分子生物学知识整理

表观遗传变异

定义：是指碱基序列不变，通过DNA甲基化、组蛋白乙酰化、RNA编辑、基因沉默在、休眠转座子激活等方式影响了基因的活性，导致基因控制的性状发生改变，这种变化是可逆的，可能遗传。

• DNA甲基化：指在DNA甲基化转移酶介导下，甲基基团从S-腺苷甲硫氨酸转到胞嘧啶C5位点的过程。

• RNA干扰：由与靶序列同源的双链DNA引发的一种在生物体内广泛存在的序列特异性基因转录后的沉默过程。

• RNA编辑：指转录后RNA发生的碱基序列插入、缺失、替换等现象。其能改变碱基序列、密码子结构或转录本与其他分子的相互作用。

• 染色质重塑：指导致整个细胞分裂周期中染色质结构和位置改变的过程。

  染色质重塑因子：依靠水解ATP提供能量来完成染色质结构的改变。

• 基因组印迹:指来自双亲的某些等位基因在子代中呈现差异表达的现象。

• 组蛋白修饰：指染色质上的组蛋白被甲基化、乙酰化、磷酸化、泛素化的过程。

组蛋白：是真核生物体细胞染色质和原核生物中的碱性蛋白质。组蛋白和DNA共同组成核小体结构，“核小体”是染色体的基本结构单位，一个核小体由两个组蛋白H2A，两个组蛋白H2B，两个组蛋白H3，两个组蛋白H4组成的八聚体和147bp缠绕在外面的DNA组成。

名词解释

核心启动子（core promoter）：是指在体外测定到的由RNApolyⅡ进行精确转录其实要求的一套DNA序列元件。
沉默子（sliencer）：一种转录负调控元件，当其结合特定的蛋白因子时，对基因的转录起阻遏作用。
增强子（enhancer）：该DNA 序列可增加与其连锁的基因的转录频率。
终止子（terminator）：位于基因编码区下游，能够终止RNA转录合成的一段特殊DNA序列。
绝缘子（insulator）：在基因组上建立独立转录活性结构域的边界DNA序列。能够阻止临近的增强子或沉默子对其界定的基因启动子发挥调控作用。
转座子（transpon）：一段可以从原单位上单独复制或断裂下来，环化后插入另一位点，并对其后的基因起调控作用的DNA序列。
反转座子（retranspon）：先转录成RNA然后再反转录为DNA而进行转座的遗传元件。
组成型剪接：编码蛋白质的不连续基因通过RNA剪接将内含子从mRNA的前体中依次去除，然后将外显子剪接成成熟的mRNA,这种剪接方式一个基因只产生一种成熟的mRNA,一般只产生一种蛋白质。
可变剪接：（选择性剪切）指的是在mRNA前体到成熟mRNA的过程中，不同的剪切方式使得同一基因可以产生不同的成熟的mRNA，最终产生不同的蛋白质。

T-DNA插入：T-DNA是插入宿主细胞的一段DNA,通过农杆菌转化插入到一个随机的基因内可能导致该基因的失活。

端粒（telomene）：是由特定的DNA序列和相关蛋白质组成的线性真核染色体末端结构，它具有防止末端基因降解，染色体末端的粘连，稳定染色体末端和精确复制等功能。
焦磷酸化编辑（pyrophosphorolytic editing）：RNA聚合酶通过PPi的掺入去除错误加入的核苷酸，然后加入正常的核苷酸。
亮氨酸拉链：是由伸展的氨基酸组成，每7个氨基酸的第七个氨基酸为亮氨酸，亮氨酸是疏水性氨基酸，排列在α-螺旋的一侧，而所有带电的氨基酸残基排列在另一侧，当2个蛋白质平行排列时，亮氨酸之间相互作用形成二聚体，形成拉链。

全基因组选择：利用覆盖全基因组的高密度分子标记进行个体遗传评估，从而得到基因组估计的育种值。

开放阅读框（ORF）：从起始密码子开始，是DNA序列中具有编码蛋白质潜能的序列，结束于终止密码子连续的碱基序列。一段DNA或RNA序列有多种不同的读取方式，可同时存在不同的ORF。