学习小组Day3笔记--李斯亭

今天主要linux学习安装软件：

Day3思维导图

准备工作

• 安装bzip
• conda是linux系统的app store

安装miniconda

mkdir biosoft
cd biosoft
wget https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

• 添加镜像

使用miniconda

• 查看、搜索

conda list
conda search NAME

• 安装、卸载

conda install NAME -y
conda remove NAME -y

conda环境

• 查看环境

conda info --envs

• 新建环境
  建立一个名叫rnaseq的conda环境，然后指定python版本是3，安装软件fastqc、trimmomatic：

conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y

• 激活与退出

conda activate rna-seq
conda deactivate

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