- 科研绘图系列:R语言雷达图(radar plot)
生信学习者2
R语言可视化r语言数据可视化
介绍雷达图,又称为蜘蛛网图或星形图,是一种以多轴方式显示数据的图表。它通常用于显示多个定量变量的值,这些变量被表示为从中心点向外延伸的轴。每个轴代表一个变量,而每个变量的值则通过从中心向外延伸的距离来表示。雷达图可以直观地展示多个变量之间的相对大小和关系。雷达图的特点:多维数据比较:可以同时比较多个变量,看它们在不同维度上的表现。综合评价:用于综合评价一个或多个对象在多个方面的表现。趋势分析:可以
- 科研绘图系列:R语言饼图(pie chart)
生信学习者2
R语言可视化r语言数据可视化
介绍饼图是一种常用的数据可视化图表,它通过圆形的扇形区域来展示数据的比例关系。每个扇形的面积大小与其所代表的数据量成正比,从而直观地显示各部分在整体中所占的比重。特点:直观性:通过不同大小的扇形,可以直观地看到各个部分的相对大小。易于理解:圆形的分割使得人们容易理解各部分的相对比例。适合展示比例:特别适合展示各部分在整体中的比例关系。说明的问题:部分与整体的关系:显示每个部分在整体中所占的百分比。
- 科研绘图系列:R语言径向柱状图(Radial Bar Chart)
生信学习者2
R语言可视化r语言数据可视化
介绍径向柱状图(RadialBarChart),又称为雷达图或蜘蛛网图(SpiderChart),是一种在极坐标系中绘制的柱状图。这种图表的特点是将数据点沿着一个或多个从中心向外延伸的轴来展示,这些轴通常围绕着一个中心点均匀分布。特点:极坐标系统:数据点不是在直角坐标系中展示,而是在极坐标系中,围绕一个中心点。多维度数据展示:可以同时展示多个变量的数据,每个变量对应一个轴。视觉集中:所有数据点都围
- 科研绘图系列:R语言基础图形合集
生信学习者2
R语言可视化其他r语言
基础图形可视化数据分析的图形可视化是了解数据分布、波动和相关性等属性必不可少的手段。不同的图形类型对数据属性的表征各不相同,通常具体问题使用具体的可视化图形。R语言在可视化方面具有极大的优势,因其本身就是统计学家为了研究统计问题开发的编程语言,因此极力推荐使用R语言可视化数据。散点图散点图是由x值和y值确定的点散乱分布在坐标轴上,一是可以用来展示数据的分布和聚合情况,二是可通过分布情况得到x和y之
- 1区9+非肿瘤纯生信,逻辑清晰易懂,机器学习筛选关键基因的纯生信也可以发高水平期刊,抓紧上车!
生信小课堂
影响因子:9.186关于非肿瘤生信,我们也解读过很多,主要有以下类型1单个疾病WGCNA+PPI分析筛选hub基因。2单个疾病结合免疫浸润,热点基因集,机器学习算法等。3两种相关疾病联合分析,包括非肿瘤结合非肿瘤,非肿瘤结合肿瘤或者非肿瘤结合泛癌分析4基于分型的非肿瘤生信分析5单细胞结合普通转录组生信分析目前非肿瘤生信发文的门槛较低,有需要的朋友欢迎交流研究概述:本研究首先使用R语言在三个基因表达
- R语言基础-文档检索与环境配置-2019-06-29
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R帮助函数`help.start()`,打开帮助文档首页`help.search("foo")`或`??foo,`以foo为关键词搜索本地帮助文档,`?Startup`查看与R有关的启动文件信息;`example("foo")`,函数foo的使用示例(引号可以省略)`RSiteSearch("foo")`,以foo为关键词,查询整个http://search.r-project.org网站的包,例
- R语言 交互式绘图echarts4r包--3D深探
「已注销」
r语言可视化数据可视化可视化r语言开发语言
表面datadplyr::mutate(z=sin(x*x+y*y)*x/3.14)data|>e_charts(x)|>e_surface(y,z,wireframe=list(show=FALSE))|>e_visual_map(z)3维柱状图v<-LETTERS[1:10]matrix<-data.frame(x=sample(v,300,replace=
- 6章2节:认识birthwt数据集,EpiDisplay和Gmodels扩展包的应用
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用R探索医药数据科学r语言临床数据科学统计学数据科学birthwt数据集gmodels扩展包epiDisplay扩展包
在R语言的广泛应用领域中,数据集的选择与理解起着至关重要的作用。它既为学习R语言奠定了基础数据,又为我们开展统计分析和模型构建提供了强有力的支持。鉴于此前我们的众多案例以及未来的章节中都在很大程度上使用了birthwt数据集,在本节内容里,我们将对birthwt数据集进行深入探讨。与此同时,向大家介绍R语言的epiDisplay扩展包。此包堪称功能强大的工具,主要用于流行病学数据的描述性分析与可视
- 跟着Cell学单细胞转录组分析(十二):转录因子分析
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转录因子分析可以了解细胞异质性背后的基因调控网络的异质性。转录因子分析也是单细胞转录组常见的分析内容,R语言分析一般采用的是SCENIC包,具体原理可参考两篇文章。1、《SCENIC:single-cellregulatorynetworkinferenceandclustering》。2、《AscalableSCENICworkflowforsingle-cellgeneregulatoryne
