R语言【CoordinateCleaner】——cc_sea(): 移除或标记参考陆地之外的坐标。可用于将数据集限制为陆地分类群，或从公海中排除记录，具体取决于参考文献。

Package CoordinateCleaner version 2.0-20

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Parameters

cc_sea(
  x,
  lon = "decimallongitude",
  lat = "decimallatitude",
  ref = NULL,
  scale = 110,
  value = "clean",
  speedup = TRUE,
  verbose = TRUE
)

参数【x】：data.frame。包含地理坐标和物种名称。

参数【lon】：字符串。具有经度坐标的列。默认值 = “decimallongitude”。

参数【lat】：字符串。包含纬度坐标的列。默认值 = “decimallatitude”。

参数【ref】：一个 SpatialPolygonsDataFrame。提供地理地名录。可以是任何 SpatialPolygonsDataFrame，但结构必须与 rnaturalearth::ne_download(scale = 110, type = 'land', category = 'physical') 相同。默认值 = rnaturalearth::ne_download(scale = 110, type = 'land', category = 'physical')。

参数【scale】：默认参考的比例，从 Natural Earth 下载。必须是 10、50、110 之一。数字越高，细节就越多。默认值 = 110。

参数【value】：字符串。定义输出值。

参数【speedup】：逻辑值。使用启发式方法加快对每个位置具有许多记录的大型数据集的分析。

参数【verbose】：逻辑值。如果为 TRUE，则报告测试的名称和标记的记录数。详见 Value。

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Detail

在某些情况下，不建议标记海岸线附近的记录，因为参考数据集的精度低、GPS 不精确或数据集可能包含海岸或沼泽地物种。如果您只想标记公海中的记录，请考虑使用缓冲的陆地参考，例如：buffland。

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Value

根据参数【value】，包含测试认为正确的记录的 data.frame （“clean”） 或逻辑向量 （“flagged”），其中 TRUE = 测试通过，FALSE = 测试失败/可能有问题。默认值 = “clean”。

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Example

library(CoordinateCleaner)

x <- data.frame(species = letters[1:10], 
                decimallongitude = runif(10, -30, 30), 
                decimallatitude = runif(10, -30, 30))
                
cc_sea(x, value = "flagged")