关于eccDNA能否做个测序发文章的讨论

    eccDNA,(extrachromosomal circular DNA,eccDNA)是细胞核内,独立于染色体的环状DNA,部分包含完整的基因拷贝。

    2019年11月,顶尖国际学术期刊《Nature》和《Cell》相继发表了关于染色体外环状DNA的重要研究,eccDNA携带癌基因,并可能促进肿瘤发生。使我们对肿瘤的研究开启了一个新热点。

    eccDNA是什么?在疾病跟正常组表达的分布是否有差异,肿瘤病人是否有更高的eccDNA拷贝数。这些多的拷贝,是否会增加癌基因的表达,是否转录非编码的基因。如果可以促进肿瘤发生,那么促癌的5种机理是什么?跟circRNA有什么异同点。有很多问题需要我们回答。

    本期,我们讨论这类分子,既然是比较新的分子,那么首先应该描述,比如胃癌,或者你研究的疾病,疾病中eccDNA的丰度是怎么样,包含什么基因信息,潜在功能是怎么样的,很有必要,做个测序,写一写描述性文章。


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