DAP-seq

The Plant Journal | DAP-seq助力揭示乌龙茶树杂种优势形成的分子机制

期刊：ThePlantJournal影响因子：7.1发表日期：2022年10月11日单位：中国农业科学院深圳农业基因组研究所2022年10月11日中国农业科学院深圳农业基因组研究所合成生物学研究中心张兴坦研究员课题组在ThePlantJournal上发表了题为“Allele-specificexpressionandchromatinaccessibilitycontributetoheteros
爱基百客·2024-01-16 12:11

Plant Cell | DAP-seq和ATAC-seq助力构建玉米胚乳发育调控网络

禾本科植物，如水稻（Oryzasativa）和玉米（Zeamays）的胚乳，不仅是种子发芽和幼苗早期生长的能量来源，也是人类食物、畜禽饲料及工业用途的重要原料。胚乳的发展经历两个主要阶段：一是细胞发展阶段，此时细胞会经历大量的分裂与分化；二是籽粒灌浆阶段，细胞在此期间积累淀粉和蛋白质等储存物质。三个关键转录因子，即NAKEDENDOSPERM1(NKD1)、NKD2和OPAQUE2(O2)，在玉米
爱基百客·2023-10-30 11:22

DAP-seq前期实验项目可行性分析—钟鼎生物

所有的实验都存在失败的风险，钟鼎生物会根据转录因子蛋白表达成功率、转录因子蛋白亚细胞定位分析、DNA结合蛋白结构域、DNA结合位点分析、基因组数据库完整性分析、转录因子数据参考等方面综合推算出项目的成功率预测分值。①得分低于60，属于超级难度项目，失败风险概率较大，可做探索性尝试.②得分60~80，属于正常难度项目，可控风险，大概率获得明确的靶标DNA结合位点.③得分80以上，属于简易项目，建议开
钟小博·2023-03-30 13:29

Motif 文库筛选策略——精准定义转录因子结合 DNA 基序！—钟鼎生物

随着生物技术的创新发展，特别是高通量测序技术的日益成熟，近几年涌现出Dap-seq，Cut&tag,ATAC-seq等一系列新的技术手段，转录因子蛋白与DNA结合的面纱被一层层
钟小博·2023-03-29 05:31

DAP-seq技术在bHLH-zip转录因子SREBP调控灵芝中三萜类化合物和脂质代谢研究中的应用；2023年发表Communications Biology文章

灵芝酸（GAs）是一种三萜类化合物，是灵芝属中的关键药理活性化合物，具有多种生物学功能。然而，直接调控GA生物合成的转录因子仍然知之甚少。2023年01月03日，中南林业科技大学的最新研究成果，发表在CommunicationsBiology期刊上(影响因子6.548)，文章题目为“ThebHLH-ziptranscriptionfactorSREBPregulatestriterpenoidan
蓝景科信·2023-02-03 17:54

DAP-seq技术在GhBES1.4介导的BR对陆地棉纤维伸长调控网络研究中的应用 | DAP-seq 2022年发表Plant Physiology文章

棉花是世界上重要的天然纤维作物，棉纤维是细长的单细胞。油菜素内酯(BRs)通过BES1/BZR1转录因子参与植物生长和发育的调控，对棉纤维的伸长具有重要的调节作用。然而，BRs参与棉纤维伸长调控的分子机制有待探究。2022年12月21日，中国农业科学院棉花研究所的研究成果发表在PlantPhysiology期刊上(影响因子8.005)，文章题目为“Abrassinosteroidtranscrip
蓝景科信·2023-02-03 17:54

DAP-seq完整技术实验流程和原理-蓝景科信河北生物科技有限公司

1、DAP-seq在基因组水平上，鉴定转录因子的结合位点（transcriptionfactorbindingsites,TFBS）非常重要。ChIP-seq是进行体内检测TFBS的主要方法。
蓝景科信·2023-02-03 17:24

蓝景科信DAP-SEQ（DNA亲和纯化测序）技术服务常见问题（Input对照是什么？）

DAP-SEQ技术简介DAP-SEQ是基于DNA亲和纯化，通过体外表达转录因子鉴定TFBS的技术，具有不受抗体和物种限制，且高通量的优势，自该技术问世以来，已被广泛应用于转录调控和表观组学的研究。
蓝景科信·2023-02-03 17:24

ChIp-Seq,ATAC-seq, DAP-seq

1ChIP-seq染色质免疫共沉淀（ChromatinImmunoprecipitation,ChIP)研究体内蛋白质与DNA结合的技术。简单原理：首先通过染色质免疫共沉淀技术（ChIP）特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段，并对其进行纯化与文库构建；然后对富集得到的DNA片段进行高通量测序。研究人员通过将获得的数百万条序列标签精确定位到基因组上，从而获得全基因组范围内与组蛋白、转录因子等互作的D
斩毛毛·2021-03-13 15:43

20190904_chip-seq/ ATAC-seq/DAP-seq 原理理解

染色质免疫共沉淀ChromatinImmunoprecipitation,ChIP技术是指：在保持组蛋白和DNA联合的同时，通过运用对应于一个特定组蛋白标记的生物抗体，染色质被切成很小的片断，并沉淀下来。该技术是目前唯一研究体内DNA与蛋白质相互作用的方法。它的基本原理是在活细胞状态下固定蛋白质－DNA复合物，并将其随机切断为一定长度范围内的染色质小片段，然后通过免疫学方法沉淀此复合体，特异性地富
uqyuan0515·2020-09-13 03:02

DAP-seq助力胡杨耐盐机制的研究Populus euphratica WRKY1 binds the promoter of H+-ATPase gene to enhance gene expr

2019年9月，北京林业大学和蓝景科信合作，在植物学主流学术期刊***JournalofExperimentalBotany***上（IF=5.36），发表了题为“*Populuseuphratica*WRKY1bindsthepromoterofH+-ATPasegenetoenhancegeneexpressionandsalttolerance”的研究成果。该研究借助**DNA亲和纯化测序技
蓝景科信·2020-07-09 10:44
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