SPM12

关于nifti文件的int16和float32数据类型的问题

有时候用spm12的Display选项打开nifti之后发现nifti数据文件的数据类型是不一样的，比如int16和float32，会心生疑惑，两种数据类型对数据分析有影响吗？
Galory·2024-02-05 10:40

批量dicom格式转nii（dcm2nii），目前网上最全总结与最强转换方法！！

使用matlab中的spm12软件转换，代码如下：matlabbatch{1}.spm.util.import.dicom.d
程序员老冉·2024-01-03 20:16

使用SUIT进行小脑体积分割与皮层计算

软件下载地址：官网地址SUIT3.5本次演示所采用的软件是SUIT3.3版本，Windows10，SPM12环境。最新版运行或许会出现部分不兼容问题。
神经影像数据处理·2023-10-20 17:12

基于cat12和SPM12进行VBM数据分析

一、基于cat12和SPM12进行VBM数据分析VBM能定量计算局部灰质体素的大小和信号强度，从而能够检测出局部脑区的特征和脑组织成分的差异。
此起彼伏Cccc·2023-10-01 09:32

Dicom批量转nii（医学影像格式转换，SPM）

Dicom批量转nii（医学影像格式转换，SPM）实验中需要用spm12进行配准，spm12配准只能导入nii格式，但影像是dicom格式的，需要先进行格式转换。
二亩三分地·2023-04-20 11:57

批量dicom格式转nii（dcm2nii），目前网上最全总结与最强转换方法！！

使用matlab中的spm12软件转换，代码如下：matlab
阿煜啊·2023-04-20 11:55

CAT12中纵向数据Basic Models在SPM12中Estimate后出现Design Matrix错误不能Define contrast的解决办法

CAT12中纵向数据BasicModels在SPM12中Estimate后出现DesignMatrix错误不能Definecontrast的解决办法问题复现问题定位解决问题问题复现MATLAB版本2018a
Zilei_Tian·2023-01-17 09:46

使用freesurfer和3Dslicer进行脑区分割和电极定点（日常记录）

一、前期准备Linux系统安装Freesurfer、MATLAB插件spm12、fieldtrip，Windows下载mricron、Slicer3D（需要插件SlicerFreeSurfer）软件文件准备
zQIANYUN·2023-01-08 16:04

利用matlab的SPM12功能核磁共振成像数据处理_Auditory fMRI data（三）

**3Modelspecification,reviewandestimation模型估计**Pressthe“Specify1st-level”button，然后按以下步骤操作即可。SPMwillthenwriteanSPM.matfiletotheDIR/classicaldirectory，SPM还可以绘制出实验设计矩阵。从matlab出现的design界面可以选择Design>Explor
zdlu·2022-12-20 07:02

基于SPM8或CAT12进行的VBM分析

基于SPM8或CAT12进行的VBM分析需要的工具：Matlab及SPM8/SPM12一、SPM8/12的VBM分析1）首先将DICOM格式转换为NIFTI格式；2）用display查看图像，可以手动进行
mollyue·2022-12-20 07:32

spm mri segmentation：GM,WM,CSF 及DARTEL normalize

spm12一、segmentvolumes->specify->要分割的.nii文件一共三个tissue,每个tissue里有一个NativeTissue按顺序：第一个NativeTissue:Native
清舞sunny·2022-12-20 07:00

医学图像处理（一）dicom数据转换为nii

dicom数据转换为nii可以用SPM12自带的DICOMImport转换，也可以使用MRIConvert软件转换。
哈哈哈懒婷·2022-12-06 23:04

基于Pycharm的文件批处理1（python脚本笔记记录）——复制所需文件到指定文件夹中，文件夹按照被试编号命名

前言现在磁共振数据的被试量越来越多，所扫描的图像也就更多，量小的几十个，量大的成百上千，而且不论是DPABI、cat12、SPM12还是其他工具包，都需要将数据整理成合适的格式才能方便做数据处理，手动处理必将费时费力
@Beta·2021-01-29 16:41

