零代码合并TCGA表达谱数据

前面给大家介绍了☞如何使用R代码来合并TCGA数据库下载得到的RNAseq和miRNA seq的表达谱数据☜。没有太多R基础的小伙伴可能觉得理解起来和操作起来都有些困难。我就想得到一个表达矩阵,为什么这么难?既然你只关心结果,而不太注重过程。那么小编就给你做一个“黑盒子”,你不需要知道里面是什么,我给你输入,你给我输出就可以了。

这个“黑盒子”就是前面我给大家介绍过的☞Shiny-R语言轻松开发交互式web应用☜。其实他也并非是一个黑盒子,你要真想一探究竟,也是可以轻松找到源代码的,其实就跟我们在☞如何使用R代码来合并TCGA数据库下载得到的RNAseq和miRNA seq的表达谱数据☜使用的R代码是一样的,只是这里多了一个GUI(graphic user interface,图形用户界面),鼠标点一点就可以轻松得到合并之后的表达矩阵了。对于实用主义者,那就just do it。

界面是这样的,比较简洁

使用起来也很傻瓜式,鼠标选择相应的参数。合并好的表达矩阵就会展现在右边,点击下面的download按钮就可以将结果保存到本地。是不是很方便。

我们可以得到,sample type文件,方便后面做差异表达分析。

当然最重要就是表达矩阵文件

为了方便大家理解和使用这个工具,我特地录制了一个教学视频
☞零代码合并TCGA表达谱数据☜

工具的下载地址如下☟☟☟

零代码合并TCGA表达谱数据

参考资料

  1. 如何使用R代码来合并TCGA的表达谱数据
  2. Shiny-R语言轻松开发交互式web应用
  3. 如何从TCGA数据库下载RNAseq数据以及临床信息(一)
  4. 如何从TCGA数据库下载miRNA数据(二)
  5. TCGA视频合集

你可能感兴趣的:(零代码合并TCGA表达谱数据)