常用生物信息学在线分析工具汇总(记录中...)

数据库

NCBI主站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
拟南芥：https://www.arabidopsis.org/
AmiGO2
STRING
Pham

序列比对、寻找同源蛋白、基因

BLAST：https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi

获得蛋白氨基酸含量、等电点等参数

ProParam：https://us.expasy.org/tools/protparam.html

蛋白疏水性分析

ProScale：http://expasy.org/cgi-bin/protscale.pl/

蛋白跨膜区分析

TMHMM2.0：http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM-2.0/

TMPred：http://www.ch.embnet.org/software/TMPRED_form.html

蛋白信号肽分析（预测蛋白在细胞中的位置）

PSORT：http://psort.hgc.jp//

蛋白结构域(motif)分析

Prosite：http://www.expasy.org/prosite/

ProScan：http://www.ebi.ac.uk/InterProScan/

SMART：http://smart.embl-heidelberg.de/#

MEME：http://meme-suite.org/tools/meme

蛋白二级结构预测

SOMPA：http://npsa-pbil.ibcp.fr/cgi-bin/npsa_automat.pl?page=/NPSA/npsa_sopma.html

蛋白三级结构预测

SWISS-MODEL：http://swissmodel.expasy.org/