R语言-零碎知识点第16页

R语言【rmarkdown】——render()：使用 pandoc 将输入文件渲染为指定的输出格式。如果输入需要knit，则在 pandoc 之前调用 knit

Packagermarkdownversion2.25Parametersrender(input,output_format=NULL,output_file=NULL,output_dir=NULL,output_options=NULL,output_yaml=NULL,intermediates_dir=NULL,knit_root_dir=NULL,runtime=c("auto","s

ALittleHigh·2023-12-28 02:15

R语言【dplyr】——使用 relocate() 更改列的位置，其语法与 select() 相同，便于一次移动多个列块

Packagedplyrversion1.1.4Parametersrelocate(.data,...,.before=NULL,.after=NULL)参数【.data】：数据集、数据集扩展（如tibble）或lazydataframes（如来自dbplyr或dtplyr的数据集）。参数【...】：要移动的列。参数【.before，.after】：通过参数【...】选择的列的目的地。两者都不提

ALittleHigh·2023-12-28 02:43

R语言【base】——readline() 从终端读取一行（交互式使用时）。

Packagebaseversion4.3.2Parameterreadline(prompt="")参数【prompt】：提示用户输入时打印的字符串。通常以空格""结束。提示字符串将被截断到允许的最大长度，通常为256个字符（但可在源代码中修改）。这只能在交互式会话中使用。Value长度为1的字符向量。结果中的前导空格、尾部空格和制表符都会被去掉。在非交互式使用中，结果就好像响应是RETURN，

ALittleHigh·2023-12-28 02:43

GWAS结果批量整理：升级版算法TidyGWAS

TidyGWAS本篇笔记将分享一种基于R语言自动实现GWAS结果整理的升级版方法，通过优化关键步骤和算法，将代码量从2000行缩减到了400行，速度提高10倍以上。

生信分析笔记·2023-12-28 00:59

瓷片图绘制教程，R语言ggplot2绘图笔记

今天分享一个在R语言中利用ggplot2包绘制瓷片图的方法，支持不同分组不同类型等数据合并展示，轻松完成可视化。

生信分析笔记·2023-12-28 00:58

《R语言实战》自学笔记50-回归诊断标准方法

数据准备df<-read.table(file="D:/Documents/Rwd/df.csv",header=T,sep=",",colClasses=c(year="character",nitrogen="character",variety="character",block="character"))#数据导入。df#查看数据。##yearnitrogenvarietyblockv1v

zjh9280·2023-12-28 00:33

R语言|绘制主坐标分析PCoA图

主坐标分析（PrincipalCoordinatesAnalysis，PCoA）是一种研究数据相似性或差异性的可视化方法，把复杂的数据用一系列的特征值和特征向量进行排序后，选择排在前面的几位特征值，用来表示样品之间的关系并以坐标的形式展现，结果是数据矩阵的旋转，通过PCA可以找到距离矩阵中最主要的坐标，观察个体或者群体之间的差异。PCoA分析比较适用样本数目比较少，而物种数目比较多的情况。小编今天

维凡生物·2023-12-27 13:12

R语言ggplot2做柱形图展示富集分析的结果

如果是研究比较多的物种，可以直接使用R语言包clusterProfiler做富集分析当然是最好，最后可以很少的代码拿到很漂亮的结果图。

小明的数据分析笔记本·2023-12-27 11:01

R语言爬取百度地图天气预报

R语言爬取百度地图天气预报#WedJul0700:36:302021-#字符编码：UTF-8#R版本：R4.1x64forwindow11#[email protected]#个人笔记不负责任，拎了个梨

youmigo·2023-12-27 10:37

R语言和Rstudio下载以及 R 包安装

R语言和Rstudio下载TheComprehensiveRArchiveNetwork(r-project.org)进入官网下载与电脑相符的R语言比如我的电脑是Windowsx64，下载的是：DownloadR

