Ubuntu miniconda3安装与环境配置

1.软件下载，使用清华镜像源，便于下载，进入清华镜像源anaconda页面：https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/help/anaconda/，再进入miniconda下载目录https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/，由于python2已停止更新，我们选择以python3编写的miniconda3

wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-py37_4.8.3-Linux-x86_64.sh

2. 安装miniconda3

bash Miniconda3-py37_4.8.3-Linux-x86_64.sh

3. 遇到Do you accept the license terms? [yes|no]
   回车
   q键退出阅读license
   yes
4. Miniconda3 will now be installed into this location:
   /home/polya/miniconda3
   回车默认
5. 不建议通过conda init进行初始化，因为可能会导致conda与系统里的软件相冲突。
   Do you wish the installer to initialize Miniconda3
   by running conda init? [yes|no]
   [no] >>> no
   6.启动conda 环境（由于我们没有conda init,以后每次启动都需要用这个命令）

source ~/miniconda3/bin/activate

7. 添加国内镜像，进入清华镜像源anaconda页面

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda 
conda config --set show_channel_urls true

8. 安装软件,以samtools为例

conda install samtools