- 在B站看到有人提问说安东尼戴维斯的数据比邓肯好,画个图来比较下
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作为R语言数据可视化爱好者,当然得找到邓肯和安东尼戴维斯的数据来可视化比较一番了数据来源https://www.basketball-reference.com/今年是安东尼戴维斯的第10个赛季,赛季刚刚开始,因此这个赛季的数据不纳入比较,选择前9个赛季的数据,邓肯也用前9个赛季的数据数据下载好了存储到csv文件里读取数据AD%ggplot(aes(x=x,y=y))+geom_col(aes(f
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代码的写法,参考来源是这本书:MachineLearningwithR,2ndEdition.pdf相关的资源我已经上传了,包括代码,数据,以及这行本书。下载链接–免积分下载。https://download.csdn.net/download/waterHBO/896756871.第一个例子,代码和过程,全部来自书上#我根据书中第三章KNN的内容来做的。#第3章,KNN,K-NearestNei
- 明天开课 | R语言专题班(直播:2023.6.17~6.21)
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茗创科技专注于脑科学,涵盖(EEG/ERP,fMRI,结构像,DTI,ASL,FNIRS)等,欢迎留言讨论及转发推荐,也欢迎了解茗创科技的脑科学课程,数据处理服务及脑科学工作站销售业务,可添加我们的工程师(微信号MCKJ-zhouyi或17373158786)咨询。★课程简介★R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件,它是一个用于统计计算和统计制
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- R 语言学习教程,从入门到精通,R 绘图饼图(22)
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1、R绘图饼图R语言提供来大量的库来实现绘图功能。饼图,或称饼状图,是一个划分为几个扇形的圆形统计图表,用于描述量、频率或百分比之间的相对关系。R语言使用pie()函数来实现饼图,语法格式如下:pie(x,labels=names(x),edges=200,radius=0.8,clockwise=FALSE,init.angle=if(clockwise)90else0,density=NULL
- R语言dplyr过滤指定字符的行
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过滤df数据框中,Class列中,含有字符"a",“b”,"c"的行df1%filter(Class%in%c("a","b","c"))
- R语言中theme的调整技巧汇总-持续更新
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1.如何扩充图片的上右下左位置的空白区域:unit(c(1.1,1,0.4,0.5),“cm”)表示使用厘米作为单位设置各个方向的边距,c(1.1,1,0.4,0.5)对应的顺序是:上、右、下、左。theme(plot.margin=unit(c(1.1,1,0.4,0.5),"cm"))#增加上方的空白2.如何调整图例中tick的颜色#修改图例的刻度颜色p1<-p1+guides(fill=gu
- R语言代码中文乱码解决方法尝试
月亮月亮要去太阳
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一、Rstudio相关设置改成UTF-8【Tools→GlobalOptions→Defaulttextencoding】二、Rstudio:File→Reopenwithencoding→选择UTF-8三、数据文本要更改为UTF-8编码,工具notepad++,操作:Encoding→ConverttoUTF-8,保存,参考四、读取数据时,在read.csv或其他读取函数中,添加读取文件编码的参
- R 语言学习教程,从入门到精通,R MySQL 连接使用(21)
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1、RMySQL连接MySQL是最流行的关系型数据库管理系统,在WEB应用方面MySQL是最好的RDBMS(RelationalDatabaseManagementSystem:关系数据库管理系统)应用软件之一。R语言读写MySQL文件需要安装扩展包,我们可以在R到控制台输入以下命令来安装:install.packages("RMySQL",repos="https://mirrors.ustc.
