GOplot

赠你一只金色的眼 - 富集分析和表达数据可视化

GOplot包介绍GOplot包用于生物数据的可视化。更确切地说，该包将表达数据与功能分析的结果整合并进行可视化。但是要注意该包不能用于执行这些分析，只能把分析结果进行可视化。
生信宝典·2024-03-01 00:10

富集分析的弦图搞起

1.数据和R包准备library(clusterProfiler)library(org.Hs.eg.db)library(GOplot)library(stringr)load("step4output.Rdata
小洁忘了怎么分身·2024-02-12 12:05

r语言进行go富集分析_GO富集分析可视化：R语言GOplot包——准备自己的数据

GO注释和富集分析GO注释和富集分析使用TBtools完成，具体步骤可以参考TBtools作者在腾讯课堂开设的一系列视频课程本文使用的数据是甜樱桃叶绿体蛋白编码基因做GO注释，然后挑部分基因做富集分析，挑选的基因是rpoC1rpoBrpoArpoC2atpIatpFatpEatpHatpBatpAaccDrbcLrpl22rpl23rpl20rps8rps7rps16rps15rps14rps18
weixin_39868663·2024-01-26 04:39

通向 CNS 期刊的视觉之旅 | 生物信息学作图系列教程（一）

GOplot：画出差异表达基因富集结果No
·2023-09-26 19:54

【实战】R语言绘制GO富集分析弦图

前面通过视频给大家讲解了☞GO富集分析弦图怎么看也通过GOplot这个R包自带的数据给大家演示了。
生信交流平台·2023-04-01 02:33

GO-plot:超好看的GO富集可视化

以下代码均来自GO-plot的manual（GOplot(wencke.github.io)）。GO-plot用条形图，气泡图，弦图，热图等方式将基因表达数据和功能注释数据结合展示出来。
纳灰灰·2023-02-18 06:32

R语言绘图包08--森林图的绘制：forestplot

R语言绘图包系列：R语言绘图包01--优秀的拼图包patchworkR语言绘图包02--热图pheatmapR语言绘图包03--火山图EnhancedVolcanoR语言绘图包04--GOplot：富集分析结果可视化
Hayley笔记·2022-09-29 14:02

R语言绘图包07--多集合可视化UpSetR

R语言绘图包系列：R语言绘图包01--优秀的拼图包patchworkR语言绘图包02--热图pheatmapR语言绘图包03--火山图EnhancedVolcanoR语言绘图包04--GOplot：富集分析结果可视化
Hayley笔记·2022-07-01 10:20

R语言绘图包05--韦恩图的绘制：ggvenn和VennDiagram

R语言绘图包系列：R语言绘图包01--优秀的拼图包patchworkR语言绘图包02--热图pheatmapR语言绘图包03--火山图EnhancedVolcanoR语言绘图包04--GOplot：富集分析结果可视化韦恩图可以用来展示各个数据集之间的重叠关系绘制韦恩图的方法很多
Hayley笔记·2022-07-01 10:10

R语言绘图包04--GOplot：富集分析结果可视化

GOplot使用了zscore概念，但其并不是指Z-score标准化，而是指每个GOterm下上调(logFC>0)基因数和下调基因数的差与注释到GOterm基因
Hayley笔记·2022-07-01 10:06

TCGA|GEO可视化分析第2篇---KEGG|GO分析大全

那今天我和各位小伙伴深入的讲一下：（1）如何用clusterProfiler做KEGG|GO富集条形图，气泡图；（2）如何用enrichplot做gene-GOterms|gene-KEGGpathways网络图；（3）如何用GOplot
科研君·2020-07-28 22:18

赠你一只金色的眼 - 富集分析和表达数据可视化

GOplot包介绍GOplot包用于生物数据的可视化。更确切地说，该包将表达数据与功能分析的结果整合并进行可视化。但是要注意该包不能用于执行这些分析，只能把分析结果进行可视化。
生信宝典·2020-07-02 15:28

富集分析和基因表达花样可视化

GOplot包介绍GOplot包用于生物数据的可视化。更确切地说，该包将表达数据与功能分析的结果整合并进行可视化。但是要注意该包不能用于执行这些分析，只能把分析结果进行可视化。
生信宝典·2020-06-24 21:26

赠你一只金色的眼 - 富集分析和表达数据可视化

GOplot包介绍GOplot包用于生物数据的可视化。更确切地说，该包将表达数据与功能分析的结果整合并进行可视化。但是要注意该包不能用于执行这些分析，只能把分析结果进行可视化。
生信宝典·2020-02-11 01:05

GO富集可视化：clusterProfiler+GOplot

clusterProfiler、GOplot这两个工具可以说是在众多GO富集分析软件中脱颖而出
Mr_我爱读文献·2020-01-13 22:43

用GOplot包画漂亮的GOChord图和bubble图

#安装任意包options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")options("repos"=c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))options()$reposoptions()$BioC_mirror#https://bioconductor.org/package
装在瓶子里的阳光_2a70·2019-08-21 21:19

GOplot 可视化基因富集分析结果

#1.安装install.packages('GOplot')#2.GOplot内置数据##2.1脑和心脏内皮细胞的转录组数据来自文章Nolanetal.2013，GEOaccession:GSE47067
JeremyL·2019-05-19 21:20
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