伏尔加河的卷毛·2023-12-27 08:58

学习小组Day5笔记--林枫

（6）表格在R语言中改名叫数据框^_

致年·2023-12-27 02:39

R语言【base】——grep，grepl，regexpr，gregexpr，regexec，gregexec，sub，gsub模式匹配和替换

Packagebaseversion4.3.2Parametersgrep(pattern,x,ignore.case=FALSE,perl=FALSE,value=FALSE,fixed=FALSE,useBytes=FALSE,invert=FALSE)grepl(pattern,x,ignore.case=FALSE,perl=FALSE,fixed=FALSE,useBytes=FALSE

ALittleHigh·2023-12-27 02:43

R语言【base】——file.path() 以独立于平台的方式构建文件路径。

Packagebaseversion4.3.2Parametersfile.path(...,fsep=.Platform$file.sep)参数【...】：字符向量。不支持长向量。参数【fsep】：要使用的路径分隔符（假定为ASCII）。由于该函数在R中被广泛使用，因此其实现设计得非常快（比粘贴更快）。它也可用于PATH和R_LIBS等环境路径，使用fsep=.Platform$path.sep

ALittleHigh·2023-12-27 02:43

R语言【dplyr】——n_distinct() 计算一个或多个向量集合中唯一/唯一组合的数量。它比 nrow(unique(data.frame(...))更快、更简洁。

Packagedplyrversion1.1.4Parametersn_distinct(...,na.rm=FALSE)参数【...】：未命名向量。如果提供多个向量，它们的长度应相同。参数【na.rm】：如果为TRUE，则从计数中排除缺失的观测值。如果参数【...】中有多个向量，则如果其中任何值缺失，都将排除该观测值。Value一个数字。Example>xn_distinct(x)[1]2>yn

ALittleHigh·2023-12-27 02:13

R语言【base】——system.file() 在软件包等中查找文件的完整文件名。

Packagebaseversion4.3.2Parameterssystem.file(...,package="base",lib.loc=NULL,mustWork=FALSE)参数【...】：字符向量，指定某个软件包中的子目录和文件。默认情况下，没有值则返回软件包的根目录。不支持通配符。参数【package】：是一个字符串，包含一个软件包的名称。如果给出的软件包名称超过一个，则会发生错误。

ALittleHigh·2023-12-27 02:42

R语言绘图教程汇总 | 2023

2023年总结2023年即将结束，我们即将迎来2024年。2023年，我们做了什么呢？？这个是个值得深思的问题…?12月份是个快乐且痛苦时间节点。前一段时间，单位需要提交2023年工作总结，真的是憋了好久才可以下笔，但下笔后一直在沉思，再回想自己2023年到底做了什么呢？杂事做了很多，但没有成果。害！这就难办了，我们平时在开会时，你口述可以说，我做了这样，做了那样…等等。但是，在写工作总结时，可不

小杜的生信筆記·2023-12-26 22:23

Android记 - Binder语言

理解Binder设计以我的理解，先有Android后有Binder，Binder就像是Android这个世界的语言。Binder目前的设计是为了满足Android的需求，Linux现存的进程间通信机制不满足Android的需求。Android的Binder的进程间通信设计了类似C/S的架构，为了满足这样的结构设计，要定义client端和server端的”通信协议“，所以android中用接口的方式

gomogomono·2023-12-26 20:37

2021-03-24 R语言画柱状图

先是画一个这个图，这个图是根据p.adjust（也就是FDR）来排序的，我的代码是按照queritem多少来排序的，颜色填充都是根据FDR来的##画直方图，先是数据集，设置xy轴，这里用reorder按照queryitem排序Term，颜色根据FDR来决定ggplot(abp,aes(x=queryitem,y=reorder(Term,queryitem),fill=FDR))+##这是绘制直方

1f9e79f37c42·2023-12-26 16:09

学习小组Day4笔记--郭晶晶

plot函数的语法格式R语言中plot()函数的基本格式如下：plot(x,y,...)plot函数中，x和y分别表示所绘图形的横坐标和纵坐标；函数中的...为附加的参数。plot函数默认的使用格式

