spark篇(一)——Spark核心概念与操作

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1Spark核心概念与操作

1.1Spark简介

Apache Spark是新兴的一种快速通用的大规模数据处理引擎。它的优势有三个方面:

  • 通用计算引擎 能够运行MapReduce、数据挖掘、图运算、流式计算、SQL等多种框架;
  • 基于内存 数据可缓存在内存中,特别适用于需要迭代多次运算的场景;
  • 与Hadoop集成 能够直接读写HDFS中的数据,并能运行在YARN之上。

Spark是用Scala语言编写的,所提供的API也很好地利用了这门语言的特性,当然作为数据科学的一环,它也可以使用Java和Python编写应用。这里我们将用Python给大家做讲解。

1.2Spark核心

Spark支持多种运行模式。单机部署下,既可以用本地(Local)模式运行,也可以使用伪分布式模式来运行;当以分布式集群部署的时候,可以根据实际情况选择Spark自带的独立(Standalone)运行模式、YARN运行模式或者Mesos模式。虽然模式多,但是Spark的运行架构基本由三部分组成,包括SparkContext(驱动程序)ClusterManager(集群资源管理器)Executor(任务执行进程)

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  • SparkContext提交作业,向ClusterManager申请资源;
  • ClusterManager会根据当前集群的资源使用情况,进行有条件的FIFO策略:先分配的应用程序尽可能多地获取资源,后分配的应用程序则在剩余资源中筛选,没有合适资源的应用程序只能等待其他应用程序释放资源;
  • ClusterManager默认情况下会将应用程序分布在尽可能多的Worker上,这种分配算法有利于充分利用集群资源,适合内存使用多的场景,以便更好地做到数据处理的本地性;另一种则是分布在尽可能少的Worker上,这种适合CPU密集型且内存使用较少的场景;
  • Excutor创建后与SparkContext保持通讯,SparkContext分配任务集给Excutor,Excutor按照一定的调度策略执行任务集。

Spark包含1个driver(笔记本电脑或者集群网关机器上)和若干个executor(在各个节点上),通过SparkContext(简称sc)连接Spark集群创建RDD累加器(accumlator)广播变量(broadcast variables),简单可以认为SparkContext(驱动程序)是Spark程序的根本。

Driver会把计算任务分成一系列小的task,然后送到executor执行。executor之间可以通信,在每个executor完成自己的task以后,所有的信息会被传回。

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1.3 RDD(弹性分布式数据集)介绍

在Spark里,所有的处理和计算任务都会被组织成一系列 Resilient Distributed Dataset(弹性分布式数据集,简称RDD)上的transformations(转换)actions(动作)

RDD是一个包含诸多元素、被划分到不同节点上进行并行处理的数据集合,可以将RDD持久化到内存中,这样就可以有效地在并行操作中复用(在机器学习这种需要反复迭代的任务中非常有效)。在节点发生错误时RDD也可以自动恢复。

说起来,RDD就像一个NumPy array或者一个Pandas Series,可以视作一个有序的item集合。
只不过这些item并不存在driver端的内存里,而是被分割成很多个partitions,每个partition的数据存在集群的executor的内存中。
RDD是最重要的载体,我们看看如何初始化这么一个对象:

1.3.1初始化RDD方法1

如果你本地内存中已经有一份序列数据(比如python的list),你可以通过sc.parallelize去初始化一个RDD
当你执行这个操作以后,list中的元素将被自动分块(partitioned),并且把每一块送到集群上的不同机器上。

import pyspark
from pyspark import SparkContext
from pyspark import SparkConf
conf=SparkConf().setAppName("miniProject").setMaster("local[*]")
sc=SparkContext.getOrCreate(conf)

my_list = [1,2,3,4,5] #存放在当前环境内存当中的list
#rdd是一个对象,看不到它的内容,他是一个弹性分布的数据集,已经被分发到不同的服务器上了。要看到全部的数据需要把数据收回来
rdd = sc.parallelize(my_list)
rdd
输出结果:

ParallelCollectionRDD[0] at parallelize at PythonRDD.scala:475

rdd.getNumPartitions()
输出结果:

