利用ORB/AKAZE特征点进行图像配准
Kp1,kp2都是list类型，两幅图都是500个特征点。这和ORB论文中的数据是一样的。4.4章节
Matches也是list类型，找到325个匹配对。
AKAZE文章中提到一个指标：MS(matching score)=# Correct Matches/# Features,
如果overlap area error 小于40%并且经矩阵变换后两个对应像素距离小于2.5个像素，就说明是correct match。这里的overlap area error没有搞懂，应该在Mikolajczyk的A comparison of affine region dectors中找到答案。
还没搞清楚的还有：代码中的matches指的应该是correspondence，因为ORB论文中有一句perform brute-force matching to find the best correspondence.代码中使用的正是BFMatcher。但是文章接下来给出的曲线图是The results are given in terms of the percentage of correct matches, against the angle of rotation.
the percentage of correctmatches应该等效于图上的纵坐标percentage of Inliers。那么percentage of和Inliers指的都应该是经过RANSAC提纯之后的匹配对。ORB文章中没有提到提纯，即剔除误匹配对的过程。
img3 = drawMatches(img1, kp1, img2, kp2, matches[:50])#找到50个匹配对
在绘制匹配对的时候，代码直接对匹配器中的50个进行连线。但是看到其他代码中还有一个排序的过程：
matches=sorted(matches,key=lambda x:x.distance)首先，Python中有两种排序方法，一种是sort，一种是Sorted。
L.sort(cmp=None, key=None, reverse=False) -- stable sort *IN PLACE*
Sort默认升序排序。要想颠倒排序，可将默认的False改为True。In place说明sort是就地排序，直接改变原来list
sorted(iterable, cmp=None, key=None, reverse=False) --> new sorted list
sorted会新建一个list，用来存放排序之后的数据
cmp：用于比较的函数，比较什么由key决定,有默认值，迭代集合中的一项;
key：用列表元素的某个属性和函数进行作为关键字，有默认值，迭代集合中的一项;
cmp和key可以使用lambda表达式。
可以理解为是cmp按照key的比较结果排序，而key直接按照参数排序。因为列表中的元素很可能是元组。简单来说，lambda返回冒号之后的值。下面两种方法是等价的
Sorting cmp:
>>>L = [('b',2),('a',1),('c',3),('d',4)]
>>>print sorted(L,cmp=lambda x,y:cmp(x[1],y[1]))
[('a', 1), ('b', 2), ('c', 3), ('d', 4)]
Sorting keys:
>>>L = [('b',2),('a',1),('c',3),('d',4)]
>>>print sorted(L, key=lambda x:x[1]))
[('a', 1), ('b', 2), ('c', 3), ('d', 4)]
Lamdba是匿名函数，有函数体，没有函数名，常用作回调函数的值。函数对象能维护状态，但语法开销大，而函数指针语法开销小，却没法保存范围内的状态。lambda函数结合了两者的优点。
Lambda还经常和Reduce函数放在一起使用。Reduce函数其实是一个具有递归作用的二元函数，对集合中的前两个执行函数，得到的结果再与第三个元素做运算，以此类推。
Reduce(lambda x,y:x*y,range(1,n+1)) #n的阶乘
sum=reduce(lambda x,y:x+y,(1,2,3,4,5,6,7)) #1+2+…+7
bf = cv2.BFMatcher(cv2.NORM_HAMMING, crossCheck=True)#暴力匹配,True判断交叉验证先使用cv.BFMatcher创造一个BfMatcher的对象。第一个参数normType，规定了匹配时使用的距离准则，默认是cv2.NORM_L2欧式距离，适用于SIFT、SURF等。对于二进制字符串构成的描述子如ORB、BRIEF、BRISK等，使用cv2.NORM_HAMMING汉明距离。汉明距离可以通过异或快速求解，这也是算法加速的原因。最后，If ORB is using WTA_K == 3 or 4, cv2.NORM_HAMMING2 should be used.
