R语言-零碎知识点

R语言【CoordinateCleaner】——cc_cen(): 移除或标记政治国家和省份的地理质心周围半径内的记录。生物数据库中地理参考较差的发生记录经常被错误地地理参考为质心。

PackageCoordinateCleanerversion2.0-20Parameterscc_cen(x,lon="decimallongitude",lat="decimallatitude",species="species",buffer=1000,geod=TRUE,test="both",ref=NULL,verify=FALSE,value="clean",verbose=TRU
ALittleHigh·2023-12-31 00:17

R语言【base】——cat() 输出对象，连接表示法，其运行的转换比 print 少得多

Packagebaseversion4.3.2Parameterscat(...,file="",sep="",fill=FALSE,labels=NULL,append=FALSE)参数【...】：R对象。参数【file】：一个connection，或一个命名要打印到的文件的字符串。如果是""（默认值），cat会打印到标准输出连接，即控制台，除非被sink重定向。参数【sep】：字符串向量，用于
ALittleHigh·2023-12-31 00:47

R语言【CoordinateCleaner】——cc_zero(): 删除或标记经度或纬度为零的记录，以及经度和纬度为零的点周围的半径。这些问题通常是由于错误的数据输入或地理参考造成的

PackageCoordinateCleanerversion2.0-20Parameterscc_zero(x,lon="decimallongitude",lat="decimallatitude",buffer=0.5,value="clean",verbose=TRUE)参数【x】：data.frame。包含地理坐标和物种名称。参数【lon】：字符串。具有经度坐标的列。默认值=“decim
ALittleHigh·2023-12-31 00:47

R语言【CoordinateCleaner】——cc_cap(): 删除或标记国家/地区首都周围特定半径范围内的记录。生物数据库中地理参考性差的发生记录经常被错误地地理参考为首都。

PackageCoordinateCleanerversion2.0-20Parameterscc_cap(x,lon="decimallongitude",lat="decimallatitude",species="species",buffer=10000,geod=TRUE,ref=NULL,verify=FALSE,value="clean",verbose=TRUE)参数【x】：dat
ALittleHigh·2023-12-31 00:47

R语言【base】——使用library判断是否已经安装第三方软件包：library(package, logical.return=TRUE)

Packagebaseversion4.3.2Parameterslibrary(package,help,pos=2,lib.loc=NULL,character.only=FALSE,logical.return=FALSE,warn.conflicts,quietly=FALSE,verbose=getOption("verbose"),mask.ok,exclude,include.onl
ALittleHigh·2023-12-31 00:46

51-R语言机器学习：时间序列与因果关系

《精通机器学习：基于R第二版》学习笔记1、数据理解与数据准备使用的数据记录的是年度异常数据，它由某一年的年度地表温度中位数与参考年度（1961~1990）平均温度的差构成。>climatestr(climate)##'data.frame':95obs.of3variables:##$Year:int1919192019211922192319241925192619271928...##$CO2
wonphen·2023-12-30 23:34

java大数据和javaee哪个好,java与大数据之间的关系

Sourcecodedownload:本文相关源码大数据是目前互联网流行的技术语言，处理大数据的编程语言比较有优势的也很多，比如java、python、go、R语言、Hadoop等等，按道理来说每种编程语言都可以处理大数据
chatgpt001·2023-12-30 17:14

代做MATH202-19S2作业、代写Java/c++课程设计作业、Python编程语言作业调试代写R语言编程|代做R语言编程

MATH202-19S2AssignmentA1Due—4pm,23AugustYourcompletedassignmentshouldbehandedinviatheMATH202boxinthereceptionareaonLevel4oftheErskinebuilding.Youmaydotheassignmentonyourown,orasapairwithoneotherstuden
fujianjia·2023-12-30 15:07

R语言【base】——merge(): 通过共同列名或行名合并两个数据帧

Packagebaseversion4.2.0Parametersmerge(x,y,...)##DefaultS3method:merge(x,y,...)##S3methodforclass'data.frame'merge(x,y,by=intersect(names(x),names(y)),by.x=by,by.y=by,all=FALSE,all.x=all,all.y=all,sor
ALittleHigh·2023-12-30 15:38

