CAT12

利用CAT12做皮层指标的统计分析及可视化笔记记录

利用CAT12做皮层指标的统计分析及可视化文章目录利用CAT12做皮层指标的统计分析及可视化前言一、统计步骤1.BasicModels2.EstimateSurfaceModels3.Results二、

长腿猴子请来的救兵·2023-10-28 22:54

利用dpabi和restplus提取ROI灰质体积学习笔记

目录前言一、数据准备二、利用dpabi提取ROI灰质体积三、restplus提取ROI灰质体积前言我利用SPM/CAT12进行灰质、白质、脑脊液分割之后分别已经得到各自的图像文件，在全脑水平已经做了统计分析

长腿猴子请来的救兵·2023-10-28 22:54

基于cat12和SPM12进行VBM数据分析

一、基于cat12和SPM12进行VBM数据分析VBM能定量计算局部灰质体素的大小和信号强度，从而能够检测出局部脑区的特征和脑组织成分的差异。

此起彼伏Cccc·2023-10-01 09:32

Linux命令-文件管理

：cd3，清屏：clear4，显示当前路径：pwd5，创建目录：mkdir6，创建文件：touch7，拷贝文件：cp8，移动文件：mv9，删除目录：rmdir10，删除文件：rm11，查看或合并文件：cat12

张兵游勇·2023-03-27 00:15

CAT12中纵向数据Basic Models在SPM12中Estimate后出现Design Matrix错误不能Define contrast的解决办法

CAT12中纵向数据BasicModels在SPM12中Estimate后出现DesignMatrix错误不能Definecontrast的解决办法问题复现问题定位解决问题问题复现MATLAB版本2018a

Zilei_Tian·2023-01-17 09:46

VBM计算操作过程记录

2.使用cat12分割。在每个被试下面生成3个文件夹（内含各种数据）。3.计算TIV。健康组和癫痫组各一个txt文件。4.计算smooth。

伏城无嗔·2022-12-20 07:03

基于SPM8或CAT12进行的VBM分析

基于SPM8或CAT12进行的VBM分析需要的工具：Matlab及SPM8/SPM12一、SPM8/12的VBM分析1）首先将DICOM格式转换为NIFTI格式；2）用display查看图像，可以手动进行

mollyue·2022-12-20 07:32

Linux常用命令大全

文件处理命令：ls4、文件处理命令：cd5、文件处理命令：pwd6、文件处理命令：touch7、文件处理命令：mkdir8、文件处理命令：cp9、文件处理命令：mv10、文件处理命令：rm11、文件处理命令：cat12

小鹿快跑～·2022-09-03 04:22

基于cat12搞定VBM的ROI分析——vertex水平和ROI水平的双样本T检验

前言本来上周要更新此篇的，但由于本身有问题没有解决清楚，再加上导师给了数据处理的任务下来了，两下耽搁，就等到现在了。上回说到，做了VBM和SBM的指标提取及双样本T检验的统计分析，那接下来我们还可以做什么呢，可以从许多文献中看到，有的不仅仅只计算每个体素指标值之间的差异，还会想到要将其放到各个脑区上，比较指标在脑区之间的差异，而ROI分析就是问了解决这个问题。需要注意的是，目前小编通过cat12.

@Beta·2021-01-30 11:25

基于Pycharm的文件批处理1（python脚本笔记记录）——复制所需文件到指定文件夹中，文件夹按照被试编号命名

前言现在磁共振数据的被试量越来越多，所扫描的图像也就更多，量小的几十个，量大的成百上千，而且不论是DPABI、cat12、SPM12还是其他工具包，都需要将数据整理成合适的格式才能方便做数据处理，手动处理必将费时费力

@Beta·2021-01-29 16:41

基于cat12和SPM12进行SBM数据分析笔记

前言——小白二顿操作猛如虎，搞定SBM期末考试结束了，可以安心干活了，纠结了好久，还是选择放弃一些，舍得舍得，有舍才有得。给自己立个小flag，下周三之前把所有的培训作业再重新完完整整做完，并写下这些堆积已久的blog。还是那句话，初心不改，继续向前，简单就好。言归正传，回到小编被折磨良久的SBM，当然深受折磨也是因为这将是我接下来几个月里面的主要工作。老规矩，初学者，在这记录自己的学习笔记总结，

@Beta·2021-01-09 15:40

基于cat12和SPM12进行大脑VBM数据分析笔记2——统计分析

小白一顿操作猛如虎——拿下VBM的双样本t检验前言培训的deadline到了，小编需要交作业了，所以就在此先把笔记记下来。作业需要提交一个报告，but这个报告我应该如何写呢，培训总结？哎，现在还是不清楚，先写着blog吧，或许写着写着就有了idea。上回说到VBM的预处理，只是简单写了操作，目的也只是为了让大家在不知到原理的情况下也能通过自己手动操作得到结果，在做的过程中，大家就会产生各种问题，比

@Beta·2020-12-04 20:20

基于cat12和SPM12进行VBM&SBM数据分析笔记1——数据预处理

前言今年是小编步入研究生生活的第一年，研究方向待定，但主要以磁共振成像为主，以后会不断地总结这方面的知识，涉及MRI，数据分析基础方法理论，软件操作教程，文献阅读笔记总结等等，用来记录我的研究生三年学习过程。文章编写尽量保证简洁明了，通俗易懂，本就是小白，也能体会小白的痛。不过这也要谢谢一个人手动@小白（网名），他总是不断提醒我要把自己所学的写下来，讲出来才能真正的做到输入和输出，查漏补缺，因此他

@Beta·2020-10-14 14:12

SPM12批量处理预处理数据

思路：经调研，使用软件CAT12和FreeSurfer都可以处理，但FreeSurfer更加耗时，而且之前我也总结过CAT12与Freesurfer的对比https://g

Galory·2020-08-19 20:32

shell编程—— EOF 实现执行sql，输出结果

例1：#cat12>34D>EOF1234D例2：#cat>>filenameDHA>

gaochao1995·2020-07-15 23:21

CAT12（spm12）MRI图像预处理

文章目录CAT12（spm12）MRI图像预处理数据来源AC校正（Reorient）分割去颅骨和分割配准到MNI空间调制（Modulation）输出文件格式参考CAT12（spm12）MRI图像预处理由于在做基于深度学习的阿尔兹海默症分类项目

咸yu奶糖·2020-07-10 14:49

脑图像分析基本环境配置：MATLAB + SNAP + DiffusionKit + SPM12 + CAT12

1、安装MATLAB，此处版本为MATLABR2015b。2、使用ADNI作为实验数据集。安装SNAP用于查看.nii图像，此处版本为ITK-SNAP3.8。3、使用DiffusionKit进行图像配准。若未配准，后期可能会出现以下错误：配准方法：（1）在Brainnetome官网下载DiffusionKit工具包并安装（点击此处查看使用指南）。（2）打开CMD进入DiffusionKit目录，通

-Cooper-·2019-05-19 18:17

【ADNI】数据预处理（1）SPM，CAT12；数据集

ADNISeries1、【ADNI】数据预处理（1）SPM，CAT122、【ADNI】数据预处理（2）获取subjectslices3、【ADNI】数据预处理（3）CNNs4、【ADNI】数据预处理（4）GettopkslicesaccordingtoCNNs5、【ADNI】数据预处理（5）Gettopkslices(pMCI_sMCI)accordingtoCNNs6、【ADNI】数据预处理（6

Houchaoqun_XMU·2018-11-01 11:48

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