【MPI学习3】MPI并行程序设计模式:不同通信模式MPI并行程序的设计

学习了MPI四种通信模式 及其函数用法:

(1)标准通信模式:MPI_SEND

(2)缓存通信模式:MPI_BSEND

(3)同步通信模式:MPI_SSEND

(4)就绪通信模式:MPI_RSEND

四种通信模式的区别都在消息发送端,而消息接收端的操作都是MPI_RECV。

 

1.标准通信模式

原理图如下

【MPI学习3】MPI并行程序设计模式:不同通信模式MPI并行程序的设计_第1张图片

标准通信模式由MPI决定是否用缓存。

如果MPI决定缓存将要发出的数据:发送操作不管接受操作是否执行,都可以进行;而且缓存结束后发送操作就可以返回,不需要等待接受操作收到数据

如果MPI决定不缓存将要发送的数据:对于阻塞通信,则要求接受操作执行,并且数据都发送到接受缓冲区了,发送操作才能够返回;对于非阻塞通信,发送操作虽然没有完成,但是发送调用可以正确返回。

 

 

2.缓存通信模式

与标准通信的区别在于需要自己维护程序的缓冲区。

int MPI_Buffer_attach(void *buffer, int size)用于申请缓存

int MPI_Buffer_detach(void **buffer, int *size) 用于释放缓存 这是一个阻塞调用 函数返回表示缓冲区已经被释放

示例代码如下:

 1 #include "mpi.h"
 2 #include <stdio.h>
 3 #include <stdlib.h>
 4 #define SIZE 6
 5 static int src = 0;  6 static int dest = 1;  7 
 8 void generate_data(double *, int);  9 void normal_recv(double *, int); 10 void buffered_send(double *, int); 11 
12 void generate_data(double *buffer, int buff_size){ 13     int i; 14     for (i=0; i<buff_size; i++) buffer[i]=(double)i+1; 15 } 16 
17 void normal_recv(double *buffer, int buff_size){ 18     int i,j; 19  MPI_Status status; 20     double *b; 21     
22     b = buffer; 23     
24     MPI_Recv(b,(buff_size-1),MPI_DOUBLE,src,2000,MPI_COMM_WORLD, &status); 25     fprintf(stderr, "standard receive a message of %d data\n", buff_size-1); 26     for(j=0; j<buff_size-1; j++) fprintf(stderr, "buf[%d]=%f\n",j,b[j]); 27 
28     b+=buff_size-1; 29     MPI_Recv(b, 1, MPI_DOUBLE, src, 2000, MPI_COMM_WORLD, &status); 30     fprintf(stderr, "standard receive a message of one data\n"); 31     fprintf(stderr, "buf[0]=%f\n",*b); 32 } 33 
34 void buffered_send(double *buffer, int buff_size){ 35     int i,j; 36     void *bbuffer; 37     int size; 38 
39     fprintf(stderr, "buffered send message of %d data\n", buff_size-1); 40     for(j=0; j<buff_size-1; j++) fprintf(stderr, "buf[%d]=%f\n",j,buffer[j]); 41     MPI_Bsend(buffer, (buff_size-1), MPI_DOUBLE, dest, 2000, MPI_COMM_WORLD); 42     
43     buffer+=buff_size-1; 44     fprintf(stderr, "bufferred send message of one data\n"); 45     fprintf(stderr, "buf[0]=%f\n", *buffer); 46     MPI_Bsend(buffer, 1, MPI_DOUBLE, dest, 2000, MPI_COMM_WORLD); 47 
48     MPI_Buffer_detach(&buffer, &size); 49  MPI_Buffer_attach(bbuffer, size); 50 } 51 
52 int main(int argc, char *argv[]) 53 { 54     int rank; 55     double buffer[SIZE], *tmpbuffer, *tmpbuf; 56     int tsize, bsize; 57     char *test = NULL; 58 
59     MPI_Init(&argc, &argv); 60     MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank); 61 
62     if (rank==src) { // 发送消息进程 
63  generate_data(buffer, SIZE); 64         MPI_Pack_size(SIZE, MPI_DOUBLE, MPI_COMM_WORLD, &bsize); 65         tmpbuffer = (double*)malloc(bsize+2*MPI_BSEND_OVERHEAD); 66         if (!tmpbuffer) { 67             MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1); 68  } 69         // 告诉系统MPI_Bsend用到buffer就去tmpbuffer那里去找
70         MPI_Buffer_attach(tmpbuffer, bsize+2*MPI_BSEND_OVERHEAD); 71  buffered_send(buffer, SIZE); 72         MPI_Buffer_detach(&tmpbuf, &tsize); 73         printf("tsize detach from tmpbuf is : %d\n", tsize); 74  } 75     else if (rank==dest) { 76  normal_recv(buffer, SIZE); 77  } 78     else { 79         MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1); 80  } 81  MPI_Finalize(); 82 }

代码输出结果是:

【MPI学习3】MPI并行程序设计模式:不同通信模式MPI并行程序的设计_第2张图片

总共需要发送5个double类型,每个类型占8个字节;MPI通信其他附属信息占200个字节;因此总共缓冲区的大小的240个字节。

 