回顾2023，自己做了啥呢 | R语言绘图

2023年总结2023年即将结束，我们即将迎来2024年。2023年，我们做了什么呢？？这个是个值得深思的问题…?12月份是个快乐且痛苦时间节点。前一段时间，单位需要提交2023年工作总结，真的是憋了好久才可以下笔，但下笔后一直在沉思，再回想自己2023年到底做了什么呢？杂事做了很多，但没有成果。害！这就难办了，我们平时在开会时，你口述可以说，我做了这样，做了那样…等等。但是，在写工作总结时，可不
小杜的生信筆記·2023-12-30 15:38

2023教程发布最后一个教程 | R语言绘图汇总

2023年总结2023年即将结束，我们即将迎来2024年。2023年，我们做了什么呢？？这个是个值得深思的问题…?12月份是个快乐且痛苦时间节点。前一段时间，单位需要提交2023年工作总结，真的是憋了好久才可以下笔，但下笔后一直在沉思，再回想自己2023年到底做了什么呢？杂事做了很多，但没有成果。害！这就难办了，我们平时在开会时，你口述可以说，我做了这样，做了那样…等等。但是，在写工作总结时，可不
小杜的生信筆記·2023-12-30 15:37

学习笔记：R语言基础

文章目录一、R语言简介二、选择R的原因三、R基本数据对象（一）向量（二）矩阵（三）数组（四）因子（五）列表（六）数据框（七）函数四、基本函数应用示例五、自定义函数（一）自定义函数定义（二）自定义函数示例
howard2005·2023-12-30 13:43

霹雳吧啦Wz《pytorch图像分类》-p2AlexNet网络

《pytorch图像分类》p2AlexNet网络基础及代码一、零碎知识点1.过拟合2.使用dropout后的正向传播3.正则化regularization4.代码中所用的知识点二、总体架构分析1.ReLU
失舵之舟-·2023-12-30 05:33

刘二大人《PyTorch深度学习实践》p9多分类问题

刘二大人《PyTorch深度学习实践》p9多分类问题一、零碎知识点1.LongTensor长整形张量2.transform结构及用法二、预备知识1.Softmax激活函数2.NLLLoss损失函数3.CrossEntropyLoss
失舵之舟-·2023-12-30 05:03

霹雳吧啦Wz《pytorch图像分类》-p1卷积神经网络LeNet

卷积神经网络基础及代码一、卷积神经网络1.反向传播（backpropagation）2.常用的激活函数二、神经网络层类型概述1.全连接层2.卷积层卷积过程中出现越界3.池化层/下采样层三、课程代码1.零碎知识点
失舵之舟-·2023-12-30 05:03

刘二大人《PyTorch深度学习实践》p8加载数据集

刘二大人《PyTorch深度学习实践》p8加载数据集一、零碎知识点1.enumerate()二、Batch（批次）和Mini-Batch1.Mini-Batch2.Dataset（数据集）3.DataLoader
失舵之舟-·2023-12-30 05:02

刘二大人《PyTorch深度学习实践》p5用pytorch实现线性回归

刘二大人《PyTorch深度学习实践》p5用pytorch实现线性回归一、零碎知识点1.torch.nn2.nn.Module3.nn.linear4.nn.MSELoss5.torch.optim.SGD
失舵之舟-·2023-12-30 05:32

刘二大人《PyTorch深度学习实践》p6逻辑斯蒂回归

刘二大人《PyTorch深度学习实践》p6logistic回归一、零碎知识点1.torchvision2.np.linspace3.torch.Tensor(x).view4.matplotlib画一条直线二
失舵之舟-·2023-12-30 05:32

r语言独立性检验

卡方检验>library(vcd)>mytablechisq.test(mytable)Pearson'sChi-squaredtestdata:mytableX-squared=13.055,df=2,p-value=0.001463#由上述的内容可以看出：本次检验治疗和改善之后的效果是否与原有的效果显著，由于p=0.001，小于显著性水平，拒绝原假设，接受对立假设，效果是显著的。>mytabl
肖玉贤·2023-12-30 03:31

R语言ggplot2画右三角方块热图的简单小例子

还是这幅图image.png本来以为今天的推文可以重复出来的，但还是高估自己了，实现过程遇到了问题，暂时还不知道如何解决，后面想到办法再来介绍吧！今天的推文先介绍右上角的方块热图实现办法吧!首先是方块四周的灰色边框这里使用到的是geom_tile()函数。把填充设置为白色，然后把边框线设置为灰色就可以达成这种效果下面是一个简单小例子示例数据image.png代码library(readxl)df5
小明的数据分析笔记本·2023-12-30 02:26

