生物学基础知识------CDS与ORF

基因（Gene）: 指产生一条有功能的蛋白质或RNA所需的全部核苷酸序列。

基因结构示意图

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编码区CDS（coding sequence）:是指编码一段蛋白产物的序列，是与蛋白质密码子一一对应的DNA序列。
开放阅读框（Open reading frame）:是指从一个起始密码子开始到一个终止密码子结束的一段序列。
※ CDS与ORF的联系与区别：
并不是所有读码框都能表达出蛋白产物，或者能表达出占有优势或者能产生生物学功能的蛋白；CDS必定是一个ORF，但也可能包括多个ORF，相反，每个ORF不一定都是CDS。
ORF: -- translation(理论上存在的)， CDS: -- transcription(事实存在的)
启动子（Promoter）和终止子（Terminator）:
启动子和终止子都是一段特殊的DNA序列，属于基因的非编码区，分别位于编码区的上游和下游，负责调控基因的转录。
启动子 Promoter：
※ DNA分子上能与RNA聚合酶结合并形成转录起始复合体的区域。
终止子 Terminator：
※ 转录过程中能能够终止RNA聚合酶转录的DNA序列。
起始密码子（Start codon）和终止密码子（Stop codon） ：
起始密码子和终止密码子都是mRNA上三联体碱基序列，分别决定翻译的起始和终止。
起始密码子Start codon：
✔ 指mRNA上开始合成蛋白质的密码子，也是第一个被核糖体翻译的mRNA上的密码子，位于编码区内，紧邻5'非翻译区。
终止密码子Stop codon：
✔ 终止肽链合成的mRNA的三联体碱基序列（UAA、UAG、UGA），它们不编码蛋白质。
UTR(Untranslated Regions):转录非翻译区，是mRNA分子两端的非编码片段。
5'-UTR从mRNA起点的甲基化鸟嘌呤核苷酸帽延伸至起始密码子AUG
3'-UTR从编码区末端的终止密码子延伸至多聚A尾巴（Poly-A）的前端。

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真核生物基因结构示意图

DNA-Protein

转录-翻译

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