2021-09-26-day3--重点是

作业三：linux环境下的软件安装-conda

• conda类似于windows环境下的应用商店，可以通过它安装多种linux软件
• miniconda则是专门用来安装生信相关软件的一个分支conda。

一、conda的安装

1. 查看服务器位数 uname -a
2. 通过清华镜像网站下载wget url. linux的软件后缀为sh
3. 安装：bash name.sh
4. 激活：source ~/.bashrc

二、使用conda安装软件

1. 添加镜像网站：conda config --add channels url
2. 查看conda的软件列表：conda list
3. 安装软件：conda install name=version -y
4. 卸载软件：conda remove name -y

三、conda environment配置

1. 目的：为了使用不用版本的软件对多种数据进行处理
2. 查看目前环境：conda info --envs
3. 创建新的环境：conda create -n env_name software1 software2=version -y
4. 激活环境：conda activate env_name
5. 切换环境：

     conda deactive #使当前非base环境失活，从而回到base环境
     conda active base #直接激活base环境
   

conda