R语言| 缺失值判断

缺失值判断一、缺失值判断通常用“NA"表示，判断数据是否存在缺失值的常用方法使用函数is.na()使用函数is.na()，该函数是判断缺失值的最基本的函数。可以用于判断不同的数据对象，如向量、列表和数据框.其函数的基本书写格式为：is.na(x)判断数据集中是否存在缺失值，如果存在，返回TRUE;如果不存在，则返回FALSE例：>library(DMwR）>data("algae")>sum(is
mint1104·2023-12-29 19:01

R语言：缺失值处理

前言  一个完整的处理方法通常包含以下几个步骤：  (1)识别缺失数据；  (2)检查导致数据缺失的原因；  (3)删除包含缺失值的实例或用合理的数值代替（插补）缺失值。  但遗憾的是，仅有识别缺失数据是最清晰明确的步骤。知道数据为何缺失依赖于你对数据生成过程的理解，而决定如何处理缺失值则需要判断哪种方法的结果最为可靠和精确。  统计学家通常将缺失数据分为三类。它们都用概率术语进行描述，但思想都非
猪逻辑公园·2023-12-29 19:31

R语言 arabic2kansuji包，将阿拉伯数字转换为汉字数字。

WeChatScreenshot_20210109104046.png#SatJan0910:36:192021-#字符编码：UTF-8#R版本：Rx644.0.3forwindow10#[email protected]#个人笔记不负责任#——拎了个梨.rs.restartR()require(arabic2kansuji)rm(list=ls());gc()arabic2kansuji(2
youmigo·2023-12-29 17:17

R语言【base】——sprintf()：接受格式化文本和变量值来搭建字符型向量。

Packagebaseversion4.2.0Parameterssprintf(fmt,...)gettextf(fmt,...,domain=NULL,trim=TRUE)参数【fmt】：格式字符串的字符向量，每个字符串最多8192个字节。参数【...】：要传递给参数【fmt】的值。仅支持逻辑向量、整数向量、实数向量和字符向量，但会进行一些强制。最多100。参数【trim，domain】：参见
ALittleHigh·2023-12-29 16:21

R语言【base】——names()：用于获取或设置对象名称的函数

Packagebaseversion4.2.0Parametersnames(x)names(x)<-value参数【x】：一个R对象。参数【value】：与参数【x】长度相同的字符向量，或者NULL。Detailsnames是一个通用访问函数，而names<-是一个通用替换函数。默认方法用于获取和设置向量（包括列表）或配对表的"names"属性。对于环境env，names(env)会给出相应列表
ALittleHigh·2023-12-29 16:21

R语言【base】——读取或设置类矩阵对象的行或列名：rownames() 和 colnames()

Packagebaseversion4.3.2Parametersrownames(x,do.NULL=TRUE,prefix="row")rownames(x)<-valuecolnames(x,do.NULL=TRUE,prefix="col")colnames(x)<-value参数【x】：一个类似矩阵的R对象，colnames至少有两个维度。参数【do.NULL】：逻辑。如果为FALSE且
ALittleHigh·2023-12-29 16:51

R语言【stats】——处理R对象中的缺省值：na.fail(), na.omit(), na.exclude(), na.pass()

Packagestatsversion4.3.2Parametersna.fail(object,...)na.omit(object,...)na.exclude(object,...)na.pass(object,...)参数【object】：R对象，通常是一个数据帧。参数【...】：特殊方法可能需要的其他参数。目前，它们只能处理向量、矩阵以及由向量和矩阵组成的数据帧。如果na.omit删除了
ALittleHigh·2023-12-29 16:51

R语言【base】——which()：给出逻辑对象的 TRUE 索引，允许使用数组索引。

Packagebaseversion4.2.0Parameterswhich(x,arr.ind=FALSE,useNames=TRUE)arrayInd(ind,.dim,.dimnames=NULL,useNames=FALSE)参数【x】：逻辑向量或数组。允许省略NA（视作FALSE）。参数【arr.ind】：逻辑；当参数【x】是一个数组时，是否应返回数组索引？除了单个真值外，其他任何值都会
ALittleHigh·2023-12-29 16:51

R语言【base】——dir.exists()和dir.create()目录和文件权限的操作

Packagebaseversion4.3.2Parametersdir.exists(paths)dir.create(path,showWarnings=TRUE,recursive=FALSE,mode="0777")Sys.chmod(paths,mode="0777",use_umask=TRUE)Sys.umask(mode=NA)参数【path】：是一个字符向量，包含一个路径名。参数
ALittleHigh·2023-12-29 16:20

