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Biobank genetic data探析(三)
想摸鱼的生信小白
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Biobankgeneticdata探析(三)——GenotypingprocessandsampleQC一.总览Category100313这类数据包含了Affymetrix做Genotypecalling的pipeline的流程信息(后续分析中可能用不到),以及样本质量控制的信息(下游分析中估计是必用了)。二.数据集描述2.1Genotypingprocess查看之后发现这部分不是很重要,毕竟
快速排序法的使用 ( 超详细图解 )
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快速排序法的使用快速排序法作为一种广受好评的排序方法,不仅仅因为它的排序效率很高,更因为它体现了分治的思想。因此许多广为人知的软件公司(BAT)的笔试面试都喜欢考,甚至在一些大大小小的考试如软考、考研中也能见到它的身影。因此熟练默写快速排序法的代码并掌握其核心思想对我们来说尤为重要。快速排序法的背景:快速排序由C.A.R.Hoare在1960年提出。它的基本思想是:通过一趟排序将要排序的数据分割成
GBase8c aes_encrypt和aes_decrypt函数
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在数据库中,aes_encrypt和aes_decrypt函数进行加解密时使用的块加密模式。GBase8c与MySQL的aes_encrypt和aes_decrypt函数区别:1、GBase8c中的初始化向量init_vector不能为空2、MySQL的加密模块block_encryption_mode为aes-128-ecb,GBase8c不支持aes-128-ecb,默认加密模块为aes-12
C#—【特性详解以及自定义特性和通过反射读取特性】
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Python在生物信息学中的应用:基因组学与蛋白质组学
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摘要:本文主要介绍了Python在生物信息学中的应用,特别是在基因组学和蛋白质组学领域。文章详细讲述了各个原理,并以代码实例展示了实际应用。我们将探讨如何利用Python分析基因组数据,解析蛋白质序列,以及进行比对分析等。文章目录1.引言2.分析基因组数据2.1读取和解析FASTA文件2.2基因频率分析2.3代码实例3.蛋白质组学3.1解析蛋白质序列3.2蛋白质序列比对3.3代码实例4.总结1.引
yaml常见的读取和写入
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allow_unicode=True:遇到中文不转换为unicode编码sort_keys=False:不进行排序,默认按照字母abcd排序importyamldefwrite_yaml_template():"""统一的yaml模板:return:"""yaml_template=[{'feature':None,'story':None,'title':None,'request':{'met
队列在计算机系统中的应用
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队列在计算机系统中有广泛的应用,主要用于管理任务和处理数据流。以下是队列的一些常见应用场景:1.任务调度操作系统:操作系统使用队列管理进程调度,如先来先服务(FCFS)调度算法。线程池:线程池通过队列管理待执行任务,确保任务按顺序处理。2.数据缓冲I/O操作:队列用于缓冲输入输出数据,平衡生产者和消费者速度。网络通信:网络数据包通过队列缓冲,确保按顺序处理。3.消息传递消息队列:在分布式系统中,消
Leetcode32 最长有效括号深度解析
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问题描述找出字符串s中最长的有效括号子串的长度。核心思路动态规划:定义dp[i]为以字符s[i]结尾的最长有效括号子串长度。分情况讨论:根据当前字符是否为)以及前面的字符情况,推导状态转移方程。状态转移方程详解Case1:当前字符)与前一个字符(直接匹配场景:形如...()的结构。转移方程:if(s.charAt(i-1)=='('){dp[i]=dp[i-2]+2;//前i-2个字符的有效长度+
锁的策略)
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synchronized锁的分类
一、锁的分类第一组:乐观锁和悲观锁这是两种不同的锁的实现方式。乐观锁:在加锁之前,预估当前出现锁冲突的概率不大,因此在进行加锁的时候就不会做太多的工作。悲观锁:在加锁之前,预估到当前锁冲突出现的概率比较大,因此加锁的时候就会做更多的工作,做的事情更多,加锁的速度可能会更慢,但整个过程中不容易出现其他问题。第二组:轻量级锁和重量级锁轻量级锁:加锁的开销小,加锁的速度更快=>一般为乐观锁重量级锁:加锁
