对于一般的分布的采样,在很多的编程语言中都有实现,如最基本的满足均匀分布的随机数,但是对于复杂的分布,要想对其采样,却没有实现好的函数,在这里,可以使用马尔可夫链蒙特卡罗(Markov Chain Monte Carlo, MCMC)方法,其中Metropolis-Hastings采样和Gibbs采样是MCMC中使用较为广泛的两种形式。
MCMC的基础理论为马尔可夫过程,在MCMC算法中,为了在一个指定的分布上采样,根据马尔可夫过程,首先从任一状态出发,模拟马尔可夫过程,不断进行状态转移,最终收敛到平稳分布。
设 Xt 表示随机变量 X 在离散时间 t 时刻的取值。若该变量随时间变化的转移概率仅仅依赖于它的当前取值,即
也就是说状态转移的概率只依赖于前一个状态。称这个变量为马尔可夫变量,其中, s0,s1,⋯,si,sj∈Ω 为随机变量 X 可能的状态。这个性质称为马尔可夫性质,具有马尔可夫性质的随机过程称为马尔可夫过程。
马尔可夫链指的是在一段时间内随机变量 X 的取值序列 (X0,X1,⋯,Xm) ,它们满足如上的马尔可夫性质。
马尔可夫链是通过对应的转移概率定义的,转移概率指的是随机变量从一个时刻到下一个时刻,从状态 si 转移到另一个状态 sj 的概率,即:
记 π(t)k 表示随机变量 X 在时刻 t 的取值为 sk 的概率,则随机变量 X 在时刻 t+1 的取值为 si 的概率为:
假设状态的数目为 n ,则有:
对于马尔可夫链,需要注意以下的两点:
如果一个马尔可夫过程既没有周期性,又不可约,则称为各态遍历的。
对于一个各态遍历的马尔可夫过程,无论初始值 π(0) 取何值,随着转移次数的增多,随机变量的取值分布最终都会收敛到唯一的平稳分布 π∗ ,即:
且这个平稳分布 π∗ 满足:
其中, P=(pi,j)n×n 为转移概率矩阵。
对于一个给定的概率分布 P(X) ,若是要得到其样本,通过上述的马尔可夫链的概念,我们可以构造一个转移矩阵为 P 的马尔可夫链,使得该马尔可夫链的平稳分布为 P(X) ,这样,无论其初始状态为何值,假设记为 x0 ,那么随着马尔科夫过程的转移,得到了一系列的状态值,如: x0,x1,x2,⋯,xn,xn+1,⋯, ,如果这个马尔可夫过程在第 n 步时已经收敛,那么分布 P(X) 的样本即为 xn,xn+1,⋯ 。
对于一个各态遍历的马尔可夫过程,若其转移矩阵为 P ,分布为 π(x) ,若满足:
则 π(x) 是马尔可夫链的平稳分布,上式称为细致平稳条件。
Metropolis采样算法是最基本的基于MCMC的采样算法。
假设需要从目标概率密度函数 p(θ) 中进行采样,同时, θ 满足 −∞<θ<∞ 。Metropolis采样算法根据马尔可夫链去生成一个序列:
其中, θ(t) 表示的是马尔可夫链在第 t 代时的状态。
在Metropolis采样算法的过程中,首先初始化状态值 θ(1) ,然后利用一个已知的分布 q(θ∣θ(t−1)) 生成一个新的候选状态 θ(∗) ,随后根据一定的概率选择接受这个新值,或者拒绝这个新值,在Metropolis采样算法中,概率为:
这样的过程一直持续到采样过程的收敛,当收敛以后,样本 θ(t) 即为目标分布 p(θ) 中的样本。
基于以上的分析,可以总结出如下的Metropolis采样算法的流程:
要证明Metropolis采样算法的正确性,最重要的是要证明构造的马尔可夫过程满足如上的细致平稳条件,即:
对于上面所述的过程,分布为 p(θ) ,从状态 i 转移到状态 j 的转移概率为:
其中, Qi,j 为上述已知的分布。
对于选择该已知的分布,在Metropolis采样算法中,要求该已知的分布必须是对称的,即 Qi,j=Qj,i ,即
q(θ=θ(t)∣θ(t−1))=q(θ=θ(t−1)∣θ(t))
常用的符合对称的分布主要有:正态分布,柯西分布以及均匀分布等。
接下来,需要证明在Metropolis采样算法中构造的马尔可夫链满足细致平稳条件。
因此,通过以上的方法构造出来的马尔可夫链是满足细致平稳条件的。
假设需要从柯西分布中采样数据,我们利用Metropolis采样算法来生成样本,其中,柯西分布的概率密度函数为:
那么,根据上述的Metropolis采样算法的流程,接受概率 α 的值为:
代码如下:
''' Date:20160629 @author: zhaozhiyong '''
import random
from scipy.stats import norm
import matplotlib.pyplot as plt
def cauchy(theta):
y = 1.0 / (1.0 + theta ** 2)
return y
T = 5000
sigma = 1
thetamin = -30
thetamax = 30
theta = [0.0] * (T+1)
theta[0] = random.uniform(thetamin, thetamax)
t = 0
while t < T:
t = t + 1
theta_star = norm.rvs(loc=theta[t - 1], scale=sigma, size=1, random_state=None)
#print theta_star
alpha = min(1, (cauchy(theta_star[0]) / cauchy(theta[t - 1])))
u = random.uniform(0, 1)
if u <= alpha:
theta[t] = theta_star[0]
else:
theta[t] = theta[t - 1]
ax1 = plt.subplot(211)
ax2 = plt.subplot(212)
plt.sca(ax1)
plt.ylim(thetamin, thetamax)
plt.plot(range(T+1), theta, 'g-')
plt.sca(ax2)
num_bins = 50
plt.hist(theta, num_bins, normed=1, facecolor='red', alpha=0.5)
plt.show()
实验的结果:
对于Metropolis采样算法,其要求选定的分布必须是对称的,为了弥补这样的一个缺陷,在下一篇中,介绍一下Metropolis-Hastings采样算法,其是Metropolis采样算法的推广形式。