- 科研绘图系列:R语言多分组箱线图(grouped boxplot)
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R语言可视化r语言开发语言
介绍分组箱线图(GroupedBoxplot)是一种用于展示不同组别数据分布情况的统计图表。它将箱线图(Boxplot)按照不同的类别或组别进行分组,使得可以同时比较多个组别的数据特征。箱线图本身是一种标准化的显示数据分布的方法,它能够展示数据的中位数、四分位数以及异常值。箱线图的主要元素包括:中位数线:箱线图中的中位数值,表示数据的中心位置。上四分位数箱线:从上四分位数到中位数的区域。下四分位数
- R语言使用caret包构建xgboost模型(xgbLinear算法)构建回归模型实战、通过method参数指定算法名称、通过trainControl函数控制训练过程
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R语言入门课算法r语言回归机器学习数据挖掘
R语言使用caret包构建xgboost模型(xgbLinear算法)构建回归模型实战、通过method参数指定算法名称、通过trainControl函数控制训练过程目录R语言使用caret包构建xgboost模型(xgbLinear算法)构建回归模型、通过method参数指定算法名称、通过trainControl函数控制训练过程#导入包和库#仿真数据#R语言使用caret包构建xgboost模型
- 基于R语言遥感随机森林建模与空间预测
weixin_贾
统计语言类模型分布式
随机森林作为一种集成学习方法,在处理复杂数据分析任务中特别是遥感数据分析中表现出色。通过构建大量的决策树并引入随机性,随机森林在降低模型方差和过拟合风险方面具有显著优势。在训练过程中,使用Bootstrap抽样生成不同的训练集,并在节点分裂时随机选择特征子集,这使得模型具备了处理高维和非线性数据的能力。随机森林对噪声和异常值具有鲁棒性,其预测结果通过对多棵树的集成投票或平均获得,减少了单个异常对结
- R语言microeco:一个用于微生物群落生态学数据挖掘的R包(构建microeco对象。
还是要前进啊
R语言r语言数据挖掘
我以前写过临床微生物组的文章,其中数据分析用过microeco包,在这里,将我学到的资源分享给大家。R语言microeco:一个用于微生物群落生态学数据挖掘的R包。主要功能R6类;分类群丰度图,维恩图,Alpha多样性,Beta多样性,差异丰度分析,环境数据分析,零模型分析,网络分析,功能分析。install.packages("microeco")library(microeco)library
- 机器学习简介
Dayueban
@我的博客:有味写在前面在年前将要进行靶向代谢组学测定的样品送去公司,随之想想,还有一个半月的时间数据才会回来,那么这段时间是不是可以先学习下分类数据如何分析呢(PS:因为数据是属于分类性质的),所以不久前买的一本书——《机器学习与R语言》稍微系统学一遍,该书为美国的BrettLantz所著,翻译工作由我国学者李洪成、许金炜、李舰完成。学习本书的主要目的是了解机器学习的思想,以及所应用的领域,当然
- R语言安装包tidyverse时,报Error: package or namespace load failed for ‘tidyverse’ 错误
石榴花专场
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R语言再安装tidyverse包时,宝如下的错误:>library(tidyverse)#操作Error:packageornamespaceloadfailedfor‘tidyverse’inlibrary.dynam(lib,package,package.lib):没有这个DLL‘haven’:是不是没有为此架构安装提示为缺少haven包,则使用install和library安装haven包
- R语言及其开发环境简介
luohaha66
R常规r语言
R语言及其开发环境简介R语言历史R语言来自S语言,是S语言的一个变种。S语言由贝尔实验室研究开发,著名的C语言、Unix系统也是贝尔实验室开发的。R属于GNU开源软件,最初发布于1997年,实现了与S语言基本相同的功能和统计功能。现在由R核心团队开发,全世界的用户都可以向其贡献软件包。R语言使用人员为数学研究工作者设计的一种数学编程语言,主要用于统计分析、绘图、数据挖掘。R语言特点一种解释型的面向
- R语言统计学书记推荐
热衷组培的二货潜
https://learningstatisticswithr.com/lsr-0.6.pdf图片发自App
- 跟着Nature Communications学作图:R语言ggplot2绘制带有条纹的分组柱形图
小明的数据分析笔记本
论文Pan-Africangenomedemonstrateshowpopulation-specificgenomegraphsimprovehigh-throughputsequencingdataanalysishttps://www.nature.com/articles/s41467-022-31724-3本地pdfs41467-022-31724-3.pdf论文中公布了大部分图的数据,