request+pytest根据yaml文件发送请求
等枝桠~成繁花
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request怎么跟pytest结合起来,然后根据yaml文件去发一个基本的请求呢?下面是一个简单的示例。1、先新建一个名为“demo.yaml”的yaml文件,用来存放测试数据的。-name:G广州研发中心parentid:1#第一次用例的数据正常expect:60008#对请求结果进行断言-name:""parentid:1#第二次用例的数据name为空expect:40058#对请求结果进行
实战篇:GBase 8a MPP Cluster 安装部署过程
Lucifer三思而后行
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目录前言☀️环境准备安装介质下载操作系统安装安装前准备1、关闭防火墙2、禁用Selinux3、创建gbase用户4、创建目录并授权5、重启主机❤️GBase8aMPPCluster安装主节点上传安装介质主节点解压安装包分发配置文件配置环境变量修改主节点安装配置文件主节点执行安装命令检查集群状态申请和导入授权①导出集群各节点的指纹信息②邮件申请授权③主节点导入授权④检查授权情况所有节点启动集群服务主
Spring Boot项目中集成sa-token实现认证授权和OAuth 2.0第三方登录
山高自有客行路
#Springbootspringboot
OAuth2.0第三方登录OAuth2.0是一种授权协议,允许第三方应用在不暴露用户密码的情况下访问用户的资源。它通常用于第三方登录场景,例如使用GitHub、Google等社交平台进行登录。在sa-token框架中,OAuth2.0第三方登录可以通过集成sa-token-oauth2模块来实现,并且可以结合sa-token的安全特性来增强安全性。导入依赖首先,在你的pom.xml文件中添加必要的
C语言中的结构体指针
812503533
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一、什么是结构体指针?在C语言中,结构体是一种用户自定义的数据类型,可以将不同类型的变量组合在一起形成一个更复杂的数据结构。而结构体指针则是指向结构体变量地址的指针。通过结构体指针,我们可以动态访问结构体成员、传递结构体到函数以及进行内存管理等操作。结构体指针提供了一个更加灵活和高效的方式来操作结构体,特别是在处理大型数据结构时,指针的使用可以节省内存并提高程序性能。二、如何声明结构体指针?结构体
40岁重启人生学python,今天搞明白了,啥是循环结构?
飞哥知行录
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今天学习了循环结构,其实说心里话,不是太明白,尤其是老师讲了那些高深的理论之后,就更加糊涂了。后来还是借助deepseek,它说:循环结构就是让计算机重复执行某段代码,直到满足特定条件(比如吃饱了就停止吃饭)。吃饱了就停止吃饭,多么简单的一句话,我一下就明白了,忽然觉得那些讲课喜欢高深理论的人,他们真的好可悲。总是抱着概念和教条的东西,不知道你们是怎么听明白的。循环结构的三种常见类型是`for循环
一份C#的笔试题及答案
网际游侠
c#面试笔试
C#笔试题一、基础知识OOP的基本概念面向对象编程的核心思想包括四个主要特性:继承、多态、封装和信息隐藏。请简述这四个特性的具体内容。值类型与引用类型的区别值类型(如int,string)在内存中直接存储数据,而引用类型(如object,ref)通过引用间接存储,指出值的位置。请举例说明两者的不同。静态与非静态关键字的作用静态和非静态关键字用于区分依赖于实例还是不依赖于实例的成员。请分别解释它们的
Lumberyard:Lumberyard物理系统详解_2024-07-13_20-00-57.Tex
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Lumberyard:Lumberyard物理系统详解Lumberyard物理系统概述物理引擎介绍Lumberyard,亚马逊的游戏引擎,集成了强大的物理引擎,用于模拟游戏世界中的真实物理行为。其物理引擎基于PhysX,一个由NVIDIA开发的物理模拟技术,广泛应用于游戏开发中。PhysX支持复杂的物理交互,包括刚体动力学、软体物理、流体动力学等,能够为游戏提供逼真的物理效果。物理系统在Lumbe
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当矩阵的非零元个数与位置在操作中变化较大时,就不宜用顺序存储结构来表示三元组的线性表。在链表中,每个非零元可用一个含5个域的结点表示,其中i,j,e这三个域分别表示该非零元所在的行的值,向右域right用以链接同一行中下一个非零元,向下域down用以链接同一列中下一个非零元,向右域right用以链接同一行中下一个非零元,向下域down用以链接同一列中下一个非零元。同一行的非零元通过right域链接
GBASE 8C——SQL参考6 sql语法(14)
