pyscenic分析:视频教程

我们之前更新过pyscenic的教程:pySCENIC单细胞转录因子分析更新:数据库、软件更新。我们也说过,我们号是放弃R语言版的SCENIC的分析了,因为它比较耗费计算资源和时间,所以我们的单细胞转录因子分析教程都是基于pyscenic的分析进行的。有很多小伙伴反应,自己在实际操作过程中,总是报错,我猜测大多数是软件的问题。有些说想知道整个运行过程是怎么样的,所以我们出了这个视频教程,演示整个pyscenic的流程。当然,我们还介绍了docker镜像pyscenic分析。

单细胞转录因子的分析是需要利用服务器的:KS推荐:生信分析服务器。我们的这个视频从数据准备、软件安装、步骤分析、镜像分析等等方面,展示了pyscenic分析的过程,最终得到分析结果。

不知道什么原因,视频这里上传不成功,所以可从B站链接观看:

https://www.bilibili.com/video/BV1Yj411r7dE/?spm_id_from=333.999.0.0&vd_source=05b5479545ba945a8f5d7b2e7160ea34

pyscenic分析:视频教程_第1张图片

得到分析结果之后,那么后续的内容也就好办了,我们也写了很多的R语言版的分析和可视化,以及python版本的分析可视化。

PySCENIC(二):pyscenic单细胞转录组转录因子分析

PySCENIC(三):pyscenic单细胞转录因子分析可视化

PySCENIC(四):pyscenic结果之差异转录因子分析及其他可视化

pySCENIC单细胞转录因子分析更新:数据库、软件更新

pySCENIC单细胞转录因子分析更新(2):python版分析及可视化

pySCENIC可视化分析更新(3):python版可视化修改

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