​Laml

13 对发生拷贝数变异的基因进行 KEGG 注释

我们同样用VEP注释后的maf文件，然后取出需要用到的几列rm(list=ls())options(stringsAsFactors=F)library(dplyr)library(stringr)#读入数据laml
正在输入中…………·2023-11-16 11:28

用maftools一行代码画出瀑布图

library(maftools)laml.maf<-system.file("extdata","tcga_laml.
gtt儿_生物信息学习·2023-11-02 16:22

R语言读文件防止行名、列名中有的字符变成点号

我有一个TCGA的表达谱文件，用Excel打开长这样：image.png我用R的read.table功能读取该表格：e<-read.table("TCGA-LAML.htseq_counts.tsv",
Seurat_·2023-10-11 13:54

TCGA|根据somatic mutation绘制突变景观图（oncoplot）和基因词云

使用XENA**的TCGA-LAML.mutect2_snv.tsv文件绘制基因词云和突变景观图。
Seurat_Satija·2023-09-29 15:55

TCGA 拷贝数变异（CNV）–使用maftools读取和汇总gistic输出文件（三）

AnalyzeandVisualizeMAFFilesrm(list=ls())library(tidyverse)#建议下载github最新版本的maftools包library(maftools)#读入GISTIC输出的文件laml.gistic
庄小尽·2021-03-14 23:33

R语言读文件防止行名、列名中有的字符变成点号

我有一个TCGA的表达谱文件，用Excel打开长这样：image(3).png我用R的read.table功能读取该表格：e<-read.table("TCGA-LAML.htseq_counts.tsv
灵魂工具人·2020-12-23 11:52

UCSC xena 浏览器才是最简单的TCGA数据下载途径

同时也提供相应的可视化工具：https://xenabrowser.net/heatmap/癌症种类列表如下：GDCTCGAAcuteMyeloidLeukemia(LAML)GDCTCGAAdrenocorticalCancer
生信技能树·2019-12-21 22:35

​Laml环境安装wordpress外加nginx负载均衡并实现phpmyadmin平滑升级！

Laml环境安装wordpress外加nginx负载均衡并实现phpmyadmin平滑升级注意:我这里使用lamp搭建wordpress使用的全部都是rpm安装,如果有想要学习编译安装的朋友,可以参考另外一位午饭的博客
329984300·2015-01-10 21:24
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