python复杂网络处理模块networkx

最近开始认真的学习发现一个 python 好玩的模块

以下内容为网上的文章整合

networkx在02年5月产生，是用python语言编写的软件包，便于用户对复杂网络进行创建、操作和学习。利用networkx可以以标准化和非标准化的数据格式存储网络、生成多种随机网络和经典网络、分析网络结构、建立网络模型、设计新的网络算法、进行网络绘制等。

NetworkX提供了4种常见网络的建模方法，分别是：规则图，ER随机图，WS小世界网络和BA无标度网络。

一. 规则图

　　规则图差不多是最没有复杂性的一类图，random_graphs.random_regular_graph(d, n)方法可以生成一个含有n个节点，每个节点有d个邻居节点的规则图。

　　下面一段示例代码，生成了包含20个节点、每个节点有3个邻居的规则图：

import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt
# regular graphy
# generate a regular graph which has 20 nodes & each node has 3 neghbour nodes.
RG = nx.random_graphs.random_regular_graph(3, 20)
# the spectral layout
pos = nx.spectral_layout(RG)
# draw the regular graphy
nx.draw(RG, pos, with_labels = False, node_size = 30)
plt.show()

二、ER随机图

　　ER随机图是早期研究得比较多的一类“复杂”网络，模型的基本思想是以概率p连接N个节点中的每一对节点。用random_graphs.erdos_renyi_graph(n,p)方法生成一个含有n个节点、以概率p连接的ER随机图：

import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt
# erdos renyi graph
# generate a graph which has n=20 nodes, probablity p = 0.2.
ER = nx.random_graphs.erdos_renyi_graph(20, 0.2)
# the shell layout
pos = nx.shell_layout(ER)
nx.draw(ER, pos, with_labels = False, node_size = 30)
plt.show()

三、WS小世界网络

　　用random_graphs.watts_strogatz_graph(n, k, p)方法生成一个含有n个节点、每个节点有k个邻居、以概率p随机化重连边的WS小世界网络。

　　下面是一个例子：

import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt
# WS network
# generate a WS network which has 20 nodes,
# each node has 4 neighbour nodes,
# random reconnection probability was 0.3.
WS = nx.random_graphs.watts_strogatz_graph(20, 4, 0.3)
# circular layout
pos = nx.circular_layout(WS)
nx.draw(WS, pos, with_labels = False, node_size = 30)
plt.show()

四、BA无标度网络

　　用random_graphs.barabasi_albert_graph(n, m)方法生成一个含有n个节点、每次加入m条边的BA无标度网络。

　　下面是一个例子：

import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt
# BA scale-free degree network
# generalize BA network which has 20 nodes, m = 1
BA = nx.random_graphs.barabasi_albert_graph(20, 1)
# spring layout
pos = nx.spring_layout(BA)
nx.draw(BA, pos, with_labels = False, node_size = 30)
plt.show()

来源: http://www.cnblogs.com/forstudy/archive/2012/03/20/2407954.html

还有使用笔记给出链接 http://blog.sciencenet.cn/blog-404069-337442.html