Jason数据分析生信教室

Windows10下挂Linux子系统做生信分析

废话不多说，步骤如下

开启母系统windows的WSL

PS C:\Windows\System32> Enable-WindowsOptionalFeature -Online -FeatureName Microsoft-Windows-Subsystem-Linux

然后会自动重启电脑

去windows商店下载ubuntu
在开始菜单里启动ubuntu,设置子系统的账号密码
设置ssh-server，让子系统上线

$ sudo ssh-keygen -A
ssh-keygen: generating new host keys: RSA DSA ECDSA ED25519
$
$ sudo service ssh start
 * Starting OpenBSD Secure Shell server sshd

查看/切换windows系统中的文件

cd /mnt/windows文件路径/

bioconda安装

curl -O https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
sh Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

运行sh文件，一路选择yes

设置bioconda通道

conda config --add channels defaults。
conda config --add channels bioconda  
conda config --add channels conda-forge

用conda安装工具包
比如说bwa

conda install bwa

以上
其实很简单

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