道菌群群落状态及类型
【女性生殖系统菌群之二】影响阴道菌群和群落特征的因素
【女性生殖系统菌群之二】阴道真菌、病毒以及宫颈菌群
【女性生殖系统菌群之二】子宫微生物 or 菌群？
【女性生殖系统菌群之二】生殖系统其他部位菌群
3. 女性生殖系统菌群的微生物活性
【女性生殖系统菌群之三】女性生殖系统（FRS）菌群的微生物活性
参考文献：
Brotman RM (2011). Vaginal microbiome and sexually transmitted infections: an epidemiologic perspective. J Clin Invest 121: 4610–4617.
Green KA, Zarek SM & Catherino WH (2015). Gynecologic health and disease in relation to the microbiome of the female reproductive tract. Fertil Steril 104:1351–1357.
Martin DH (2012). The microbiota of the vagina and its influence on women’s health and disease. Am J Med Sci 343:2–9.
Mirmonsef P & Spear GT (2014). The barrier to HIV transmission provided by genital tract Lactobacillus colonization. Am J Reprod Immunol 71:531–536.
Petrova MI, van den Broek M, Balzarini J et al. (2013). Vaginal micro-biota and its role in HIV transmission and infection. FEMS Micro-biol Rev 37:762–792.
Prince AL, Antony KM, Chu DM & Aagaard KM (2014). The micro-biome, parturition, and timing of birth: more questions than answers. J Reprod Immunol 104–105:12–19.
Walther-António MR, Jeraldo P, Berg Miller ME et al. (2014). Pregnancy's stronghold on the vaginal microbiome. PLOS ONE 9:e98514