很明显《红楼梦》的主旨是就讲述并反思明朝以及后续南明诸政权的灭亡。中国自古就有“文史不分家”、“文以载道”的说法，所以《红楼梦》是用隐秘的笔法写历史。“红楼”就是“天香楼”，就是明朝。唐太宗曰：“以古为镜，可以知兴替。”《红楼梦》就是“风月宝鉴”，是作者留给我们后人的一面镜子，它要提醒我们以史为鉴，不要重蹈历史的覆辙。由于明朝的灭亡意味着皇汉民族正统政权的灭亡，所以本书也对秦、汉、唐、宋的灭亡也进行了反思。可以说《红楼梦》是小说里面最好的史书，也是史书里面最好的小说。
《红楼梦》有两面，一面是淫乱色情，风花雪月，一面是清风明月，国家灭亡。明朝遗民经常用清风明月知道明清，本书也提醒我们要看反面。看原文（第12回）：
说毕，从褡裢中取出一面镜子来——两面皆可照人，镜把上面錾着“风月宝鉴”四字——递与贾瑞道：“这物出自太虚幻境空灵殿上，警幻仙子所制，专治邪思妄动 之症，有济世保生之功。所以带他到世上，单与那些聪明杰俊，风雅王孙等看照。千万不可照正面，只照他的背面，要紧，要紧！三日后吾来收取，管叫你好了。“
这本书就是“风月宝鉴”，作者提醒我们要看背面，不要看反面。正反面到底是什么？看原文（第12回）：
贾瑞收了镜子，想道：“这道士倒有意思，我何不照一照试试。”想毕，拿起“风月鉴”来，向反面一照，只见一个骷髅立在里面，唬得贾瑞连忙掩了，骂：“道士混帐，如何吓我！——我倒再照照正面是什么。”想着，又将正面一照，只见凤姐站在里面招手叫他。贾瑞心中一喜，荡悠悠的觉得进了镜子，与凤姐云雨一番，凤姐仍送他出来。
这个镜子正面是贾瑞幻想的淫乱，就像这本书初次一看就写了贾府的淫乱，男女之间的事情。反面是骷髅，骷髅代表死亡，这本书多次出现“末世”，末世的死亡就是国家的灭亡。作者也提醒我们，正面是假的，反面是真的。看原文（第12回）：
代儒夫妇哭的死去活来，大骂道士，“是何妖镜！若不早毁此物，遗害于世不小。”遂命架火来烧，只听镜内哭道：“谁叫你们瞧正面了！你们自己以假为真，何苦来烧我？”正哭着，只见那跛足道人从外面跑来，喊道：“谁毁‘风月鉴’，吾来救也！”说着，直入中堂，抢入手内，飘然去了。
一个“烧”字再次指明这本书就是这个镜子。如果我们说这本书写男女的爱情和淫乱，那这本书就哭了，作者也要哭了。作者用发自肺腑的哭提醒我们一定要看背面，所以我们绝对不要把《红楼梦》理解成爱情故事或者反封建。而且这本书的时间把作者也指了出来，看原文（第2回）：
如前代之许由、陶潜、阮籍、嵇康、刘伶、王谢二族、顾虎头、陈后主、唐明皇、宋徽宗、刘庭芝、温飞卿、米南宫、石曼卿、柳耆卿、秦少游，近日之倪云林、唐伯虎、祝枝山，再如李龟年，黄幡绰，敬新磨，卓文君，红拂，薛涛，崔莺，朝云之流，此皆易地则同之人也。”
作者很明确指出了“近日”的这些人物，倪云林、唐伯虎都是明朝人，那么书中经常说的“末世”必然是明朝末世，作者很多地方都指出了清朝入侵明朝这一点，比较明显的是宝玉袭人改名，看原文（第3回）：
原来这袭人亦是贾母之婢，本名珍珠。贾母因溺爱宝玉，生恐宝玉之婢无竭力尽忠之人，素喜袭人心地纯良，克尽职任，遂与了宝玉。宝玉因知他本姓花，又曾见旧人诗句上有“花气袭人”之句，遂回明贾母，更名袭人。
袭人的名字是花袭人，这个名字引起了贾政的注意。再看给芳官改名（第63回）：
又说：“芳官之名不好，竟改了男名才别致。”因又改作“雄奴”。芳官十分称心，又说：“既如此，你出门也带我出去。有人问，只说我和茗烟一样的小厮就是 了。”宝玉笑道：“到底人看的出来。”芳官笑道：“我说你是无才的。咱家现有几家土番，你就说我是个小土番儿。况且人人说我打联垂好看，你想这话可妙？” 宝玉听了，喜出意外，忙笑道：“这却很好。我亦常见官员人等多有跟从外国献俘之种，图其不畏风霜，鞍马便捷。既这等，再起个番名，叫作“耶律雄奴”。‘雄奴’二音，又与匈奴相通，都是犬戎名姓。况且这两种人自尧舜时便为中华之患，晋唐诸朝，深受其害。幸得咱们有福，生在当今之世，大舜之正裔，圣虞之功德仁孝，赫赫格天，同天地日月亿兆不朽，所以凡历朝中跳梁猖獗之小丑，到了如今竟不用一干一戈，皆天使其拱手俛头缘远来降。我们正该作践他们，为君父生色。”
“袭人”就是袭击人的意思，“耶律雄奴”指的是耶律与匈奴两种，耶律是契丹皇族，匈奴就是秦汉时的大患，耶律匈奴女真袭击人才是《红楼梦》的主旨，作者在书中也有提示，看原文（第5回）：
〖红楼梦引子〗开辟鸿蒙，谁为情种？都只为风月情浓。趁着这奈何天，伤怀日，寂寥时，试遣愚衷。因此上，演出这怀金悼玉的《红楼梦》。
怀意思是投降、归顺，悼意思是悼念、思念，金影射满清，玉影射明朝，也就是说这本书的主旨是投降了清朝而悼念明朝。所以这本书是一本史书性质的。
这本书开始讲到女娲补天引起了这段故事。女娲为什么要补天？《淮南子》记载：“昔者共工与颛顼争为帝，怒而触不周之山，天柱折，地维绝。天倾西北，故日月星辰移焉；地不满东南，故水潦尘埃归焉。”《史记》记载：“当其末年也，诸侯有共工氏，任智刑以强，霸而不王，以水乘木，乃与祝融战，不胜而怒，乃头触不周山崩，天柱折，地维缺。”共工是水神，颛顼是天帝，祝融是火神。共工影射满清，颛顼和祝融影射明朝，女娲补天的原因是共工与颛顼或祝融争着当皇帝，影射明朝与清朝的战争。书中也提示了此事。看原文（第1回）：
当日地陷东南，这东南一隅有处曰姑苏，有城曰阊门者，最是红尘中一二等富贵风流之地。
地陷东南就是“地不满东南”，再看原文（第1回）：
士隐意欲也跟了过去，方举步时，忽听一声霹雳，有若山崩地陷。士隐大叫一声，定睛一看，只见烈日炎炎，芭蕉冉冉，所梦之事便忘了大半。
“山崩地陷”与“地陷东南”指明了本书背景就是共工与颛顼或祝融争当皇帝，所以本书的主旨就是明清更替的历史。
因为清朝实行残酷的文字狱，禁止私人写史书，而且清朝篡改历史，篡改并且销毁了很多书籍，作者用浸着血泪的笔给我们写下了这部书，在《红楼梦》中用闺阁私情，琐碎家事写明亡清兴的历史，也是真正的历史，作者希望炎黄子孙以此为鉴，吸取教训，振兴中国，每个炎黄子孙都应该读一读《红楼梦》。