学习小组day3笔记--lee

Linux安装软件

下载miniconda，安装 搜索 卸载软件都在这里

查看是否有bzip2

bzip2

我用阿里云没有需要自行下载bzip2

输入命令

yum install -y bzip2

安装成功

百度官网下载miniconda

python 64-bit

依次输入命令

cd biosoft 
wget 复制下载链接

下载成功

下载成功后开始安装miniconda

输入命令bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh进行安装

安装成功

安装成功后开始激活

#source ~/.bashrc
#conda

满屏信息说明成功

添加国内镜像代码粘贴复制即可

安装完成后开始初步使用

conda list查看所有软件列表
conda search fastqc 搜索软件fastqc
conda install fastqc -y 安装软件
conda remove fastqc -y卸载软件

conda 环境

这个对于以后要做数据分析的话 感觉是必备的
需要先看看conda有哪些环境然后建立新环境
conda info --envs
conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y
创建完毕再次查看conda info --envs

conda环境创建成功

激活新conda环境

source activate rna-seq

卸载某个软件

conda remove -n rna-seq fastqc -y

卸载整个环境

conda remove -n rna-seq --all

目前还不知道怎么退出新建环境状态 是直接关闭终端吗？
答：输入代码source deactivate rna-seq失活环境即可退出

大致学习内容

今天的学习感受到linux的强大，，而且真的需要反复练习才能记住阿，，太容易忘了，，