R语言【rgbif】——name_backbone()和name_backbone_verbose()在 GBIF 分类树中查找名称。

Packagergbifversion3.7.8Parametersname_backbone(name,rank=NULL,kingdom=NULL,phylum=NULL,class=NULL,order=NULL,family=NULL,genus=NULL,strict=FALSE,verbose=FALSE,start=NULL,limit=100,curlopts=list())nam
ALittleHigh·2023-12-29 16:20

R语言【base】——file.path() 构建文件路径

Packagebaseversion4.3.2Parametersfile.path(...,fsep=.Platform$file.sep)参数【...】：字符矢量。不支持长向量。参数【fsep】：要使用的路径分隔符（假定为ASCII）。由于该函数在R中被广泛使用，因此其实现设计得非常快（比paste更快）。它也可用于PATH和R_LIBS等环境路径，使用fsep=.Platform$path.
ALittleHigh·2023-12-29 16:20

R语言【base】——将单个 R 对象写入文件并将其还原的函数：saveRDS()，readRDS() 和 infoRDS()

Packagebaseversion4.3.2ParameterssaveRDS(object,file="",ascii=FALSE,version=NULL,compress=TRUE,refhook=NULL)readRDS(file,refhook=NULL)infoRDS(file)参数【object】：要序列化的R对象。参数【file】：连接或R对象保存或读取的文件名。参数【ascii
ALittleHigh·2023-12-29 16:20

R语言整洁编码的12大原则

对于R语言新手，也建议大家规范编码。刚开始可能不习惯，但如果坚持练习，很快就能适应并成为你的第二天性，看着不规范的代码就难受，代码完美主义技能get。本文我们就来学习一下R语言整洁编码的12大原则。
简说基因-专业生信合作伙伴·2023-12-29 16:50

R语言【base】——字符转换和大小写：chartr()，tolower()，toupper()， casefold()

Packagebaseversion4.3.2Parameterschartr(old,new,x)tolower(x)toupper(x)casefold(x,upper=FALSE)参数【x】：字符向量，或可通过as.character强制转换为字符的对象。参数【old】：字符串，指定要转换的字符。如果提供的字符向量长度为2或更长，则使用第一个元素并发出警告。参数【new】：指定转换的字符串。
ALittleHigh·2023-12-29 15:13

R语言学习笔记-R包的安装

推荐在线安装，可以解决包与包之间的依赖关系。1.首先在RGui：2.在RStudio的console下：如安装ggplot2包，则：install.packages("ggplot2")生信方面：首先安装：install.packages("BiocManager")则就可以这样安装ggplot2包：BiocManager::install("ggplot2")
生信研究猿·2023-12-29 10:12

2019-04-19 R读取csv文件 绘制散点和密度图代码

原csv文件部分截图：字段名R语言绘图首先需要加载包install.package(ggplot2)#如果已经下载就不用install.packageinstall.package(reshape2)#
今年二圆可以到一百吗·2023-12-28 18:27

C语言零碎知识点之字符串数组

字符串数组的表示形式在C语言中字符串数组有两种表示方法：第一种，二维字符数组可以利用二维字符数组来表示字符串，格式是：charstrs[row][col];。例如：charstrs[4][6]={"hello","world","c","java"};//char类型的二维数组//注意，也不支持先声明再赋值。即下面的赋值方式是错误的charstrs[4][6];strs={"hello","wor
二木成林·2023-12-28 18:54

机器学习系列--R语言随机森林进行生存分析（1）

随机森林（Breiman2001a）（RF）是一种非参数统计方法，需要没有关于响应的协变关系的分布假设。RF是一种强大的、非线性的技术，通过拟合一组树来稳定预测精度模型估计。随机生存森林（RSF）（Ishwaran和Kogalur，2007；Ishwaraan，Kogalur、Blackstone和Lauer（2008）是Breimans射频技术的延伸从而降低了对时间到事件数据的有效非参数分析。R
天桥下的卖艺者·2023-12-28 16:59

R语言机器学习与临床预测模型36--随机森林Random Forest

本内容为【科研私家菜】R语言机器学习与临床预测模型系列课程R小盐准备介绍R语言机器学习与预测模型的学习笔记你想要的R语言学习资料都在这里，快来收藏关注【科研私家菜】01什么是随机森林？
科研私家菜·2023-12-28 15:21

