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2019/0715_生物信息学R语言教程——book

目录前言第一章R/Bioconductor入门第二章:基因芯片分析第三章RNA-seq数据分析第四章ChIP-seq数据分析第五章ATAC-seq数据分析第六章scRNA-seq数据分析第七章下游分析第八章上游分析第九章代码背后

uqyuan0515·2020-09-13 03:33

20190904_chip-seq/ ATAC-seq/DAP-seq 原理理解

染色质免疫共沉淀ChromatinImmunoprecipitation,ChIP技术是指：在保持组蛋白和DNA联合的同时，通过运用对应于一个特定组蛋白标记的生物抗体，染色质被切成很小的片断，并沉淀下来

uqyuan0515·2020-09-13 03:02

20190618——网络程序设计多线程

具有这种能力的系统包括对称多处理机、多核心处理器以及芯片级多处理（Chip-levelmultithreading）或同时多线程（Simultaneousmultithreading）处理器。

宫城诗·2020-09-12 20:12

多核

多核1概述多内核（multicorechips）是指在一枚处理器（chip）中集成两个或多个完整的计算引擎(内核)。

weixin_33912638·2020-09-12 14:14

计算机常用英语词汇表(硬件类)

randomaccessmemory)随机存储器(内存)ROM(ReadOnlyMemory)只读存储器FloppyDisk软盘HardDisk硬盘CD-ROM光盘驱动器(光驱)monitor监视器keyboard键盘mouse鼠标chip

Mr_xiong_·2020-09-12 12:18

使用R语言的正确姿势，R包干货奉献

生物信息学习的正确姿势NGS系列文章包括NGS基础、在线绘图、转录组分析（Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析

生信宝典·2020-09-11 23:00

杂谈FTL

NANDflash的组成一个典型的Flash芯片由Package,die,plane,block和page组成，如下图：Package:也就是chip即Flash芯片，就是我们经常在M.2的SSD上看到的

Gick·2020-09-10 20:47

u-boot nand flash read/write cmd

函數調用關係如下(按先後順序)：staticvoidnand_print(structnand_chip*nand);2.nanderase功能：擦除指定塊上的數據

jmhgg88·2020-09-10 14:22

Altera推出Stratix 10 FPGA芯片：整合四核A53和HBM2内存

Stratix10FPGA的单精输出可达10TFLOPS、本地内存带宽10Tbps、chip-to-chip带宽更是有30Gbps。

weixin_33819479·2020-09-10 09:46

解决zigbee CC2530/CC2630 用Flash Programmer下载hex文件，提示Chip is locked! Not able to read IEEE address

先用smartRFFlashprogrammer的Erase选项擦除芯片(先不要勾选Eraseandprogram)，擦除成功后就可以使用了。原因是厂家写入了lockbit

STCNXPARM·2020-08-26 11:40

牛津阅读树人物介绍

梦想：长大后成为地质学家Chip年龄：7岁（和Biff是一对双胞胎）就读学校：Ortree小学性格特点：最喜欢蓝色，爱好和睦，最不喜欢争吵。兴趣爱好：画画，骑自行车，找东西也是他的一大

tough_2017·2020-08-25 16:33

2020-02-19

Chip-seq流程sra-tools下载安装#加压包tarzxfsra-tools.tar.gz#将来需要调用的命令都在bin文件夹中，更改环境变量(全局)，>>的意思是追加不是覆盖，以下路径需要自己主动变更

DrLyo·2020-08-25 15:24

【万科V-learn父母学院-家庭双语启蒙】1705-140-Chip-2017年10月14日

用心陪伴每一天1音频peppapig第1季1-5集、牙牙学语12动画/电影MonstersUniversity15分钟3儿歌与游戏鉴于宝宝的体重已经不那么容易扛，从衣柜里翻出了一个装被子的大袋子。大布袋子真好用，可以玩好些游戏。HandyDandyI’mawolf.Let’splayhandydandy.Ifyouguessright,I’llgiveyouabighug.Ifyouguesswr

水中的珊瑚雨·2020-08-25 06:27

绘本讲师训练营【9期英文】10/21《Missing》

cover图片1笼子的门是开着的，自然是小仓鼠逃跑了……图片2图片3图片4图片5图片6图片7图片8图片9图片10小仓鼠不见了，Biff、Chip、Na

梅青_媛媛妈·2020-08-25 01:28

halcon锐化、增强灰度、镜像、反转、旋转、缩放

read_image(Image,‘printer_chip/printer_chip_01’)*锐化emphasize(Image,ImageEmphasize,7,7,1)*亮度调节illuminate

昨晚早睡了没·2020-08-25 01:22

Halcon 点、轮廓、区域

read_image(Image,‘printer_chip/printer_chip_01’)*与轮廓（xld）相关关键字contourpolygondev_set_color(‘red’)gen_rectangle1

昨晚早睡了没·2020-08-25 01:51

基因功能富集小结

为什么要做GO富集在生物学问题分析时，无论是通过转录组还是chip-seq等其他组学技术获得一大堆的差异基因之后，给大家留下的一个问题就是，这些差异基因属于什么功能？可能参与哪些通路？