- python可以构建sem模型_结构方程模型(SEM)可用于微生态研究及R语言实现
weixin_39650139
python可以构建sem模型
导读结构方程模型(StructuralEquationModeling,SEM)是一种能基于变量之间的协方差矩阵分析多变量之间结构关系的多元统计分析方法,也被称为协方差结构模型。该方法是因子分析和多元回归分析的结合,可用于分析被测变量与潜在变量之间的结构关系,替代多重回归、通径分析、因子分析、协方差分析等分析方法。结构方程模型能在一次分析中估计多个相互关联的变量之间的依赖关系而受到研究者的青睐。早
- 多轨迹建模方法的介绍与实操-基于R语言
做自己的探路者
统计机器学习人工智能
本文介绍了多轨迹建模方法(Group-BasedMultivariateTrajectoryModeling),这是一种扩展了单指标组基轨迹建模的技术,用于分析多个疾病生物标志物或临床重要因素的联合轨迹,以更好地理解和追踪疾病进程、行为或健康状态的变化。多轨迹建模利用有限混合模型,识别出遵循相似多指标轨迹的个体群体。这种方法克服了传统统计分析在处理多变量纵向数据时的局限性,允许同时分析多个相关指标
- ztree设置禁用节点
3213213333332132
JavaScriptztreejsonsetDisabledNodeAjax
ztree设置禁用节点的时候注意,当使用ajax后台请求数据,必须要设置为同步获取数据,否者会获取不到节点对象,导致设置禁用没有效果。
$(function(){
showTree();
setDisabledNode();
});
- JVM patch by Taobao
bookjovi
javaHotSpot
在网上无意中看到淘宝提交的hotspot patch,共四个,有意思,记录一下。
7050685:jsdbproc64.sh has a typo in the package name
7058036:FieldsAllocationStyle=2 does not work in 32-bit VM
7060619:C1 should respect inline and
- 将session存储到数据库中
dcj3sjt126com
sqlPHPsession
CREATE TABLE sessions (
id CHAR(32) NOT NULL,
data TEXT,
last_accessed TIMESTAMP NOT NULL,
PRIMARY KEY (id)
);
<?php
/**
* Created by PhpStorm.
* User: michaeldu
* Date
- Vector
171815164
vector
public Vector<CartProduct> delCart(Vector<CartProduct> cart, String id) {
for (int i = 0; i < cart.size(); i++) {
if (cart.get(i).getId().equals(id)) {
cart.remove(i);
- 各连接池配置参数比较
g21121
连接池
排版真心费劲,大家凑合看下吧,见谅~
Druid
DBCP
C3P0
Proxool
数据库用户名称 Username Username User
数据库密码 Password Password Password
驱动名
- [简单]mybatis insert语句添加动态字段
53873039oycg
mybatis
mysql数据库,id自增,配置如下:
<insert id="saveTestTb" useGeneratedKeys="true" keyProperty="id"
parameterType=&
- struts2拦截器配置
云端月影
struts2拦截器
struts2拦截器interceptor的三种配置方法
方法1. 普通配置法
<struts>
<package name="struts2" extends="struts-default">
&
- IE中页面不居中,火狐谷歌等正常
aijuans
IE中页面不居中
问题是首页在火狐、谷歌、所有IE中正常显示,列表页的页面在火狐谷歌中正常,在IE6、7、8中都不中,觉得可能那个地方设置的让IE系列都不认识,仔细查看后发现,列表页中没写HTML模板部分没有添加DTD定义,就是<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3
- String,int,Integer,char 几个类型常见转换
antonyup_2006
htmlsql.net
如何将字串 String 转换成整数 int?
int i = Integer.valueOf(my_str).intValue();
int i=Integer.parseInt(str);
如何将字串 String 转换成Integer ?