GJJDr·2023-12-26 11:45

R语言【dplyr】——arrange() 按所选列的值对数据集的行重新排序

Packagedplyrversion1.1.4Parametersarrange(.data,...,.by_group=FALSE)##S3methodforclass'data.frame'arrange(.data,...,.by_group=FALSE,.locale=NULL)参数【.data】：数据集、数据集扩展（如tibble）或lazydataframes（如来自dbplyr或d

ALittleHigh·2023-12-26 06:23

R语言【dplyr】——summarise()或summarize()会创建一个新的数据帧。它为每个分组变量的组合返回一行；如果没有分组变量，输出将只有一行，汇总输入中的所有观测值

Packagedplyrversion1.1.4Parameterssummarise(.data,...,.by=NULL,.groups=NULL)summarize(.data,...,.by=NULL,.groups=NULL)参数【.data】：一个数据集（dataframe），数据集扩展（比如：tibble），或者lazydataframes（比如：来自dbplyr或dtplyr）。参

ALittleHigh·2023-12-26 06:52

R语言【dplyr】——inner_join(x,y)只保留参数【x】中与参数【y】中连接键匹配的观测值

Packagedplyrversion1.1.4Parametersinner_join(x,y,by=NULL,copy=FALSE,suffix=c(".x",".y"),...,keep=NULL)##S3methodforclass'data.frame'inner_join(x,y,by=NULL,copy=FALSE,suffix=c(".x",".y"),...,keep=NULL,

ALittleHigh·2023-12-26 06:52

R 回归虚拟变量na_R语言实战之R语言基础语法精讲（三）

在学习R数据科学之前，我们首先要对R语言的基础语法有一个良好的了解，方便我们理解以后的数据科学算法。本次语法精讲分三次讲完，每次负责讲解其中一部分！

weixin_39769675·2023-12-26 06:52

r语言赋值为na_如何将R数据中的NA值替换为0？

dplyr杂交选项现在比BaseR子集重新分配快30%左右。在一个100米的数据池上mutate_all(~replace(.,is.na(.),0))比基数R快半秒d[is.na(d)]如果你在为大量的数据而挣扎，data.table是最快的选择：比标准快40%。基R接近。它还可以修改现有的数据，有效地允许您一次处理几乎两倍的数据。其他有用的潮汐替换方法的聚类地点：指数mutate_at(c(5

weixin_39980129·2023-12-26 06:52

R语言第三课：神奇R包tidyr

写在前面：一些R包有自己的说明书（cheatsheet），俗称小抄。在对包有了一定的了解后，小抄是一个很好的学习操作指南，但是对于新手来说，很有可能完全看不懂。今天的教程有一部分参照了小抄，并作出了通俗的解释。相信跟着教程走下去，就可以学个七七八八，跟着练练，然后自己研究一下小抄，一个R包就学个差不多啦。准备工作part1：学会获取一个R包的小抄方法1：去百度/谷歌XX小抄方法2：找Rstudio

小洁忘了怎么分身·2023-12-26 06:52

r 函数返回多个值_哈佛R语言课程8.Tidyverse

今天是生信星球陪你的第359天大神一句话，菜鸟跑半年。我不是大神，但我可以缩短你走弯路的半年~就像歌儿唱的那样，如果你不知道该往哪儿走，就留在这学点生信好不好~这里有豆豆和花花的学习历程，从新手到进阶，生信路上有你有我！原文链接：https://hbctraining.github.io/Intro-to-R/lessons/08_intro_tidyverse.html系列目录推荐一套来自哈佛的

weixin_39639040·2023-12-26 06:51

R语言常用代码：重命名，去除na，删除重复行等...

重命名重命名全部的列name(data)<-c("NO","name")重命名单个列colnames(data)[2]<-'newname'缺失值（NA）的去除将所有含NA的行去除data<-na.omit(data)某一列含有NA的行(value1为这一列的列名)data<-subset(data,value1!="NA")其他函数计算中（如sum）y<-sum(x,na.rm=

Trance_Fu63·2023-12-26 06:51

R语言NA赋值错误

Errorinancom.w.mat[a,s]:NAsarenotallowedinsubscriptedassignments直接删除法drop_na(df,x1)#去除X1列的NA填充法2.1df[is.na(df)]=02.2使用tidyr包中的replace_na函数replace_na(df$X1,5)#把df的X1列的NA填充为52.3fill()函数fill(df,X1,.direc

