R语言安装第三方包的方法

转载：https://biozx.top/R-install-packages.html

从CRAN(https://cran.r-project.org/) 安装第三方包的方法：

>install.packages ("coefplot")

第二种：从bioconductor安装

从bioconductor(http://www.bioconductor.org/) 安装第三方包的方法：

> source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
> biocLite("limma")
> library(limma)

第三种：直接从Github上直接安装

直接从Github(https://github.com/) 上直接安装第三方包的方法：

1. 安装合适版本的R软件，安装对应版本的Rtools，安装Rstudio，安装Miketex软件（这些软件均可从官网下载）。
2. 打开R软件，选择镜像，安装“devtools”，具体可从R——程序包——安装程序包上进行，也可以使用''install.packages("devtools")''；还可以从CRAN上下载最新的程序包本地安装。（推荐最后一种）
3. 导入devtools包：''library(devtools)''
4. 使用''install_github("A","B")''，其中A表示要从GitHub上安装的软件包的名称，B表示开发该程序包的作者，由于install_github默认B是“hadley”（即作者是“hadley”）。举个例子，mgarch包是vst开发的，则是''install_github("mgarch","vst")''。或者''install_github("hadley/ggplot2") #（user,包）''

第四种：从源码安装

• 先下载第三方包的安装包，

• 然后设置安装包存放的目录为当前目录''setwd('xxxx')''

• 然后运行''install.packages("RCurl_1.95-4.8.tar.gz",repos = NULL,type = "source")' 安装