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ROLLBACKPREPARED功能描述取消一个先前为两阶段提交准备好的事务。语法格式ROLLBACKPREPAREDtransaction_id参数说明transaction_id:待提交事务的标识符。它不能和任何当前预备事务已经使用了的标识符同名。注意事项要想回滚一个预备事务,必须是最初发起事务的用户,或者是系统管理员。pg_prepared_xacts系统视图中列出了当前可用的所有准备好的事
GBASE 8C——SQL参考6 sql语法(5)
aisirea
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COMMIT功能描述提交当前事务。语法格式COMMIT[WORK|TRANSACTION]参数说明WORK|TRANSACTION:可选的关键词,没有具体效果。注意事项执行COMMIT这个命令的时候,命令执行者必须是该事务的创建者或系统管理员,且创建和提交操作可以不在同一个会话中。语法兼容符合SQL标准。相关语法BEGIN,ROLLBACK,ENDCOMMITPREPARED功能描述提交一个预先为
GBASE 8C——SQL参考6 sql语法(2)
aisirea
数据库sql
ALTERINDEX功能描述修改一个索引的参数。语法格式ALTERINDEX[IFEXISTS]nameRENAMETOnew_nameALTERINDEX[IFEXISTS]nameSETTABLESPACEtablespace_nameALTERINDEXnameDEPENDSONEXTENSIONextension_nameALTERINDEX[IFEXISTS]nameSET(storag
python基于django/flask网上书城系统Django-SpringBoot-php-Node.js-flask
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Java流程控制
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Java流程控制用户交互Scannerjava.util.Scanner使用这个包中Scanner类获取用户的输出基本语法 Scanners=newScanner(System.in);通过Scanner类的next()与nextLine()方法获取输入的字符串,在读取前我们要使用hasNext()与hasNextLine()判断用户是否还有输入的数据next():一定要读取到有效字符后才可以结束
Node.js系列(1)--架构设计指南
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Node.js架构设计指南️引言Node.js作为一个高性能的JavaScript运行时环境,其架构设计对于构建可扩展的服务端应用至关重要。本文将深入探讨Node.js的架构设计原则、最佳实践和实现方案。架构概述Node.js架构主要包括以下方面:事件驱动:基于事件循环的异步非阻塞架构模块系统:CommonJS和ES模块系统进程模型:单线程主进程与工作线程流处理:基于Stream的数据处理错误处理
C# 线程池 ThreadPool 的深入解析与应用
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在多线程编程中,线程池(ThreadPool)是一种高效利用系统资源的方式。通过合理使用线程池,可以显著提高应用程序的性能和响应能力。本文将深入解析C#中的ThreadPool类,并展示如何在实际应用中有效地使用它。你是否曾经面临过创建过多线程导致系统资源耗尽的问题?C#提供的ThreadPool类可以帮助你优雅地管理线程,避免这些问题。本文将带你一步步深入了解ThreadPool并展示其在实际项
二分查找 -- 分巧克力
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算法python蓝桥杯
P8647[蓝桥杯2017省AB]分巧克力-洛谷思路:”二分+贪心“由于目标是使每个人所分的的巧克力的边长尽可能大,(注意要保证公平,全部同一大小),设边长L*L,最小(L=1);最大min(H_i,W_i)每次检查当前K是否可行可行性检查(贪心计算):检查可行性(贪心计算):对每一块巧克力H_i*W_i,能切出的L*L巧克力数量是:count=(Hi/L)*(Wi/L)---->用整除统计所有N
群体智能优化算法-旗鱼优化算法 (Sailfish Optimizer, SFO,含Matlab源代码)
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算法matlab开发语言群体智能优化优化
摘要旗鱼优化算法(SailfishOptimizer,SFO)是一种模拟旗鱼(Sailfish)和沙丁鱼(Sardine)之间捕食关系的新型元启发式算法。通过在搜索过程中模拟旗鱼对沙丁鱼的捕食行为,以及沙丁鱼群的逃逸与防御机制,SFO平衡了全局探索与局部开发,在处理复杂优化问题时具有良好的收敛性能。本文提供了SFO的核心思路并提供了完整MATLAB代码及详细中文注释,以帮助读者快速理解并应用该算法
统一思想认识
永夜-极光
思想
1.统一思想认识的基础,才能有的放矢
原因:
总有一种描述事物的方式最贴近本质,最容易让人理解.