杳杳浮云·2023-12-26 06:51

R语言数据处理：tidyr包学习

文章目录前言1、gather()函数2、spread()函数3、unite()函数4、separate()函数5、缺失值处理总结前言在R语言中，tidyr包的应用tidyr主要提供了一个类似Excel中数据透视表

「已注销」·2023-12-26 06:19

R语言处理缺失值之naniar包

医学和生信笔记·2023-12-26 06:14

R语言【tidyr】——replace_na(data, replace) 用指定值替换 NA，返回一个与参数【data】类型相同的对象

Packagetidyrversion1.3.0Parametersreplace_na(data,replace,...)参数【data】：一个数据集或向量。参数【replace】：如果参数【data】是一个数据集，那么参数【replace】就要是一个命名列表，列表中每个值代表了对应行中缺省值的替换值。参数【replace】中的每个值都将被转换为参数【data】中用作替换的列的类型。如果参数【d

ALittleHigh·2023-12-26 06:14

代写LP102留学生作业、代做C++程序语言作业、代写github作业、代做C/C++实验作业帮做Java程序|代做R语言程序

LP1022019SpringHomework1AbstractWriteaC[1]programthatcanplaythegamesofGoandGoBan.1IntroductionofGoandGobanGo(calledWeiQiinChina)andGoban(calledWuZiQiinChina)areancientboardgames.Theboardismarkedbyhori

feirongfu·2023-12-26 02:28

R语言专题班（训练营：2023.10.23~10.30）

茗创科技专注于脑科学，涵盖（EEG/ERP，fMRI，结构像，DTI，ASL，FNIRS）等，欢迎留言讨论及转发推荐，也欢迎了解茗创科技的脑科学课程，数据处理服务及脑科学工作站销售业务，可添加我们的工程师（微信号MCKJ-zhouyi或17373158786）咨询。★课程简介★R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件，它是一个用于统计计算和统计制

茗创科技·2023-12-25 23:31

差异分析|使用limma包

获取本章节数据和代码：关注微信公众号：小杜的生信筆記（ID：Du_Bioinformatics），回复关键词：limma差异分析------------------------基于R语言进行差异分析的包有很多个

小杜的生信筆記·2023-12-25 21:09

如何利用R语言实现logistic逐步回归

欢迎关注我的个人微信公众号：全哥的学习生涯，获取更多R语言与数据分析学习知识。在实

吃一口小肉丸·2023-12-25 14:16

【沁恒蓝牙mesh】CH58x DataFlash 详解

本文主要介绍了沁恒蓝牙芯片CH58x的DataFlash分区以及读写操作以及原理个人简介作者简介：大家好，我是喜欢记录零碎知识点的小菜鸟。

Intoxicated_Rookie·2023-12-25 14:17

R语言绘图练习01 -- 各种类型的饼图

本系列课程要求大家有一定的R语言基础，对于完全零基础的同学，建议去听一下师兄的《生信必备技巧之——R语言基础教程》。

生信师兄·2023-12-25 13:49

R语言dlnm包在时间序列空气污染数据的分布滞后线性和非线性模型对分类变量预测绘图

粉丝私信要求我复现一篇大概11分左右的文章图片文章名字是：ExploringHealthEffectsunderSpecificCausesofMortalityBasedon90DefinitionsofPM2.5andColdSpellCombinedExposureinShanghai,China（基于中国上海PM2.5和寒流联合暴露的90个定义探讨特定死因下的健康影响）。作者表明空气污染和

天桥下的卖艺者·2023-12-25 05:22

奇奇怪怪的知识又增加了--R语言创建文章流程图

今天分享一个R语言制作流程图的小例子，流程图是咱们论文的一个思维导流图，可以清晰表达你的数据筛选思路，可以制作流程图的软件很多，今天咱们使用R语言来制作流程图需要用到hgutils包，这是一个很有意思的