Neptuneyut·2020-08-25 01:28

HDU-5536 Chip Factory

先把各个数转为二进制存在字典树中，因为要保证i，j，k不同，所以枚举i，j的和的同时把i，j从字典树删除，等进行完异或后再插入复原。不用字典树，暴力也可以解决#include#include#includeusingnamespacestd;constintN=1e6+5;inttot,trie[N][2],n,a[1005],ans,cnt[N];voidinit(){for(inti=0;i=

qq_25243147·2020-08-24 22:10

【闸机】UID-菜鸟篇

#defineSTM32ADD_CHIP_ID0x1FFF7A10#defineSTM32ADD_CHIP_FLASHSIZE0x1FFF7A22voidGet_ChipID(unsignedchar*

GKoSon·2020-08-24 11:02

hdu5536Chip Factory

算机学院大学生程序设计竞赛（新生为主）ChipFactoryTimeLimit:18000/9000MS(Java/Others)MemoryLimit:262144/262144K(Java/Others)TotalSubmission(s):640AcceptedSubmission(s):320ProblemDescriptionJohnisamanagerofaCPUchipfactory

_____________kk·2020-08-24 10:03

【万科V-learn父母学院-家庭双语启蒙】1705-140-Chip-2017年8月20日

用心陪伴每一天1音频幼儿英语0b轮播，幼儿汉语第一册上2动画0alollipop,walking,threelittleducks,happynewyear3儿歌与游戏a、thefiremen在路边看到有个叔叔爬梯子修网线，车上还有一个梯子M:look,aladder,theuncleisclimbingtheladder.C:twoladder,big.M:Yes,there'sanotherl

水中的珊瑚雨·2020-08-24 09:44

EFM32片内外设---USART2

#include#include"string.h"#include"BlueTooth.h"#include"HandUart_new.h"#include"efm32.h"#include"em_chip.h

year123489·2020-08-24 06:41

开源OpenSDA烧写CMSIS-DAP

作者：Pewillxing学习笔记：本次测试是珠海鼎芯科技（D-CHIP）K22处理器主板。学习飞思卡尔的MCU首先从仿真器开始，飞思卡尔的仿真器是OpenSDA。

pewill·2020-08-24 06:23

STM32的CAN总线使用

本次调试使用的是珠海鼎芯科技（D-Chip）的STM32核心板。这块核心板上包含了一个CAN总线驱动器。可以很方便的同时与多个种工业设备连接通讯。

pewill·2020-08-24 06:52

MEM-CHIP学习笔记

MEME-ChIP网址MEM-ChIP的特性MEM-ChIP程序可以对你提供的DNA序列进行一系列的motif分析，他特别适合用来分析在Chip-Seq试验中发现的基因结合区域。

面面的徐爷·2020-08-23 21:12

R-loop数据分析之R-ChIP(环境准备)

提高自己分析能力的一个好的方法就是重复别人文章里的分析策略，所以这里会尝试对第一篇介绍R-ChIP技术文章"R-ChIPUsingInactiveRNaseHRevealsDynamicCouplingofR-loopswithTranscriptionalPausingatGenePromoters

徐洲更hoptop·2020-08-23 08:13

serial-input, parallel-output (SIPO) chip : TPIC6595 , 74HC164 , 74HC4094 or 74HC595

http://electronics.stackexchange.com/questions/6676/which-sipo-chip-is-better-74hc4094-or-74hc595-or-something-elseIwanttodrivelotsofLEDsinaspinningpersistence-of-vision

weixin_33749131·2020-08-23 08:51

驱动编程之 Regmap

Regmap除了能做到统一的I/O接口,还可以在驱动和硬件IC之间做一层缓存,从而能减少底层I/O的操作次数Regmap拓扑结构首先看一下硬件表达/**该数据结构表示rk808芯片*用这个结构体定义的变量名为chip

雪松研究所·2020-08-22 22:50

有关DDR MEMORY 的prefetch

所谓的n指的是chip对外的I/Owidth。以DDR3为例，它的IOgatingbuffer与FIFO的接口宽度是FIFO与外部IO的接口宽度的8倍。对于8bits位宽的DDR3MEM

jackle_zheng·2020-08-22 21:44

IC设计未来趋势：从RTL向ESL转移

当SOC设计越来越成为未来IC发展方向的同时，集成电路设计转向更小的几何尺寸和工艺向90纳米及以下技术发展，一个chip将容纳门数达数百万甚至上千万的电路。工艺尺寸的缩小可能带来低良率的问题。

yesky12·2020-08-22 20:21

Opcodes 说明

在rocket-chip中对opcodes进行定制化的过程主要是在riscv-tools/riscv-opcodes目录中：.

weixin_33991418·2020-08-22 14:03

一 linux spi子系统(框架)

.spi设备structspi_device{structdevicedev;//设备文件structspi_master*master;//spi主机u32max_speed_hz;//最大速率u8chip_select

paomadi·2020-08-22 10:30

Ec/Io Eb是什么？

Ec/Io：Energy（能量）的简称，3.84Mcps中的chip的平均能量，注意是能量，其单位是焦耳。o是Ec/Io：体现了所接收信号的强度和邻小区干扰水平的比值。

gtkknd·2020-08-22 10:32

linux spi子系统(框架) .