基于DPABI和SPM12的任务态fMRI分析笔记1——预处理

基于DPABI和SPM12的任务态fMRI分析笔记——预处理前言本来这周末打算把结构态剩下的ROI部分写完更新，但是发现没那么容易，有一些问题没有想明白，为了不误导大家，所以那个先停更一下，不过小编为了弥补自己的
@Beta·2021-01-24 11:38

基于cat12和SPM12进行SBM数据分析笔记

前言——小白二顿操作猛如虎，搞定SBM期末考试结束了，可以安心干活了，纠结了好久，还是选择放弃一些，舍得舍得，有舍才有得。给自己立个小flag，下周三之前把所有的培训作业再重新完完整整做完，并写下这些堆积已久的blog。还是那句话，初心不改，继续向前，简单就好。言归正传，回到小编被折磨良久的SBM，当然深受折磨也是因为这将是我接下来几个月里面的主要工作。老规矩，初学者，在这记录自己的学习笔记总结，
@Beta·2021-01-09 15:40

基于cat12和SPM12进行大脑VBM数据分析笔记2——统计分析

小白一顿操作猛如虎——拿下VBM的双样本t检验前言培训的deadline到了，小编需要交作业了，所以就在此先把笔记记下来。作业需要提交一个报告，but这个报告我应该如何写呢，培训总结？哎，现在还是不清楚，先写着blog吧，或许写着写着就有了idea。上回说到VBM的预处理，只是简单写了操作，目的也只是为了让大家在不知到原理的情况下也能通过自己手动操作得到结果，在做的过程中，大家就会产生各种问题，比
@Beta·2020-12-04 20:20

基于cat12和SPM12进行VBM&SBM数据分析笔记1——数据预处理

前言今年是小编步入研究生生活的第一年，研究方向待定，但主要以磁共振成像为主，以后会不断地总结这方面的知识，涉及MRI，数据分析基础方法理论，软件操作教程，文献阅读笔记总结等等，用来记录我的研究生三年学习过程。文章编写尽量保证简洁明了，通俗易懂，本就是小白，也能体会小白的痛。不过这也要谢谢一个人手动@小白（网名），他总是不断提醒我要把自己所学的写下来，讲出来才能真正的做到输入和输出，查漏补缺，因此他
@Beta·2020-10-14 14:12

预计的数据分析流程以及一些问题

1.数据预处理（到smooth）SPM12（去掉前10层，时间层校正，头动校正，功能像结构像对齐，结构像分割，Normalise到标准空间，Smooth）2.数据预处理之detrend和filter，回归掉
Iris_bysshqx17·2020-08-22 00:56

SPM12批量处理预处理数据

之前写过一篇https://www.jianshu.com/p/8f16cbbfd962，当时只是初步学会，还未熟练应用。经过几次实践，现总结下通用的流程。从一个问题出发：问题：我想计算海马体积、内嗅皮层体积和内嗅皮层厚度等等。思路：经调研，使用软件CAT12和FreeSurfer都可以处理，但FreeSurfer更加耗时，而且之前我也总结过CAT12与Freesurfer的对比https://g
Galory·2020-08-19 20:32

Image registration (longitudinal studies) in SPM

主要阅读下面的这一篇paper，关于怎么用spm12中新增的toolbox做的longitudinalregistration，然后在这里面提到的一些概念的解读以及data的来源都可以在下面的网页中找到
Yuinfen·2020-08-16 05:19

.img/.hdr格式转.nii格式的方法

MATLAB转格式,需要使用spmpackage(https://github.com/neurodebian/spm12).
咸鱼酱·2020-07-30 19:53