天桥下的卖艺者·2023-12-25 05:22

R语言使用scitb包10分钟快速绘制论文基线表

scitb包目前进行了升级到1.7版本了，我做了一个操作视频，如何快速绘制基线表。scitb包绘制基线表可以配套看下我的关于scitb包文章理解一下scitb包1.6版本发布，一个为制作专业统计表格而生的R包

天桥下的卖艺者·2023-12-25 05:21

R 爬虫-Rvest

Rvest用R轻松抓网页数据课程背景：本课程需要一点R语言基础，以及了解一点CSS选择器的知识，不过没有相关的知识同样也不需要担心，所有的背景知识都很简单学完之后能够做什么：通过本课程知识的讲解，加上案例的分析

Liam_ml·2023-12-25 03:27

代写CSE3400作业、代写book + notes作业、C/C++课程作业代做、代做Java，Python程序语言作业帮做R语言编程|代做留学生Proces

CSE3400FinalExamCalculatorsareallowedClosedbook+notes.ReviewHWProblems.AnanswerguideforHW5willbeavailableimmediatelyaftertheduedate.Chapter3:MACKnowwhataMACis,butIwontaskyoutoproveordisprovesomethingi

lrok637·2023-12-24 23:49

Coding and Paper Letter（四十五）

tangram3.R语言包gdalcubesR，gdalcubes的R包，与之前

G小调的Qing歌·2023-12-24 19:41

R语言：多水平统计模型

转自个人微信公粽号【易学统计】的统计学习笔记：R语言：多水平统计模型01解决何种问题同样是九年义务教育，凭什么别人那么优秀？显然这跟每个人，不同班级，不同学校有关系，究竟是什么样的关系呢？

小易学统计·2023-12-24 17:22

R语言基础 | 安徽某高校《统计建模与R软件》期末复习

第一节数字、字符与向量1.1向量的赋值c2)#返回FALSEall(c(1,2,3)>2)#返回TRUEx3,TRUE,FALSE)#logical_vector包含FALSEFALSEFALSETRUETRUE1.5生成有规律的序列#生成等差数列a:b#等间隔函数s1<-seq(-5,5,by=2)#生成间隔为2，从-5到5的等间隔序列#重复函数rep()s1<-rep(x,times=3)1.

我不是saint·2023-12-24 17:47

R语言 | 组学各类图形绘制资源

一边学习，一边总结，一边分享！写在前面今天分享在GitHub中找到的教程资源，此教程是来自iMeta期刊及“农心生信工作室”的作品。发表在GitHub中，大家可以自行下载。包含了21个图形的绘制，我大体看了一下，同学么平时也都会使用到。在原文后台回复：20231221即可获得全部资源。原文链接：GitHub中教程资源教程图形往期文章：1.复现SCI文章系列专栏2.《生信知识库订阅须知》,同步更新，

小杜的生信筆記·2023-12-24 17:15

R语言中的函数28：Reduce(), Filter(), Find(), Map(), Negate(), Position()

文章目录介绍Reduce()实例Filter()实例Find()实例Map()实例Negate()实例Position()实例介绍R语言中的Reduce(),Filter(),Find(),Map(),

zoujiahui_2018·2023-12-24 17:15

R语言【dplyr】——mutate() 可以创建与现有变量函数相关的新列。它还可以修改（如果名称与现有列相同）和删除列（通过将其值设置为 NULL）

Packagedplyrversion1.1.4Parametersmutate(.data,...)##S3methodforclass'data.frame'mutate(.data,...,.by=NULL,.keep=c("all","used","unused","none"),.before=NULL,.after=NULL)参数【.data】：数据集、数据集扩展（如tibble）或懒

ALittleHigh·2023-12-24 11:59

R语言【dplyr】——case_when()是一般向量化的 if-else()，该函数允许您将多个 if_else() 语句矢量化

Packagedplyrversion1.1.4Parameterscase_when(...,.default=NULL,.ptype=NULL,.size=NULL)参数【...】：一组两面公式（two-sidedformulas）。公式左边（lefthandside，LHS）决定了哪些值符合这种情况。公式右边（righthandside，RHS）提供了替换值。LHS输入的结果必须是逻辑向量。