如何让教育更轻松,在于找到最适合学生的方式.
难点在于,如何模拟对方的思维基础选择合适的方式. &
Joda Time使用笔记
bylijinnan
javajoda time
Joda Time的介绍可以参考这篇文章:
http://www.ibm.com/developerworks/cn/java/j-jodatime.html
工作中也常常用到Joda Time,为了避免每次使用都查API,记录一下常用的用法:
/**
* DateTime变化(增减)
*/
@Tes
FileUtils API
eksliang
FileUtilsFileUtils API
转载请出自出处:http://eksliang.iteye.com/blog/2217374 一、概述
这是一个Java操作文件的常用库,是Apache对java的IO包的封装,这里面有两个非常核心的类FilenameUtils跟FileUtils,其中FilenameUtils是对文件名操作的封装;FileUtils是文件封装,开发中对文件的操作,几乎都可以在这个框架里面找到。 非常的好用。
各种新兴技术
不懂事的小屁孩
技术
1:gradle Gradle 是以 Groovy 语言为基础,面向Java应用为主。基于DSL(领域特定语言)语法的自动化构建工具。
现在构建系统常用到maven工具,现在有更容易上手的gradle,
搭建java环境:
http://www.ibm.com/developerworks/cn/opensource/os-cn-gradle/
搭建android环境:
http://m
tomcat6的https双向认证
酷的飞上天空
tomcat6
1.生成服务器端证书
keytool -genkey -keyalg RSA -dname "cn=localhost,ou=sango,o=none,l=china,st=beijing,c=cn" -alias server -keypass password -keystore server.jks -storepass password -validity 36
托管虚拟桌面市场势不可挡
蓝儿唯美
用户还需要冗余的数据中心,dinCloud的高级副总裁兼首席营销官Ali Din指出。该公司转售一个MSP可以让用户登录并管理和提供服务的用于DaaS的云自动化控制台,提供服务或者MSP也可以自己来控制。
在某些情况下,MSP会在dinCloud的云服务上进行服务分层,如监控和补丁管理。
MSP的利润空间将根据其参与的程度而有所不同,Din说。
“我们有一些合作伙伴负责将我们推荐给客户作为个
spring学习——xml文件的配置
a-john
spring
在Spring的学习中,对于其xml文件的配置是必不可少的。在Spring的多种装配Bean的方式中,采用XML配置也是最常见的。以下是一个简单的XML配置文件:
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<beans xmlns="http://www.springframework.or
HDU 4342 History repeat itself 模拟
aijuans
模拟
来源:http://acm.hdu.edu.cn/showproblem.php?pid=4342
题意:首先让求第几个非平方数,然后求从1到该数之间的每个sqrt(i)的下取整的和。
思路:一个简单的模拟题目,但是由于数据范围大,需要用__int64。我们可以首先把平方数筛选出来,假如让求第n个非平方数的话,看n前面有多少个平方数,假设有x个,则第n个非平方数就是n+x。注意两种特殊情况,即
java中最常用jar包的用途
asia007
java
java中最常用jar包的用途
jar包用途axis.jarSOAP引擎包commons-discovery-0.2.jar用来发现、查找和实现可插入式接口,提供一些一般类实例化、单件的生命周期管理的常用方法.jaxrpc.jarAxis运行所需要的组件包saaj.jar创建到端点的点到点连接的方法、创建并处理SOAP消息和附件的方法,以及接收和处理SOAP错误的方法. w
ajax获取Struts框架中的json编码异常和Struts中的主控制器异常的解决办法
百合不是茶
jsjson编码返回异常
一:ajax获取自定义Struts框架中的json编码 出现以下 问题:
1,强制flush输出 json编码打印在首页
2, 不强制flush js会解析json 打印出来的是错误的jsp页面 却没有跳转到错误页面
3, ajax中的dataType的json 改为text 会
JUnit使用的设计模式
bijian1013
java设计模式JUnit
