复现Science图表:细胞通讯受配体配对连线表达图(cellchat、cellphonedb)

之前微信群发布了一个图希望我们复现,是一篇science子刊的文章。展示的是细胞通讯的受配体对的表达情况。特点是受配体配对连线并展示了表达量。

复现Science图表:细胞通讯受配体配对连线表达图(cellchat、cellphonedb)_第1张图片

Singlecell RNA sequencing highlights intratumor heterogeneity and intercellular network featured in adamantinomatous craniopharyngioma

原文的方法部分描述如下,可以看出,作者展示的是cellchat结果的受配体对。但是我想cellphonedb的结果也是可以这样展示的。  

复现Science图表:细胞通讯受配体配对连线表达图(cellchat、cellphonedb)_第2张图片

复现这个还是花费了一番功夫,复现结果如下,结果最后需要用AI稍微排版一下,效果就更完美了。

复现Science图表:细胞通讯受配体配对连线表达图(cellchat、cellphonedb)_第3张图片

学习这一节的内容,其实不仅仅是这个图的复现,还是对ggplot2作图各种情况的处理,以及学习拼图。学习的时候也可以注意这些细节。

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