第二个参数crossCheck，是布尔型参数，默认为false。如果改为True，就开启了交叉验证，我理解的就是双向匹配，只有双向匹配成功的匹配对才被返回。数学上讲，有两个集合A和B，对于集合A中的i，在B中找到的最近点是j，如果对于j，在A中搜索，找到的最近点也是i，那么他们就验证成功。如下图，黄色的三角形在圆的集合中找到的最近点是绿色的圆。但是对于绿圆，最近的点的粉色的三角，即交叉验证失败。就像是找对象，必须男女双方互相看对眼才能牵手成功。当然，我们可以直接比较两个距离的大小，距离小于某个阈值认为匹配正确，SIFT则提出了最近邻和次近邻的比值与阈值比较。
It provides consistant result, and is a good alternative to ratio test proposed by D.Lowe in SIFT paper.手册上说这种交叉验证的方法可以是SIFT文章所提的最近邻比率法的一个很好的代替。
在创建BfMatcher的对象之后，有两种匹配方法，BFMatcher.match() and BFMatcher.knnMatch()。第一种返回的是最好的匹配对，第二种是返回k个最好的匹配对，k的取值由用户定义。两种匹配对对应的连线方法cv2.drawMatches()和cv2.drawMatchesKnn。这里再记录一下drawmatches的参数
void cv::drawMatches ( InputArray img1,
const std::vector< KeyPoint > & keypoints1,
InputArray img2,
const std::vector< KeyPoint > & keypoints2,
const std::vector< DMatch > & matches1to2,
InputOutputArray outImg,
const Scalar & matchColor = Scalar::all(-1),
const Scalar & singlePointColor = Scalar::all(-1),
const std::vector< char > & matchesMask = std::vector< char >(),
int flags = DrawMatchesFlags::DEFAULT
)
前四个参数分别是两幅图像和各自的特征点，matches1to2表明匹配的方向是从图1到图2，keypoints1[i] has a corresponding point in keypoints2[matches[i]] .
outImg是输出的图像。
matchColor决定了连线和特征点的颜色，如果matchColor==Scalar::all(-1) ,颜色随机生成。
singlePointColor决定了没有对应匹配对的孤立特征点的颜色
matchesMask决定哪些匹配对被画出，如果掩膜为空，则所有匹配对都被画出
flags是所画特征点的标志位， DEFAULT = 0,默认会画出所有特征点
BFMatcher.knnMatch()主要用于配合SIFT文章中的最近邻比率法使用。当最近的距离小于次近邻的0.75时（这个阈值的取值很重要，0.75出自于OpenCV手册，Lowe的论文中选取0.7），认为是正确匹配对。手册中是以SIFT算法为例展示了knn的用法，实际在ORB中也可以使用Knn和近邻比率法进行配对。
比率法在寻找最近距离的过程中综合考虑了次近邻，这样，只有当点很明显是最接近的情况下才会认为配对。对于一些疑似是对应点，但疑似情况差不多的点就不再认为是匹配点，即便他们与当前特征点的绝对距离都很近。
由KNN算法还可以引入kd数的构建和BBF算法，更快地在搜索空间中寻找k个近邻点。OpenCV中也集成了一个快速搜索最近邻的库FLANN(Fast Library for Approximate Nearest Neighbors),可以在特征点的描述子的维度高，特征点数目大的情况下依然快速找到最近邻点。写到这里可以注意到，当KNN中的K取1时就是最近邻。所以之前的BFMatcher中的BFMatcher.match() and BFMatcher.knnMatch()都可以通过FLANN实现。
基于FLANN的检测器主要有两个字典类型的参数，index_params和search_params。
#index_params与所选取的特征点检测算法有关
index_params = dict(algorithm = FLANN_INDEX_KDTREE, trees = 5)#kd树，对应SIFT、SURF
index_params= dict(algorithm = FLANN_INDEX_LSH, table_number = 6, key_size = 12, # 20
multi_probe_level = 1) #2 #LSH局部敏感哈希，对应ORB第二个参数search_params决定了迭代的次数。It specifies the number of times the trees in the index should be recursively traversed.迭代次数越多，准确度越高，但是耗时当然也越长。
Index参数和search参数定义好之后就可以创建搜索器并进行匹配了。
# FLANN parameters
16 FLANN_INDEX_KDTREE = 0
17 index_params = dict(algorithm = FLANN_INDEX_KDTREE, trees = 5)
18 search_params = dict(checks=50) # or pass empty dictionary
19
20 flann = cv2.FlannBasedMatcher(index_params,search_params)
21 #根据描述子进行k=2的knn搜索
22 matches = flann.knnMatch(des1,des2,k=2)
23
24 # Need to draw only good matches, so create a mask
#xrange是一个生成器。这里对matches进行标记，初始化为0.注意每一个match有最近和次近邻两个匹配点
25 matchesMask = [[0,0] for i in xrange(len(matches))]
26
27 # ratio test as per Lowe's paper
#对于最近邻m和次近邻n，如果最近距离小于次近邻的0.7，那么就将m标记成1，从而得到0,1组成的掩膜
28 for i,(m,n) in enumerate(matches):
29 if m.distance < 0.7*n.distance:
30 matchesMask[i]=[1,0]
31
32 draw_params = dict(matchColor = (0,255,0),
33 singlePointColor = (255,0,0),
34 matchesMask = matchesMask,
35 flags = 0)#利用掩膜，只画出最好的匹配的对
36
37 img3 = cv2.drawMatchesKnn(img1,kp1,img2,kp2,matches,None,**draw_params)