【C++】零碎知识点

类对象不能直接访问类的私有成员，不能在类外访问类的私有成员。只有基类的成员函数能访问私有成员，不能被派生类的成员函数访问。如果在类声明时没有给出成员访问限定符，则默认的成员访问属性是私有的。常成员函数的定义：intTest::GetValue()const{returnvalue;}。const修饰的对象称为常对象。类的指针成员的初始化是通过函数完成的，这个函数通常是构造函数。在单继承和多继承方式
小秀_heo·2023-12-28 13:15

R语言|ggtreeExtra包绘制进化树

R包-ggtreeExtra绘制进化树ggplot2提供的geom_tile图层可以画热图了，ggplot2的geom_point或者ggstar的geom_star可以绘制点图层。为了扩展ggtree在点和布局中的系统发育树的外环上呈现相关数据，开发的ggtreeExtra包提供了一个函数，geom_fruit用于将图形与树对齐，相关图表将在树的外部面板的不同位置对齐。还开发geom_fruit
维凡生物·2023-12-28 10:47

【R语言科研绘图】--- 柱状图

R语言科研绘图——柱状图柱状图R语言科研绘图——柱状图前言一、柱状图二、使用工具1.所使用的包2.数据特征3.绘图3.1两组均值之间的比较3.2多组均值之间的比较后记前言使用R语言绘制能够发表的图片，ggplot2
生信小鹏·2023-12-28 09:12

【R语言科研绘图】——韦恩图

构建数据set.seed(20190708)genes<-paste("gene",1:1000,sep="")x<-list(A=sample(genes,300),B=sample(genes,525),C=sample(genes,440),D=sample(genes,350))使用ggVennDiagram绘制韦恩图比较经典的韦恩图是使用venndiagram作图，但是缺点是不能使用pd
生信小鹏·2023-12-28 09:12

R语言机器学习与临床预测模型25--净重新分类指数

本内容为【科研私家菜】R语言机器学习与临床预测模型系列课程R小盐准备介绍R语言机器学习与预测模型的学习笔记你想要的R语言学习资料都在这里，快来收藏关注【科研私家菜】01什么是净重新分类指数NRI？
科研私家菜·2023-12-28 09:42

R语言4.3.0安装及使用教程(非常详细)，从零基础入门到精通，看完这一篇就够了（附安装包））

一、软件下载软件：R语言版本：4.3.0语言：简体中文大小：77.74M安装环境：Win7及以上版本，64位操作系统硬件要求：[email protected]内存@4G(或更高）下载通道①百度网盘丨64位下载链接：
教IT的无语强·2023-12-28 06:29

看书标记【R语言数据分析项目精解：理论、方法、实战 2】

看书标记——关于R语言chapter2R语言基础2.1安装R语言2.2R语言基本对象2.2.2向量【R语言数据分析项目精解：理论、方法、实战】chapter2R语言基础R语言用高深的理论作为支撑、用简捷的语法作为工具
小胡涂记·2023-12-28 06:28

1.R语言基础知识

目录一、R语言的介绍R语言的下载与按照RstudioR包的安装工作空间管理基本运算二、R的数据结构1.数据类型2.数据类型的转换和判断3.数据结构三、导入/导出数据获取内置数据集获取其他格式的数据四、数据框的常用操作
Dr_long1996·2023-12-28 06:58

R语言入门与数据分析（1）

①Ctrl+Shift+c注释当前行，选中后再使用会注释选中区域，两次则会取消单行注释②Alt±赋值号③Ctrl+L刷新控制台（清空屏幕）④仅支持单行注释#1.显示当前工作路径>getwd()[1]"C:/Users/sxl/Documents"2.改变当前工作路径>setwd(dir="c:/Users/sxl/Desktop/R")3.查看目录下包含的文件（两者功能一样）>list.files
瓴翎玲·2023-12-28 06:58

R语言【base】——unique(x) 返回类似参数【x】的向量、数据集或数组，但删除了重复的元素/行。

Packagebaseversion4.3.2Parametersunique(x,incomparables=FALSE,...)##DefaultS3method:unique(x,incomparables=FALSE,fromLast=FALSE,nmax=NA,...)##S3methodforclass'matrix'unique(x,incomparables=FALSE,MARGI
ALittleHigh·2023-12-28 06:28

FigDraw 6. SCI 文章绘图之箱线图 (Boxplot)

前两期简单介绍了R语言基础，比较简单粗略，然后介绍了R语言中表格的转换，因为现在绘图基本以及舍弃了基本绘图的方式，都会选择ggplot2来作图，这期SCI绘图介绍一下箱线图！
90066456ace6·2023-12-28 05:32
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