4

如果你想看看分区状况怎么办

collect()这个函数需要慎用,collect是将所有的数据收回本地。

rdd.glom().collect()
输出结果:

[[1], [2], [3], [4, 5]]

在这个例子中,是一个4-core的CPU笔记本
Spark创建了4个executor,然后把数据分成4个块。

Tips:使用sc.parallelize,你可以把Python list,NumPy array或者Pandas Series、Pandas DataFrame转成Spark RDD

1.3.2初始化RDD方法2

第2种方式当然是直接把文本读到RDD了
你的每一行都会被当做一个item,不过需要注意的一点是,Spark一般默认你的路径是指向HDFS的,如果你要从本地读取文件的话,给一个file://开头的全局路径。

!head -5 ./names/yob1880.txt
输出结果:
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# Record current path for future use
import os
cwd = os.getcwd()
cwd
输出结果:

'/home/ds/notebooks/spark'

# File from Pandas exercises
rdd = sc.textFile("file://" + cwd + "/names/yob1880.txt")
rdd
输出结果:

file:///home/ds/notebooks/spark/names/yob1880.txt MapPartitionsRDD[3] at textFile at NativeMethodAccessorImpl.java:-2

rdd.first()

你甚至可以很粗暴地读入整个文件夹的所有文件。

但是要特别注意,这种读法,RDD中的每个item实际上是一个形如(文件名,文件所有内容)的元组。

咱们来试着读一读所有的文件

rdd = sc.wholeTextFiles("file://" + cwd + "/names")
rdd
输出结果:

org.apache.spark.api.java.JavaPairRDD@6b954745

rdd.first()
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1.3.3 其余初始化RDD的方法

RDD还可以通过其他方式初始化,包括

  • HDFS上的文件
  • Hive中的数据库与表
  • Spark SQL得到的结果

1.4 RDD transformations 和 actions

RDDs可以进行一系列的变换得到新的RDD,有点类似那个过程,我们先给大家提一下RDD上最最常用到的transformation:

  • map() 对RDD的每一个item都执行同一个操作
  • flatMap() 对RDD中的item执行同一个操作以后得到一个list,然后以平铺的方式把这些list里所有的结果组成新的list
  • filter() 筛选出来满足条件的item
  • distinct() 对RDD中的item去重
  • sample() 从RDD中的item中采样一部分出来,有放回或者无放回
  • sortBy() 对RDD中的item进行排序

如果你想看操作后的结果,可以用一个叫做collect()action把所有的item转成一个Python list。

简单例子如下:

numbersRDD = sc.parallelize(range(1,11))
print(numbersRDD.collect())

squaresRDD = numbersRDD.map(lambda x: x**2)  # 1进1出
print(squaresRDD.collect())

filteredRDD = numbersRDD.filter(lambda x: x % 2 == 0)  # Only the evens
print(filteredRDD.collect())
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然后咱们看看flatMap()的平展功能:

sentencesRDD = sc.parallelize(['Hello world', 'My name is Patrick'])
wordsRDD = sentencesRDD.flatMap(lambda sentence: sentence.split(" "))
print(wordsRDD.collect())
print(wordsRDD.count())
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为了做一个小小的对应,咱们看看python里对应的操作大概是什么样的:

l = ['Hello world', 'My name is Patrick']
ll = []
for sentence in l:
    ll = ll + sentence.split(" ")
ll
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比较炫酷的是,前面提到的Transformation,可以一个接一个地串联,比如:

# [1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10]
def doubleIfOdd(x):
    if x % 2 == 1:
        return 2 * x
    else:
        return x

resultRDD = (numbersRDD           # In parentheses so we can write each
             .map(doubleIfOdd)    # transformation in one line
             .filter(lambda x: x > 6)
             .distinct())

resultRDD.collect()
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1.5RDD间的操作

如果你手头上有2个RDD了,下面的这些操作能够帮你对他们以个种方式组合得到1个RDD:

  • rdd1.union(rdd2): 所有rdd1rdd2中的item组合
  • rdd1.intersection(rdd2): rdd1rdd2的交集
  • rdd1.substract(rdd2): 所有在rdd1中但不在rdd2中的item(差集)
  • rdd1.cartesian(rdd2): rdd1rdd2中所有的元素笛卡尔乘积