JUnit源代码涉及使用了大量设计模式
1、模板方法模式(Template Method)
定义一个操作中的算法骨架,而将一些步骤延伸到子类中去,使得子类可以不改变一个算法的结构,即可重新定义该算法的某些特定步骤。这里需要复用的是算法的结构,也就是步骤,而步骤的实现可以在子类中完成。
 
Linux常用命令(摘录)
sunjing
crondchkconfig
chkconfig --list 查看linux所有服务
chkconfig --add servicename 添加linux服务
netstat -apn | grep 8080 查看端口占用
env 查看所有环境变量
echo $JAVA_HOME 查看JAVA_HOME环境变量
安装编译器
yum install -y gcc
【Hadoop一】Hadoop伪集群环境搭建
bit1129
hadoop
结合网上多份文档,不断反复的修正hadoop启动和运行过程中出现的问题,终于把Hadoop2.5.2伪分布式安装起来,跑通了wordcount例子。Hadoop的安装复杂性的体现之一是,Hadoop的安装文档非常多,但是能一个文档走下来的少之又少,尤其是Hadoop不同版本的配置差异非常的大。Hadoop2.5.2于前两天发布,但是它的配置跟2.5.0,2.5.1没有分别。 &nb
Anychart图表系列五之事件监听
白糖_
chart
创建图表事件监听非常简单:首先是通过addEventListener('监听类型',js监听方法)添加事件监听,然后在js监听方法中定义具体监听逻辑。
以钻取操作为例,当用户点击图表某一个point的时候弹出point的name和value,代码如下:
<script>
//创建AnyChart
var chart = new AnyChart();
//添加钻取操作&quo
Web前端相关段子
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web前端
Web标准:结构、样式和行为分离
使用语义化标签
0)标签的语义:使用有良好语义的标签,能够很好地实现自我解释,方便搜索引擎理解网页结构,抓取重要内容。去样式后也会根据浏览器的默认样式很好的组织网页内容,具有很好的可读性,从而实现对特殊终端的兼容。
1)div和span是没有语义的:只是分别用作块级元素和行内元素的区域分隔符。当页面内标签无法满足设计需求时,才会适当添加div
编程之美-24点游戏
bylijinnan
编程之美
import java.util.ArrayList;
import java.util.Arrays;
import java.util.HashSet;
import java.util.List;
import java.util.Random;
import java.util.Set;
public class PointGame {
/**编程之美
主页面子页面传值总结
chengxuyuancsdn
总结
1、showModalDialog
returnValue是javascript中html的window对象的属性,目的是返回窗口值,当用window.showModalDialog函数打开一个IE的模式窗口时,用于返回窗口的值
主界面
var sonValue=window.showModalDialog("son.jsp");
子界面
window.retu
[网络与经济]互联网+的含义
comsci
互联网+
互联网+后面是一个人的名字 = 网络控制系统
互联网+你的名字 = 网络个人数据库
每日提示:如果人觉得不舒服,千万不要外出到处走动,就呆在床上,玩玩手游,更不能够去开车,现在交通状况不
oracle 创建视图 with check option
daizj
视图vieworalce
我们来看下面的例子:
create or replace view testview
as
select empno,ename from emp where ename like ‘M%’
with check option;
这里我们创建了一个视图,并使用了with check option来限制了视图。 然后我们来看一下视图包含的结果:
select * from testv
ToastPlugin插件在cordova3.3下使用
dibov
Cordova
自己开发的Todos应用,想实现“
再按一次返回键退出程序 ”的功能,采用网上的ToastPlugins插件,发现代码或文章基本都是老版本,运行问题比较多。折腾了好久才弄好。下面吧基于cordova3.3下的ToastPlugins相关代码共享。
ToastPlugin.java
package&nbs
C语言22个系统函数