3.同步通信模式

同步发送进程的特点是:发送操作可以不依赖接受进程的相应接受操作是否已经启动,但是必须等着接受操作开始执行后才能返回;这意味着一旦同步发送返回后,发送缓冲区中的数据已经全部被系统缓冲区缓存。“发送缓冲区”表示MPI的缓冲区,“系统缓冲区”指的是操作系统的写缓冲区,注意二者的区别。这意味着同步发送缓冲区中的数据可以被释放或重新利用。

示例代码如下:

 1 #include "mpi.h"
 2 #include <stdio.h>
 3 
 4 #define SIZE 10
 5 
 6 static int src = 0;  7 static int dest = 1;  8 
 9 int main(int argc, char *argv[]) 10 { 11     int rank; 12     int act_size = 0; 13     int flag, np, rval, i; 14     int buffer[SIZE]; 15  MPI_Status status, status1, status2; 16     int count1, count2; 17     MPI_Init(&argc, &argv); 18     MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank); 19     MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &np); 20 
21     if (np!=2) { 22         MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1); 23  } 24     act_size = 5; /*最大消息长度*/
25     if (rank==src) { 26         MPI_Ssend(buffer, act_size, MPI_INT, dest, 1, MPI_COMM_WORLD); 27         fprintf(stderr, "MPI_Ssend %d data,tag=1\n", act_size); 28         act_size = 4; 29         MPI_Ssend(buffer, act_size, MPI_INT, dest, 2, MPI_COMM_WORLD); 30         fprintf(stderr, "MPI_Ssend %d data,tag=2\n", act_size); 31  } 32     else if (rank=dest) { 33         MPI_Recv(buffer, act_size, MPI_INT, src, 1, MPI_COMM_WORLD, &status1); 34         MPI_Recv(buffer, act_size, MPI_INT, src, 2, MPI_COMM_WORLD, &status2); 35         MPI_Get_count(&status1, MPI_INT, &count1); 36         fprintf(stderr, "receive %d data,tag=%d\n",count1, status1.MPI_TAG); 37         MPI_Get_count(&status2, MPI_INT, &count2); 38         fprintf(stderr, "receive %d data,tag=%d\n",count2, status2.MPI_TAG); 39  } 40  MPI_Finalize(); 41 }

代码执行结果如下:

【MPI学习3】MPI并行程序设计模式:不同通信模式MPI并行程序的设计_第3张图片

如果将33 34行代码互换位置,则程序陷入了deadlock:一方面发送进程中tag=1的MPI_Ssend操作一直处于阻塞状态;另一方面接受进程中的tag=2的MPI_Recv操作处于阻塞状态;两个进程互相等着对方,陷入了死锁。

 

4. 就绪通信模式

与前几种通信模式不同,只有当接受进程的接受操作已经启动时,才可以在发送端启动发送进程。

一种可能的就绪通信模式实现方法如下图:

【MPI学习3】MPI并行程序设计模式:不同通信模式MPI并行程序的设计_第4张图片

 

上图保证的目标是①要先于④执行;方法是插入②和③;①一定先于②执行,③一定等②成功后才能执行,③成功后④才能执行。

由此一定保证①先于④执行,就保证了就绪通信。

示例代码如下:

 

 1 #include "mpi.h"
 2 #include <stdio.h>
 3 #include <stdlib.h>
 4 
 5 #define TEST_SIZE 2000
 6 
 7 void test_rsend();  8 
 9 int main(int argc, char *argv[]) 10 { 11     MPI_Init(&argc, &argv); 12  test_rsend(); 13  MPI_Finalize(); 14 } 15 
16 void test_rsend() 17 { 18     int rank, size; 19     int next, prev; 20     int tag; 21     int count; 22     float send_buf[TEST_SIZE], recv_buf[TEST_SIZE]; 23  MPI_Status status; 24  MPI_Request request; 25 
26     MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank); 27     MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &size); 28 
29     if (2!=size) { 30         MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1); 31  } 32     next = rank + 1; 33     if (next >= size) next = 0; 34     prev = rank - 1; 35     if (prev <0) prev = size-1; 36 
37     if (0==rank) { 38         fprintf(stderr, " Rsend Test\n"); 39  } 40     tag = 1456; 41     count = TEST_SIZE/3; 42     if (0==rank) { 43         MPI_Recv(MPI_BOTTOM,0,MPI_INT,next,tag,MPI_COMM_WORLD, &status); 44         fprintf(stderr, " Process %d post Ready send\n", rank); 45  MPI_Rsend(send_buf,count,MPI_FLOAT,next,tag,MPI_COMM_WORLD); 46  } 47     else { 48         fprintf(stderr, " process %d post a receive call\n", rank); 49         MPI_Irecv(recv_buf, TEST_SIZE, MPI_FLOAT,MPI_ANY_SOURCE,MPI_ANY_TAG,MPI_COMM_WORLD,&request); 50         MPI_Send(MPI_BOTTOM,0,MPI_INT,next,tag,MPI_COMM_WORLD); 51         MPI_Wait(&request, &status); 52         fprintf(stderr, " Process %d Receive Rsend message from %d\n",rank, status.MPI_SOURCE); 53  } 54 }

 

代码执行结果如下:

 

【MPI学习3】MPI并行程序设计模式:不同通信模式MPI并行程序的设计_第5张图片

 

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