Windows10下挂Linux子系统做生信分析

废话不多说,步骤如下

  1. 开启母系统windows的WSL
PS C:\Windows\System32> Enable-WindowsOptionalFeature -Online -FeatureName Microsoft-Windows-Subsystem-Linux

然后会自动重启电脑

  1. 去windows商店下载ubuntu


  2. 在开始菜单里启动ubuntu,设置子系统的账号密码


  3. 设置ssh-server,让子系统上线

$ sudo ssh-keygen -A
ssh-keygen: generating new host keys: RSA DSA ECDSA ED25519
$
$ sudo service ssh start
 * Starting OpenBSD Secure Shell server sshd   
  1. 查看/切换windows系统中的文件
cd /mnt/windows文件路径/
  1. bioconda安装
curl -O https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
sh Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

运行sh文件,一路选择yes

  1. 设置bioconda通道
conda config --add channels defaults。
conda config --add channels bioconda  
conda config --add channels conda-forge  
  1. 用conda安装工具包
    比如说bwa
conda install bwa

以上
其实很简单

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