dcj3sjt126com
cfunction
C语言系统函数一、数学函数下列函数存放在math.h头文件中Double floor(double num) 求出不大于num的最大数。Double fmod(x, y) 求整数x/y的余数。Double frexp(num, exp); double num; int *exp; 将num分为数字部分(尾数)x和 以2位的指数部分n,即num=x*2n,指数n存放在exp指向的变量中,返回x。D
开发一个类的流程
dcj3sjt126com
开发
本人近日根据自己的开发经验总结了一个类的开发流程。这个流程适用于单独开发的构件,并不适用于对一个项目中的系统对象开发。开发出的类可以存入私人类库,供以后复用。
以下是开发流程:
1. 明确类的功能,抽象出类的大概结构
2. 初步设想类的接口
3. 类名设计(驼峰式命名)
4. 属性设置(权限设置)
判断某些变量是否有必要作为成员属
java 并发
shuizhaosi888
java 并发
能够写出高伸缩性的并发是一门艺术
在JAVA SE5中新增了3个包
java.util.concurrent
java.util.concurrent.atomic
java.util.concurrent.locks
在java的内存模型中,类的实例字段、静态字段和构成数组的对象元素都会被多个线程所共享,局部变量与方法参数都是线程私有的,不会被共享。
Spring Security(11)——匿名认证
234390216
Spring SecurityROLE_ANNOYMOUS匿名
匿名认证
目录
1.1 配置
1.2 AuthenticationTrustResolver
对于匿名访问的用户,Spring Security支持为其建立一个匿名的AnonymousAuthenticat
NODEJS项目实践0.2[ express,ajax通信...]
逐行分析JS源代码
Ajaxnodejsexpress
一、前言
通过上节学习,我们已经 ubuntu系统搭建了一个可以访问的nodejs系统,并做了nginx转发。本节原要做web端服务 及 mongodb的存取,但写着写着,web端就
在Struts2 的Action中怎样获取表单提交上来的多个checkbox的值
lhbthanks
javahtmlstrutscheckbox
第一种方法:获取结果String类型
在 Action 中获得的是一个 String 型数据,每一个被选中的 checkbox 的 value 被拼接在一起,每个值之间以逗号隔开(,)。
所以在 Action 中定义一个跟 checkbox 的 name 同名的属性来接收这些被选中的 checkbox 的 value 即可。
以下是实现的代码:
前台 HTML 代码:
003.Kafka基本概念
nweiren
hadoopkafka
Kafka基本概念:Topic、Partition、Message、Producer、Broker、Consumer。 Topic: 消息源(Message)的分类。 Partition: Topic物理上的分组,一
Linux环境下安装JDK
roadrunners
jdklinux
1、准备工作
创建JDK的安装目录:
mkdir -p /usr/java/
下载JDK,找到适合自己系统的JDK版本进行下载:
http://www.oracle.com/technetwork/java/javase/downloads/index.html
把JDK安装包下载到/usr/java/目录,然后进行解压:
tar -zxvf jre-7
Linux忘记root密码的解决思路
tomcat_oracle
linux
1:使用同版本的linux启动系统,chroot到忘记密码的根分区passwd改密码 2:grub启动菜单中加入init=/bin/bash进入系统,不过这时挂载的是只读分区。根据系统的分区情况进一步判断. 3: grub启动菜单中加入 single以单用户进入系统. 4:用以上方法mount到根分区把/etc/passwd中的root密码去除 例如: ro
跨浏览器 HTML5 postMessage 方法以及 message 事件模拟实现
xueyou
jsonpjquery框架UIhtml5
postMessage 是 HTML5 新方法,它可以实现跨域窗口之间通讯。到目前为止,只有 IE8+, Firefox 3, Opera 9, Chrome 3和 Safari 4 支持,而本篇文章主要讲述 postMessage 方法与 message 事件跨浏览器实现。postMessage 方法 JSONP 技术不一样,前者是前端擅长跨域文档数据即时通讯,后者擅长针对跨域服务端数据通讯,p