生信豆芽菜-山峦图分析使用说明

网站：http://www.sxdyc.com/visualsRidges
一、山峦图简介
山峦图（Ridgeline plots），本质上是多个核密度曲线图的相互重叠组合，也可以看作是只有半个“小提琴”的横向小提琴图，主要用于展示和比较数据（比如基因的表达量、物种的丰度等）的分布情况。适用于各类常规实验、转录组、代谢组、蛋白组、微生物等丰度数据，可以用箱型图、小提琴图展示的数据都适用于山峦图。
二、使用方法
1.打开网址（http://www.sxdyc.com/singleCollectionTool?href-diff），选择“山峦图”

2. 准备数据:可以是两列也可以是多列数据，第一列为样本名，该名称要与后面的分组的样本名对应，后面可以是基因表达量（也就是我们想要展示某一个特征的数值）
   

3. 一个样本分组信息，数据格式用为txt文本，以制表符分割
   

4. 输入x轴的标签、分组的颜色（这里需要注意的是，有几个分组选几个颜色），图片的宽度和高度自行设置
   如果是只有一列特征，则分面（选择no），展示plot个数/列（每一列plot的个数为1）。
   如果是多个特征，可以选择分面（yes），分面后的数据，显示的就是每一个特征的表达图，也可以选择分面（no），显示的就是所有特征综合表达图
   

5. 输入分析队列名，点击提交，等待完成，查看结果
   同样的一组数据，我们看一下分面yes/no的结果
   
   
   
   

当然，如果不清楚数据是什么样的，可以选择下载我们的示例数据，也可以关注：豆芽数据分析