简单例子如下

numbersRDD = sc.parallelize([1,2,3])
moreNumbersRDD = sc.parallelize([2,3,4])
numbersRDD.union(moreNumbersRDD).collect()
输出结果:
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numbersRDD.intersection(moreNumbersRDD).collect()
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numbersRDD.subtract(moreNumbersRDD).collect()
numbersRDD.cartesian(moreNumbersRDD).collect()
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特别注意:Spark的一个核心概念是惰性计算。当你把一个RDD转换成另一个的时候,这个转换不会立即生效执行!!!
Spark会把它先记在心里,等到真的需要拿到转换结果的时候,才会重新组织你的transformations(因为可能有一连串的变换)

这样可以避免不必要的中间结果存储和通信。

刚才提到了惰性计算,那么什么东西能让它真的执行转换与运算呢?
是的,就是我们马上提到的Actions,下面是常见的action,当他们出现的时候,表明我们需要执行刚才定义的transform了:

  • collect(): 计算所有的items并返回所有的结果到driver端,接着 collect()会以Python list的形式返回结果
  • first(): 和上面是类似的,不过只返回第1个item
  • take(n): 类似,但是返回n个item
  • count(): 计算RDD中item的个数
  • top(n): 返回头n个items,按照自然结果排序
  • reduce(): 对RDD中的items做聚合

我们之前已经看过 collect(), first()count() 的例子了。 咱们看看 reduce() 如何使用。比如Spark里从1加到10你可以这么做

# [1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10]
rdd = sc.parallelize(range(1,10+1))
rdd.reduce(lambda x, y: x + y)

如果你想了解一下reduce的细节的话,其实可能会先在每个分区(partition)里完成reduce操作,然后再全局地进行reduce。

这个过程你可以从如下的代码大致理解。

def f(x,y):
    return x + y

l = [1,2,3,4]
f(f(f(l[0],l[1]), l[2]), l[3])
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有一个很有用的操作,我们试想一下,有时候我们需要重复用到某个transform序列得到的RDD结果。但是一遍遍重复计算显然是要开销的,所以我们可以通过一个叫做cache()的操作把它暂时地存储在内存中:

# Calculate the average of all the squares from 1 to 10
import numpy as np
numbersRDD = sc.parallelize(np.linspace(1.0, 10.0, 10))
squaresRDD = numbersRDD.map(lambda x: x**2)

squaresRDD.cache()  # Preserve the actual items of this RDD in memory

avg = squaresRDD.reduce(lambda x, y: x + y) / squaresRDD.count()
print(avg)

缓存RDD结果对于重复迭代的操作非常有用,比如很多机器学习的算法,训练过程需要重复迭代。

1.6针对更复杂结构的transformations和actions

咱们刚才已经见识到了Spark中最常见的transform和action,但是有时候我们会遇到更复杂的结构,比如非常非常经典的是以元组形式组织的k-v对(key, value)

我们把它叫做pair RDDs,而Sark中针对这种item结构的数据,定义了一些transformation和action:

  • reduceByKey(): 对所有有着相同key的items执行reduce操作
  • groupByKey(): 返回类似(key, listOfValues)元组的RDD,后面的value List 是同一个key下面的
  • sortByKey(): 按照key排序
  • countByKey(): 按照key去对item个数进行统计
  • collectAsMap(): 和collect有些类似,但是返回的是k-v的字典

以下是Spark中的一些例子

怎么说呢,统计这个案例算是分布式(hadoop/spark)相关知识中的“Hello World”

rdd = sc.parallelize(["Hello hello", "Hello New York", "York says hello"])
resultRDD = (
    rdd
    .flatMap(lambda sentence: sentence.split(" "))  # split into words
    .map(lambda word: word.lower())                 # lowercase
    .map(lambda word: (word, 1))                    # count each appearance
    .reduceByKey(lambda x, y: x + y)                # add counts for each word
)
resultRDD.collect()
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我们将结果以k-v字典的形式返回

result = resultRDD.collectAsMap()
result
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如果你想要出现频次最高的2个词,可以这么做:

print(resultRDD
      .sortBy(keyfunc=lambda (word, count): count, ascending=False)
      .take(2))
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