Matches是list类型的，里面存放了DMatch类型的匹配对，每个DMatch有4个成员变量：distance(float)、imgIdx(int)、queryIdx(int)、trainIdx(int)，表示了匹配对中特征点的距离，索引等信息。query是要匹配的描述子，train是被匹配的描述子
这是k=2时KNN的输出结果，对于每一个query，会匹配前两个最近邻的特征点。List中的元素是list，每一个list元素由两个DMatch构成。
经过最近邻比率法提纯后：
可以看到，直到query的第67个点才达成第一个正确匹配。
利用经过最近邻比率法匹配得到的匹配对，得到新的描述子，再通过新的描述子寻找单应矩阵，寻找单应矩阵的过程中又可以使用RANSAC等方法提纯。
遇到的问题是函数cv2.findHomography的第一第二个参数要求是array或者scalar类型的，srcPoints Coordinates of the points in the original plane, a matrix of the type CV_32FC2. or vector\
python中的list是python的内置数据类型，list中的数据类不必相同的，而array的中的类型必须全部相同，the type of objects stored in them is constrained，The type is specified at object creation time by using a type code, which is a single character.。在list中的数据类型保存的是数据的存放的地址，简单的说就是指针，并非数据，这样保存一个list就太麻烦了，例如list1=[1,2,3,'a']需要4个指针和四个数据，增加了存储和消耗cpu。
des1是ndarray类型的，包含383个特征点，每个特征点的描述子的维度是61（AKAZE），所以是一个383x61大小的矩阵。
忙活了半天把初始描述子中属于good的部分提取出来并转化成ndarray格式，却发现cv2.findHomography的前两个参数是特征点，而不是特征点的描述子，并且OpenCV又已经在链接5中给出了示例。
这是最终的图像配准代码：
#!/usr/bin/env.python
#coding=utf-8
## coding=gbk 支持中文注释
import numpy as np
import cv2
import math
import logging
orig_image=cv2.imread("beaver.png",0)
skewed_image=cv2.imread("beaver_xform.png",0)
cv2.imshow("graf1",orig_image)
cv2.imshow("graf2",skewed_image)
#定义函数
def mydrawMatches(orig_image, kp1, skewed_image, kp2, matches):
rows1=orig_image.shape[0]#height(rows) of image
cols1=orig_image.shape[1]#width(colums) of image
#shape[2]#the pixels value is made up of three primary colors
rows2=skewed_image.shape[0]
cols2=skewed_image.shape[1]
#初始化输出的新图像，将两幅实验图像拼接在一起，便于画出特征点匹配对
out=np.zeros((max([rows1,rows2]),cols1+cols2,3),dtype='uint8')
out[:rows1,:cols1] = np.dstack([orig_image, orig_image, orig_image])#Python切片特性，初始化out中orig_image，skewed_image的部分
out[:rows2,cols1:] = np.dstack([skewed_image, skewed_image, skewed_image])#dstack,对array的depth方向加深
for mat in matches:
orig_image_idx=mat.queryIdx
skewed_image_idx=mat.trainIdx
(x1,y1)=kp1[orig_image_idx].pt
(x2,y2)=kp2[skewed_image_idx].pt
cv2.circle(out,(int(x1),int(y1)),4,(255,255,0),1)#蓝绿色点，半径是4
cv2.circle(out, (int(x2) + cols1, int(y2)), 4, (0, 255, 255), 1)#绿加红得黄色点
cv2.line(out, (int(x1), int(y1)), (int(x2) + cols1, int(y2)), (255, 0, 0), 1)#蓝色连线
return out
# 检测器。ORB AKAZE可以，KAZE需要将BFMatcher中汉明距离换成cv2.NORM_L2
detector = cv2.AKAZE_create()
#kp1 = detector.detect(orig_image, None)
#kp2 = detector.detect(skewed_image, None)
#kp1, des1 = detector.compute(orig_image, kp1)#计算出描述子
#kp2, des2 = detector.compute(skewed_image, kp2)
#也可以一步直接同时得到特征点和描述子
# find the keypoints and descriptors with ORB
kp1, des1 = detector.detectAndCompute(orig_image, None)
kp2, des2 = detector.detectAndCompute(skewed_image, None)
bf = cv2.BFMatcher(cv2.NORM_HAMMING, crossCheck=True)#暴力匹配,True判断交叉验证
matches = bf.match(des1, des2)#利用匹配器得到相近程度
matches=sorted(matches,key=lambda x:x.distance)#按照描述子之间的距离进行排序
img3=cv2.drawMatches(orig_image, kp1, skewed_image, kp2, matches[:50],None,(255, 0, 0),flags=2)#找到50个匹配对
# Apply ratio test
bf = cv2.BFMatcher(cv2.NORM_HAMMING, crossCheck=False)#为了得到最近邻和次近邻，这里交叉验证要设置为false
matches = bf.knnMatch(des1,des2, k=2)
good = []
#lenofgood=0
for m, n in matches:
if m.distance < 0.75 * n.distance:
good.append([m])#good.append(m)
