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mricron
批量dicom格式转nii(dcm2nii),目前网上最全总结与最强转换方法!!
总结Dcm2nii各方法目前存在的问题使用
mricron
的dcm2niigui.exe转换,此方法虽然可以成功转换,但存在的问题如下:①输出的nii可能不止一个;②只能输出到同级目录,不能自定义输出文件深度
程序员老冉
·
2024-01-03 20:16
数据库
批量dicom格式转nii(dcm2nii),目前网上最全总结与最强转换方法!!
总结Dcm2nii各方法目前存在的问题使用
mricron
的dcm2niigui.exe转换,此方法虽然可以成功转换,但存在的问题如下:①输出的nii可能不止一个;②只能输出到同级目录,不能自定义输出文件深度
阿煜啊
·
2023-04-20 11:55
数据格式转换
python
开发语言
图像处理
使用freesurfer和3Dslicer进行脑区分割和电极定点(日常记录)
一、前期准备Linux系统安装Freesurfer、MATLAB插件spm12、fieldtrip,Windows下载
mricron
、Slicer3D(需要插件SlicerFreeSurfer)软件文件准备
zQIANYUN
·
2023-01-08 16:04
脑机接口;认知科学
遇到的各种各样的小问题
ubuntu
matlab
基于FSL的DTI数据预处理流程
工具:
MRICRON
和FSL,所有的命令均在Linux的终端中运行。1.格式转换:将后缀名为dcm的原始数据转换为后缀名为nii.gz格式的
zaza_zaza
·
2023-01-01 10:25
预处理
DTI
FSL
FSL
DTI
预处理
流程
FSL、
MRICRON
预处理DICOM数据,python读取nii,并降采样
1.FSL和
MRICRON
预处理DICOM数据软件安装见:https://blog.csdn.net/qq_29477893/article/details/89376758。
kether_
·
2023-01-01 10:51
医学图像处理
Ubuntu系统下
MRIcroN
、FSL6.0.5、Freesurfer7.1.1、ANTs、MRtrix3、AFNI的安装详解——核磁共振数据处理必备
Ubuntu系统下
MRIcroN
、FSL6.0.5、Freesurfer7.1.1、ANTs、MRtrix3、AFNI的安装详解一、安装
MRIcroN
二、FSL6.0.5完整安装与FSLeyes等NotFound
sta@ma@brain
·
2022-12-25 01:39
神经科学工具箱
脑科学核磁共振成像
数据分析
ubuntu
核磁共振软件包
windows 下git bash 中添加dcm2niix、wget等命令的方法
示例1,在bash中添加dcm2niix命令:1、下载windows版本
mricron
安装包,地址:https://www.nitrc.org/frs/?
*逍遥*
·
2022-11-24 13:34
bash
git
linux
Matlab +
mricron
批量转换DICOM数据为NIFTI格式
多款软件可以实现,应用比较多的是
mricron
中的dcm2niix.exe工具。但是该工具不易于数据的批量转换。本文提出了一种Matlab+
mricron
批量转换的思路,供大家参考。
小蜜蜂Stats
·
2020-07-22 14:35
Ubuntu/centors安装FSL和
MRIcron
一安装FSL有几种方法,用脚本装是最简单的1.【自动安装】系统:ubuntu14.04版本(我尝试过16.04和18.04都无法用脚本顺利装上FSL),此版本系统自带python2.7版本,正好用来运行fsl安装脚本下载地址:https://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki/FslInstallation使用脚本安装:终端输入pythonfslinstaller.py1
kether_
·
2020-06-25 04:26
医学图像处理
修改dcm2nii.ini的默认配置来控制影像数据格式转换
关于dcm2nii软件格式转换的配置文件说明可以参照这个网页,很详细,https://people.cas.sc.edu/rorden/
mricron
/dcm2nii.html我的问题也很简单,在对DTI
Galory
·
2019-12-24 07:55
Nifti文件分类及整理与如何从读取DICOM读取模态信息
Python——划分Nifti对应模态数据并整理问题:把DICOM的数据用
MRIcron
的dcm2niigui.exe转好格式以后每个被试的全部模态都在一个文件夹内,but,有人给了你一个名单,只要那些人的某几个模态的数据
Galory
·
2019-01-08 18:36
使用NIFTI指令画nii图像
❤关于几种显示工具mricro:显示出来的左右脑是反着的;
mricroN
,SPM,xjview,BrainNetViewer:显示出的左右脑是正确的,并且对于做过仿射变换的图像可以自动识别并且校正显示为正确的左右脑
minks
·
2016-01-26 21:00
MRIcro tutorial -- mricro 教程
MRIcro tutorial 参考网址:http://www.mccauslandcenter.sc.edu/mricro/
mricron
/ http
·
2015-10-27 13:52
RIA
ubuntu中使用sudo apt-get install 安装之后的软件,怎么看安装在哪里
usr/usr/share/usr/share/applications/usr/share/applications/dcm2niigui.desktop/usr/share/applications/
mricron
.desktop
Marphy11
·
2014-05-09 15:58
ubuntu
ubuntu中使用sudo apt-get install 安装之后的软件,怎么看安装在哪里
usr/usr/share/usr/share/applications/usr/share/applications/dcm2niigui.desktop/usr/share/applications/
mricron
.desktop
lj695242104
·
2014-05-09 15:00
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