《圣何塞谋杀案》讲述的是郑秀文饰演的玲姐和佟大为饰演的孙宁在美国圣何塞如何生活的故事。
故事采用倒叙，插叙的手法，在现在生活中不时的插入自己的回忆和过去，让故事逐渐恢复它的始末和原貌。
你会发现看似幸福和美的婚姻生活背后却藏匿着一个惊心动魄的谋杀案。
这一切看起来好像是从玲姐的闺蜜，也就是蔡卓妍饰演的阿欣的到访开始。她和孙宁5天不到就处出了暧昧关系。
孙宁是爱自己的老婆的。因为这份爱，他和她的阿玲丈夫阿邓扭打在一起，最后深受重伤的时候，他居然想为阿玲扛下一切。只是他不知道的是，这一切都是阿玲计划好了的。
阿玲思维缜密、善筹谋、控制欲强、神经质。
她和前夫搬往圣何塞前特地给孙宁一笔钱，深吻他的颈项。离别的时候什么话也不说，但从神情和步伐上暗示孙宁我要走了，我同意放弃你。
前一天，孙宁还气势汹汹的说要分手，说自己只是偷渡到美国来的，他一无所有、养活不了她，他知道阿玲是有夫之妇，虽然过得不好，和丈夫没有感情，但他又能有什么办法呢？还不如放手，各走各的路。
可当阿玲，不哭不闹，真的离开他的时候，他内心又不舍得了。
这都是阿玲早有预料的。她用爱和温情，还有钱——控制着孙宁的情绪和情感。
孙宁果然追随她到了圣何塞。那个谁都不太认识他们三个人的地方。阿玲就开始了她谋杀亲父夫的计划。阿玲曾经向阿邓诉说过她的诉求：她想要爱情（自由）。就如同张东升在停车场问他的妻子：我还有机会吗？
阿邓是怎么说的：如果离婚，除了绿卡，你什么也得不到。
娶她只是希望有个人可以照顾自己残疾和痴呆症的母亲。至于爱，他说：爱你，才会娶你啊。
可这份爱，让阿玲恐惧、窒息。因为精心照顾阿邓的母亲，他们不能有小孩，阿玲也不能工作和长时间外出。阿邓控制着她的情爱和自由。
阿玲起初对孙宁的示爱是抗拒的。只是炙热的爱，最终还是将她点燃，让她觉得自己无望的生活还是有一个光亮的出口的，于是她飞蛾扑火、孤注一掷地策划了一场谋杀。
她笃定了，利用孙宁对她的爱和同情，用她癫狂的情绪和哭泣的乞求，让孙宁帮她隐瞒。
孙宁相信她。当时，他真的相信这个可怜的他深爱的女人。
孙宁重伤以后，阿玲用尽全力地凭自己一己之力埋葬了前夫的尸体，那具她一刀从后背刺穿的尸体。
之后她和孙宁就神不知鬼不觉地过起了幸福的夫妻生活。在阿玲的安排下，孙宁这个偷渡客有了新的身份——阿玲的丈夫，阿邓。
别忘了，他们刚刚搬来圣何塞，谁都不太认识他们。他们可以重新开始。
现在情况反转了过来，阿玲出去工作，而孙宁被留在家里。阿玲每天写很多便利贴，要孙宁做着做那。她在后花园埋葬阿邓尸体的地方种满了玫瑰，玫瑰长得很好。
为情所伤的阿欣来找玲姐。
她不知道这看似光鲜的玲姐和他的老公也过得如履薄冰。更可悲的是，他们根本不能全力以赴地去生活。阿玲谨慎的性格注定让她日夜活在担惊受怕的日子里。尽管工作累，她也不请工人帮她料理后花园和家务事。尽管孙宁一直想要谋求事业的发展，却一次次的阻扰他去尝试。
她就好像她死去的丈夫阿邓一样，控制着孙宁，让孙宁好好呆在家里，照顾他们的后花园，照顾即将出生的他们的孩子。她知道，阿邓是孙宁的假身份，一切都得小心谨慎为好。
所以阿玲所说的：我做的一切都是为了你！
孙宁不明白。他痛苦，他对她的爱在这些年阿玲的监视、监控和自由的束缚里已经消磨殆尽。
如今，他想要自由。
这一切阿玲是阿玲意想不到的。她以为一切都向她筹谋的那样，她可以重新开始。
所以，她指着阿欣问孙宁说：难道是因为阿欣，所以你对我变心了。
孙宁在目睹了阿玲刻意设计黄太太烫伤的心机以后，他离家了几天，他去看了养老院里阿邓的痴呆症母亲。他终于想清楚了。原来一直一来都是一场骗局。阿玲，这个可怕的女人，一步步的设计自己，所谓的重新开始，是她自己的重新开始，而自己却沦为了她新生活的牺牲品，成为阿邓的陪葬。
他忍无可忍，回来告诉阿欣他不是真的阿邓，告诉阿欣阿玲杀了阿邓，他想说服阿欣和他一起像干掉阿邓一样去干掉阿玲。
阿欣看着像疯了一样的孙宁，疯狂的逃跑，却被孙宁从后面拖住。
从外面回来的阿玲目睹了这一切。她呐喊着：没有人比我更爱你！
孙宁却大声的控诉：你最爱的是你自己！
他打伤了阿玲，️又去袭击不配合他、知道真相的阿欣。
在最紧要的时刻，最初送阿欣到玲姐家的司机折返回来，一枪将孙宁击毙。
故事结束了。阿欣看着司机给他送过来的蓝色盒子，里面装的都是阿欣的可爱玩偶。阿欣悲伤的哭了。
若干年后，阿玲去美国圣何塞看望监狱里的玲姐，阿欣关心玲姐也心疼玲姐。
她们小的时候就已经认识。那时，只要阿欣不高兴，玲姐就会递给阿欣大白兔奶糖。玲姐现在告诉她说：我有低血糖。大白兔奶糖是你的糖，却是我随身携带的药。
这是一个女人为了让自己过上自己想要的生活而设计的一场谋杀。可最终她还是失去了所有。
人终究不能凭借什么去完全控制住另一个人，暴力、威胁、诱惑、情感都抵不过另一个人自我的力量。
忠于自我，尊重他人，是唯一与人和谐共处、奔赴自由的前提。
这么说来，杀死丈夫阿邓的不是玲姐，是阿邓自己。