犹豫就会败北:简单思路如何正确把握

同样的思路,如果已经有人研究过,相信很多人会觉得自己再做相关研究肯定受到制约,至少发表的文章水平肯定没前一个高。其实不然,今年六月份有研究人员分析了ITGA和ITGB家族在卵巢癌中的预后价值(IF:4.175),然而今天这篇文章的作者在十月份的时候发表了类似的研究成果。相比之下,作者只在胰腺癌中探索了ITGB的预后价值,研究的基因集少了,杂志水平却高了不少。如果你还在担心自己的研究和别人只差了疾病类型,今天的文章值得你一看。

文章十月份发表在JOURNAL OF CELLULAR AND MOLECULAR MEDICINE(IF:4.486 )


ITGB超家族成员在胰腺癌中的预后和肿瘤学价值的表征

ITGB超家族成员在胰腺癌中的预后和肿瘤学价值的表征

一、摘要:

整联蛋白β(ITGB)超家族成员在各种癌症的多种生物学功能中起着重要作用。但是,ITGB超家族成员的预后和肿瘤学价值尚未在胰腺癌(PC)中进行系统研究。本研究通过生物信息学分析评估了PC中ITGB超家族成员的mRNA表达和生物学功能。识别了具有预后预测性能的特征基因和CpG位点以及与之密切相关的转录因子。

二、材料方法:

TCGA胰腺癌表达数据,甲基化数据;ICGC与GEO表达数据。

单因素cox、多因素cox、转录因子调控网络、TME

三、结果:

1.不同数据集中,ITGB家族基因显著过表达

图1.ITGB家族成员差异表达分析

2.ITGB超家族成员在不同AJCC分期,组织学分级之间表达显著差异

图2.ITGB超家族成员在AJCC分期和组织学分级中的表达

3.胰腺癌中ITGB超家族成员的预后价值

图3.预后相关的ITGB超家族成员(ITGB1,ITGB4,ITGB5和ITGB6)的KM生存曲线
图4.基于ITGB1,ITGB4,ITGB5和ITGB6的预后签名及验证

4.ITGB1,ITGB4,ITGB5和ITGB6启动子区域的DNA甲基化分析,识别预后相关CpG位点

图5.启动子区域中与预后相关的CpG的KM生存曲线

5.IGTB1,ITGB4,ITGB5和ITGB6转录因子的预测识别预后相关转录因子

图6.预测ITGB1,ITGB4,ITGB5和ITGB6的转录因子

6.ITGB1,ITGB4,ITGB5和ITGB6的功能丰富分析

图7.ITGB1,ITGB4,ITGB5和ITGB6的功能分析

7.ITGB1,ITGB5和ITGB6过表达与免疫抑制相关

图8.高风险组和低风险组之间免疫相关差异

总结:

总的来说,文章基于一个基因家族,分析在胰腺癌中的预后效能,探索潜在的预后CpG和TF,纳入了TME。乍一看,和之前卵巢癌分析基因家族的预后效能文章类似,但是最后发表的杂志影响因子反而高了一点。虽说与之相比只研究了其中的ITGB,但是相应的增加了甲基化和TME,内容增加了部分,因此不仅顺利发表,并且杂志水平不降反升。

这类研究思路其实需要担心的不是所谓的“雷同”导致无法发表,而是需要担心能不能比别人更快的做出结果。因为两三个月的时间,也许你还在犹豫要不要做,别人已经投稿了。幸运的是,我们有更全面的分析,同样有更快的速度!

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