删除工作路径里所有的蛋白质文件的HETATM

linux系统,在终端直接输入运行:

for file in $(find . -name "*_pocket.pdb"); do
    pdbid=$(basename "$file" | cut -c1-4)
    grep -v HETATM "$file" > "${pdbid}_nowat.pdb"
done

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