#lenofgood=lenofgood+1
#matches2 = sorted(good, key=lambda x: x.distance) # 按照描述子之间的距离进行排序
# cv2.drawMatchesKnn expects list of lists as matches.
#img4 = cv2.drawMatches(orig_image, kp1, skewed_image, kp2, matches2[:50],None, flags=2)
#img4 = cv2.drawMatchesKnn(orig_image, kp1, skewed_image, kp2, good[:50],None, flags=2)
img4 = cv2.drawMatchesKnn(orig_image, kp1, skewed_image, kp2, good,None, flags=2)
lenofgood=len(good)#good长度为24
des1fromgood=np.ones((lenofgood,61),dtype=np.uint8)
#des2fromgood=[]
des2fromgood=np.ones((lenofgood,61),dtype=np.uint8)
for num in range(0,24):
for i in good:
for j in i:
#good是list组成的list，每个子list中是DMatch
des1fromgood[num]=des1[j.queryIdx]#将good中的特征点对应的描述子形成新的描述子
#des2fromgood.append(des2[j.trainIdx])
des2fromgood[num] = des2[j.trainIdx]
cv2.imwrite("AKAZETest.jpg", img3)
cv2.imshow('AKAZETest', img3)
cv2.imwrite("AKAZETestRatio.jpg", img4)
cv2.imshow('AKAZETestRatio', img4)
#H,mask=cv2.findHomography(des1fromgood,des2fromgood,cv2.RANSAC,5.0)#,None,None,None,None,None)
good = []
for m, n in matches:
if m.distance < 0.7 * n.distance:
good.append(m)
MIN_MATCH_COUNT = 10
if len(good) > MIN_MATCH_COUNT:
src_pts = np.float32([kp1[m.queryIdx].pt for m in good
]).reshape(-1, 1, 2)
dst_pts = np.float32([kp2[m.trainIdx].pt for m in good
]).reshape(-1, 1, 2)
M, mask = cv2.findHomography(src_pts, dst_pts, cv2.RANSAC, 5.0)
ss = M[0, 1]
sc = M[0, 0]
scaleRecovered = math.sqrt(ss * ss + sc * sc)
thetaRecovered = math.atan2(ss, sc) * 180 / math.pi
#logging打印出通过矩阵计算出的尺度缩放因子和旋转因子
LOG_FORMAT = "%(asctime)s - %(levelname)s - %(message)s"
DATE_FORMAT = "%m/%d/%Y %H:%M:%S %p"
logging.basicConfig(filename='my.log', level=logging.DEBUG, format=LOG_FORMAT, datefmt=DATE_FORMAT)
#配置之后将log文件保存到本地
logging.info("MAP: Calculated scale difference: %.2f, "
"Calculated rotation difference: %.2f" %
(scaleRecovered, thetaRecovered))
# deskew image
im_out = cv2.warpPerspective(skewed_image, np.linalg.inv(M),
(orig_image.shape[1], orig_image.shape[0]))
result=cv2.warpPerspective(orig_image,M,(skewed_image.shape[1],skewed_image.shape[0]))
#注意warpPerspective与warpAffine的区别，不能互换
#img_warp=cv2.perspectiveTransform(orig_image,M)#,img_warp)
#c.shape[1] 为第一维的长度，c.shape[0] 为第二维的长度。
cv2.imshow("fan透视变换",im_out)
cv2.imshow("透视变换",result)
cv2.waitKey(0)reference:
- Lambda：https://blog.csdn.net/zcy19941015/article/details/47053799
- OpCVtutorial：https://docs.opencv.org/3.1.0/dc/dc3/tutorial_py_matcher.html
- 切片特性https://www.jianshu.com/p/5083f8d75439
- List指针https://blog.csdn.net/liyaohhh/article/details/51055147
- https://www.programcreek.com/python/example/70413/cv2.RANSAC