利用matlab的SPM12进行功能核磁共振成像数据处理_Auditory fMRI data（四）

懒癌患者可以直接利用SPM12batchscript的代码对数据处理进行操作，连数据都不需要下载，直接打开matlab,运行以下代码即可。data_path=fileparts(mfilename('fullpath'));ifisempty(data_path),data_path=pwd;endfprintf('%-40s:','DownloadingAuditorydataset...');
zdlu·2020-07-11 16:13

SPM12 核磁数据预处理 傻瓜攻略

写在最前：鉴于我自己脑子傻，请不要迷信这篇文章的方法的正确性，数据分析的方法真的很多，基于数据的差异可能在一些地方的设置或数据处理步骤都会有差异！也希望发现这篇文章哪里有错误或可以改进的大神可以评论指出，蟹蟹~人生最痛苦的事不是没得选择，而是选择太多而不知道究竟哪个是对的。这份傻瓜攻略写给我自己，因为我真的服了自己的脑子了。咋么能这么傻呢？希望有人看到这篇文章之后可以不需要再看其它的文章就可以顺利
Iris_bysshqx17·2020-07-10 21:04

CAT12（spm12）MRI图像预处理

文章目录CAT12（spm12）MRI图像预处理数据来源AC校正（Reorient）分割去颅骨和分割配准到MNI空间调制（Modulation）输出文件格式参考CAT12（spm12）MRI图像预处理由于在做基于深度学习的阿尔兹海默症分类项目
咸yu奶糖·2020-07-10 14:49

医学图像文件dicom格式转化成img映象文件

由于学习中有用到img格式的文件，而手头上只有dcm格式的文件数据，所以就想把后缀为dcm的医学图像文件转化为后缀为img的映象文件，话不多说，用到的是软件spm12（其实就是一个压缩包）和matlab2017b
forever0_0love·2020-07-02 00:19

.img/.hdr格式转.nii格式的操作

MATLAB转格式,需要使用spmpackage(https://github.com/neurodebian/spm12).
·2020-07-01 12:38

fMRI处理：基于spm的dparsf

dparsf安装dparsf是基于matlab的spm，我是网上下载spm12和最新版本的dparsf的安装包，然后添加到matlab路径，就可以使用了。在ma
Jowing乔·2020-06-29 01:20

利用matlab的SPM12功能核磁共振成像数据处理_Auditory fMRI data（二）

2.3Segmentation图像分割第一步：Highlightthe“Volumes”fieldandthenselectthesubject’sregisteredanatomicalimageeg.sM00223_002.img.第二步：Highlight“SaveBiasCorrected”andselect“SaveBiasCorrected”.第三步：Highlight“Deforma
zdlu·2020-06-25 03:27

Spm12 入门教程

SPM12使用一种标准3D（有些情况下是4D）图像格式，称为NIfTI-1.1。每个NIfTI格式的图像是一个扩展名为“.nii”的文件。
小小脸庞·2020-06-21 22:34

走进脑科学计划：（一）Linux下安装matlab2018a

之前在window下运行了SPM12，也用SPM网站的DA
clancy_wu·2019-06-25 15:37

脑图像分析基本环境配置：MATLAB + SNAP + DiffusionKit + SPM12 + CAT12

1、安装MATLAB，此处版本为MATLABR2015b。2、使用ADNI作为实验数据集。安装SNAP用于查看.nii图像，此处版本为ITK-SNAP3.8。3、使用DiffusionKit进行图像配准。若未配准，后期可能会出现以下错误：配准方法：（1）在Brainnetome官网下载DiffusionKit工具包并安装（点击此处查看使用指南）。（2）打开CMD进入DiffusionKit目录，通
-Cooper-·2019-05-19 18:17

linux服务器搭建之路6-centos7安装matlab2017b

因为要用到SPM12，所以不得不安装matlab，选择版本2017b，下载地址：（如果下载链接失效，评论后我发新的地址）下载地址：链接：https://pan.baidu.com/s/1d5EVuJ5uJO6KI1YkvM9n9A
追蜗牛的coder·2018-10-03 20:03
上一页 1 下一页
按字母分类： ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ其他