structspi_device{structdevicedev;//设备文件structspi_master*master;//spi主机u32max_speed_hz;//最大速率u8chip_select

gjy938815·2020-08-22 09:57

soc中的多时钟设计/详细解释亚稳态/复位/毛刺/多bit同步问题/跨时钟设计原则

转自FPGA中的多时钟设计多种独立时钟在SoC（system-on-chip）设计中已普遍存在。很多SoC设备接有许多接口，这些接口根据标准运用了完全不同的时钟频率。

cy413026·2020-08-22 09:54

非编码基因调控转录因子的研究思路

RNA-IP、ChIP和双荧光素酶机制实验验证了互作

博士苑·2020-08-21 12:55

交叉熵、相对熵(KL散度)、JS散度和Wasserstein距离(推土机距离)

定义：假设XXX是一个离散型变量，其取值集合为χ\chiχ，概率分布函数为：p(x)=Pr(X=x),x∈χp(x)=Pr(X=x),x\in\chip(x)=Pr(X=x),x∈χ则事件X=x0X=x

魏晋小子·2020-08-21 08:10

TX1 flash backup & restore

/tegraflash.py--blcboot.bin--appletnvtboot_recovery.bin--chip0x21--cmd"readAPPmy_backup_image_APP.img

weixin_34128237·2020-08-21 06:06

树莓派红外接收 RPi2 gpio chip not found lirc_rpi

闲来无事继续折腾树莓派，相信网上很多关于树莓派通过GPIO得到红外控制的文章。基本的设置什么的我就不写了，度娘一搜一堆，都是一个步骤。我不知道是不是大家都是这么顺利，但是在我的树莓派上面遇到了，首先通过apt-getinstalllirc之后，是没有“/dev/lirc0”这个module出现的。通过一番搜索之后好像是lirc_serial.ko这个文件没有载入到内核中。执行insmodlirc_

oHHPo·2020-08-21 02:34

树莓派 -- 按键（key）使用BCM2835 gpio library

BCM2835GPIOlibrary介绍ThisisaClibraryforRaspberryPi(RPi).ItprovidesaccesstoGPIOandotherIOfunctionsontheBroadcomBCM2835chip

feiwatson·2020-08-21 02:42

ATAC-Seq入门加高阶传送门

转录组、甲基化、ChIP-Seq、lncRNA、编程实战、还有已经在更新中的Hi-C......几乎大家关心的数据分析都可以在大树里找到入门和进阶教程。

六六_ryx·2020-08-20 19:36

set_irq_type() -- 设置中断触发类型/方式

linux-2.6.21.7/kernel/irq/chip.c------------------------------------------------/***set_irq_type-settheirqtypeforanirq

公子烨·2020-08-20 18:10

CC1310片内固件升级笔记（二）

/docs/proprietary-rf/proprietary-rf-users-guide/cc13x0/oad-easylink/oad_onchip.html#sect-bim-for-on-chip-oad

ruson525·2020-08-20 18:54

MPU6050 dmp 无法测得数据的问题

首先用DEBUG模式，定位到是哪一句出了问题，，st.chip_cfg.dmp_on这个值不等于1，所以无法正常运行。

localareanetwork·2020-08-20 16:20

计算机组成原理实验

>>>作业内容(提交电子版：实验报告文档+项目工程文档)：重要要求：仿真程序输出中要包含自己的学号设计一个计算机系统：CPU＋on_chip_ram＋JTAGUART+“hello_world_small

weixin_34054866·2020-08-20 08:07

CPU：chip、core 和 processor 的关系

#查看物理CPU个数（chip）cat/proc/cpuinfo|grep"physicalid"|sort|uniq|wc-l#查看每个物理CPU中core的个数（core）cat/proc/cpuinfo

ztguang·2020-08-20 08:47

牛津树1-3阶大总结

牛津树陪伴了麦麦（33-34个月）2017年的整个暑假，妈妈在这里做个总结图片来自网络一、人物图片来自网络一家五口Dad,Mum,Chip,Biff,Kipper好伙伴Floppy朋友Wilma,Sam

璟色禾田·2020-08-20 05:53

成长的足迹

图片发自App之后我们一起读了chip'slettersounds，这次

涛妈妈·2020-08-20 04:08

【万科V-learn父母学院-家庭双语启蒙】1705-140-Chip-2018年7月第二周打卡

用心陪伴每一天1音频2a、peppapig精听课schoolplay、字母发音歌、婷婷唱古文、中国传统故事、凯叔声律启蒙2动画peppapig1-2；牙牙学语《滑滑梯》3儿歌与游戏SittingonthecarpetRingaroundtherosesFriendsIlovethezooThelittleredridinghoodandthebigbadwolfThreelittlepigsand

水中的珊瑚雨·2020-08-20 04:09

linux驱动（第二十四课 PWM）

structpwm_chip{structdevice*dev;conststructpwm_ops*ops;intbase;unsignedint

Huskar_Liu·2020-08-20 02:34

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