Integer integer=Integer.valueOf(str);
如何将整数 int 转换成字串 String ?
1.
- PL/SQL的游标类型
百合不是茶
显示游标(静态游标)隐式游标游标的更新和删除%rowtyperef游标(动态游标)
游标是oracle中的一个结果集,用于存放查询的结果;
PL/SQL中游标的声明;
1,声明游标
2,打开游标(默认是关闭的);
3,提取数据
4,关闭游标
注意的要点:游标必须声明在declare中,使用open打开游标,fetch取游标中的数据,close关闭游标
隐式游标:主要是对DML数据的操作隐
- JUnit4中@AfterClass @BeforeClass @after @before的区别对比
bijian1013
JUnit4单元测试
一.基础知识
JUnit4使用Java5中的注解(annotation),以下是JUnit4常用的几个annotation: @Before:初始化方法 对于每一个测试方法都要执行一次(注意与BeforeClass区别,后者是对于所有方法执行一次)@After:释放资源 对于每一个测试方法都要执行一次(注意与AfterClass区别,后者是对于所有方法执行一次
- 精通Oracle10编程SQL(12)开发包
bijian1013
oracle数据库plsql
/*
*开发包
*包用于逻辑组合相关的PL/SQL类型(例如TABLE类型和RECORD类型)、PL/SQL项(例如游标和游标变量)和PL/SQL子程序(例如过程和函数)
*/
--包用于逻辑组合相关的PL/SQL类型、项和子程序,它由包规范和包体两部分组成
--建立包规范:包规范实际是包与应用程序之间的接口,它用于定义包的公用组件,包括常量、变量、游标、过程和函数等
--在包规
- 【EhCache二】ehcache.xml配置详解
bit1129
ehcache.xml
在ehcache官网上找了多次,终于找到ehcache.xml配置元素和属性的含义说明文档了,这个文档包含在ehcache.xml的注释中!
ehcache.xml : http://ehcache.org/ehcache.xml
ehcache.xsd : http://ehcache.org/ehcache.xsd
ehcache配置文件的根元素是ehcahe
ehcac
- java.lang.ClassNotFoundException: org.springframework.web.context.ContextLoaderL
白糖_
javaeclipsespringtomcatWeb
今天学习spring+cxf的时候遇到一个问题:在web.xml中配置了spring的上下文监听器:
<listener>
<listener-class>org.springframework.web.context.ContextLoaderListener</listener-class>
</listener>
随后启动
- angular.element
boyitech
AngularJSAngularJS APIangular.element
angular.element
描述: 包裹着一部分DOM element或者是HTML字符串,把它作为一个jQuery元素来处理。(类似于jQuery的选择器啦) 如果jQuery被引入了,则angular.element就可以看作是jQuery选择器,选择的对象可以使用jQuery的函数;如果jQuery不可用,angular.e
- java-给定两个已排序序列,找出共同的元素。
bylijinnan
java
import java.util.ArrayList;
import java.util.Arrays;
import java.util.List;
public class CommonItemInTwoSortedArray {
/**
* 题目:给定两个已排序序列,找出共同的元素。
* 1.定义两个指针分别指向序列的开始。
* 如果指向的两个元素
- sftp 异常,有遇到的吗?求解
Chen.H
javajcraftauthjschjschexception
com.jcraft.jsch.JSchException: Auth cancel
at com.jcraft.jsch.Session.connect(Session.java:460)
at com.jcraft.jsch.Session.connect(Session.java:154)
at cn.vivame.util.ftp.SftpServerAccess.connec
- [生物智能与人工智能]神经元中的电化学结构代表什么?
comsci
人工智能
我这里做一个大胆的猜想,生物神经网络中的神经元中包含着一些化学和类似电路的结构,这些结构通常用来扮演类似我们在拓扑分析系统中的节点嵌入方程一样,使得我们的神经网络产生智能判断的能力,而这些嵌入到节点中的方程同时也扮演着"经验"的角色....
