生物信息数据分析入门-小结

生物信息数据分析入门-小结

出发点

2014年春节，我第一次呆在学校过年，自以为通过寒假的努力，可以在开学前掌握生信数据分析，完成手上的项目。然而事实并非如此，生物信息数据分析，看似简单，实则水深。差不多4年了，是时候做个总结了。大体要整理的相关内容暂时就这么多啦，其他的后面进行修改与增补，认为有需要调整的，随时与我联系。
大体上，这将会是一年的工作量。

目录

高通量测序技术了解

1.测序原理

1. 测序技术的发展-简史
2. 一代测序技术原理
3. 二代测序技术原理
3. 三代测序技术原理.
4. 四代测序技术原理？

2.了解高通量测序数据分析中的主要文件格式

1.fasta
2.fastq
3.SAM/sam
4. gtf文件/gff文件
5. .....

3.基本数据分析逻辑

1.大体概述
2.序列比对
2.读段计数
3.表达量估计
4.差异表达分析
5.基因**结构**注释
6.基因**功能**注释
7.其他分析

4.linux相关基础

1.系统安装
2.常见压缩格式
3. gz压缩
2. tar.gz压缩
3. bz压缩

5.脚本编程基础

1.perl语言编程及应用
2.R语言的使用
3.python语言编程及应用

6.一些常见软件的快速上手与使用

1.Cytoscape的简单使用
2.BiNGO的进行Gene Ontology分析
3.植物组学基因功能研究利器-Mapman
4.TBtools的简介

学习到的点….

MarkdownHere插件转换表格的时候，表格的前一行必须空一行…..

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