我们可以尝试一下...在某些神经
- 通过LAC和CID获取经纬度信息
dai_lm
laccid
方法1:
用浏览器打开http://www.minigps.net/cellsearch.html,然后输入lac和cid信息(mcc和mnc可以填0),如果数据正确就可以获得相应的经纬度
方法2:
发送HTTP请求到http://www.open-electronics.org/celltrack/cell.php?hex=0&lac=<lac>&cid=&
- JAVA的困难分析
datamachine
java
前段时间转了一篇SQL的文章(http://datamachine.iteye.com/blog/1971896),文章不复杂,但思想深刻,就顺便思考了一下java的不足,当砖头丢出来,希望引点和田玉。
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- 小学5年级英语单词背诵第二课
dcj3sjt126com
englishword
money 钱
paper 纸
speak 讲,说
tell 告诉
remember 记得,想起
knock 敲,击,打
question 问题
number 数字,号码
learn 学会,学习
street 街道
carry 搬运,携带
send 发送,邮寄,发射
must 必须
light 灯,光线,轻的
front
- linux下面没有tree命令
dcj3sjt126com
linux
centos p安装
yum -y install tree
mac os安装
brew install tree
首先来看tree的用法
tree 中文解释:tree
功能说明:以树状图列出目录的内容。
语 法:tree [-aACdDfFgilnNpqstux][-I <范本样式>][-P <范本样式
- Map迭代方式,Map迭代,Map循环
蕃薯耀
Map循环Map迭代Map迭代方式
Map迭代方式,Map迭代,Map循环
>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
蕃薯耀 2015年
- Spring Cache注解+Redis
hanqunfeng
spring
Spring3.1 Cache注解
依赖jar包:
<!-- redis -->
<dependency>
<groupId>org.springframework.data</groupId>
<artifactId>spring-data-redis</artifactId>
- Guava中针对集合的 filter和过滤功能
jackyrong
filter
在guava库中,自带了过滤器(filter)的功能,可以用来对collection 进行过滤,先看例子:
@Test
public void whenFilterWithIterables_thenFiltered() {
List<String> names = Lists.newArrayList("John"
- 学习编程那点事
lampcy
编程androidPHPhtml5
一年前的夏天,我还在纠结要不要改行,要不要去学php?能学到真本事吗?改行能成功吗?太多的问题,我终于不顾一切,下定决心,辞去了工作,来到传说中的帝都。老师给的乘车方式还算有效,很顺利的就到了学校,赶巧了,正好学校搬到了新校区。先安顿了下来,过了个轻松的周末,第一次到帝都,逛逛吧!
接下来的周一,是我噩梦的开始,学习内容对我这个零基础的人来说,除了勉强完成老师布置的作业外,我已经没有时间和精力去
- 架构师之流处理---------bytebuffer的mark,limit和flip
nannan408
ByteBuffer
1.前言。
如题,limit其实就是可以读取的字节长度的意思,flip是清空的意思,mark是标记的意思 。
2.例子.
例子代码:
String str = "helloWorld";
ByteBuffer buff = ByteBuffer.wrap(str.getBytes());
Sy
- org.apache.el.parser.ParseException: Encountered " ":" ": "" at line 1, column 1
Everyday都不同
$转义el表达式
最近在做Highcharts的过程中,在写js时,出现了以下异常:
严重: Servlet.service() for servlet jsp threw exception
org.apache.el.parser.ParseException: Encountered " ":" ": "" at line 1,
- 用Java实现发送邮件到163
tntxia
java实现
/*
在java版经常看到有人问如何用javamail发送邮件?如何接收邮件?如何访问多个文件夹等。问题零散,而历史的回复早已经淹没在问题的海洋之中。
本人之前所做过一个java项目,其中包含有WebMail功能,当初为用java实现而对javamail摸索了一段时间,总算有点收获。看到论坛中的经常有此方面的问题,因此把我的一些经验帖出来,希望对大家有些帮助。
此篇仅介绍用
- 探索实体类存在的真正意义
java小叶檀
POJO
一. 实体类简述
实体类其实就是俗称的POJO,这种类一般不实现特殊框架下的接口,在程序中仅作为数据容器用来持久化存储数据用的
POJO(Plain Old Java Objects)简单的Java对象
它的一般格式就是
public class A{
private String id;
public Str