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r语言glmnet
R语言
绘制上下双向分布柱状图
话不多说,直接上干货library(ggplot2)library(tidyr)set.seed(123)#设置随机种子保证可重现df<-data.frame(Type=rep(letters[1:5],each=5),Sample=paste("sample",rep(1:5,times=5),sep=""),Up=round(runif(25,min=0,max=100),1),Down=ro
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2025-07-05 09:11
R语言
学习笔记之十
摘要:仅用于记录
R语言
学习过程:内容提要:描述性统计;t检验;数据转换;方差分析;卡方检验;回归分析与模型诊断;生存分析;COX回归写在正文前的话,关于基础知识,此篇为终结篇,笔记来自医学方的课程,仅用于学习
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2025-07-04 16:55
Rstudio:强大的
R语言
集成开发环境(IDE)
Rstudio应该是
R语言
使用的标配,尽管Rstudio的母公司Posit推出了新一代的集成开发环境Positron,但其还处于开发阶段。作为用户不妨让其成熟后再使用,现阶段还是Rstudio更稳定。
简说基因-专业生信合作伙伴
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2025-07-04 15:45
r语言
开发语言
R语言
程序包开发与应用
本文还有配套的精品资源,点击获取简介:
R语言
程序包是扩展功能的关键,提供了统计分析、数据可视化、机器学习等领域的丰富开源库。
溪水边小屋
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2025-07-04 15:44
《R循环:深度解析与高效使用技巧》
《R循环:深度解析与高效使用技巧》引言
R语言
作为一种功能强大的统计计算和图形显示语言,被广泛应用于科研、数据分析、金融等领域。R循环是
R语言
中的核心概念之一,对于提高编程效率、处理复杂数据至关重要。
沐知全栈开发
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2025-07-03 03:32
开发语言
R语言
与C语言混合编程:在
R语言
中调用C语言函数
R语言
与C语言混合编程:在
R语言
中调用C语言函数介绍:
R语言
是一种用于统计分析和数据可视化的高级编程语言,而C语言是一种通用的、强大的编程语言。
数据探索
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2025-06-30 13:41
r语言
c语言
开发语言
R语言
倾向得分匹配的stata命令_
R语言
系列1:倾向得分匹配
1PSM简介倾向评分匹配(PropensityScoreMatching,简称PSM)是一种统计学方法,用于处理观察研究(ObservationalStudy)的数据。在观察研究中,由于种种原因,数据偏差(bias)和混杂变量(confoundingvariable)较多,倾向评分匹配的方法正是为了减少这些偏差和混杂变量的影响,以便对实验组和对照组进行更合理的比较。这种方法最早由PaulRosen
weixin_39995108
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2025-06-30 12:39
倾向得分匹配的stata命令
r语言
回归分析 分类变量_
R语言
下的PSM分析分类变量处理与分析步骤
最近学习了PSM,我选择了用R去跑PSM,在这过程中遇到了许多问题,最后也都一一解决了,写下这个也是希望大家在遇到相同问题的时候能够得到帮助和启发,别的应该不会遇到太难的问题了哈哈。最近我也没做什么,录数据,或者说还在调整心态,最近遇到的事情也比较多,又或者说最近的心态比较乱,晚上也睡不好导致白天也比较烦躁,所以可能还是需要一段时间去好好调整,因此最近更新的也比较慢。不过还是会坚持的。问题阐述:1
weixin_39715834
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2025-06-30 12:09
r语言
回归分析
分类变量
r语言清除变量
R语言
倾向性匹配得分(PSM)分析
R语言
倾向性匹配得分(PSM)分析倾向性匹配得分(PropensityScoreMatching,PSM)是一种常用的统计方法,用于处理观察研究中的选择性偏倚。
后端工程实践
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2025-06-30 12:37
r语言
java
开发语言
R语言
R语言
入门课| 05 一文掌握
R语言
常见数据类型
视频教程大家可以先做一做
R语言
基础小测验,看看自己是否需要跟我们5.5h入门
R语言
的课程。
Biomamba生信基地
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2025-06-30 07:07
r语言
信息可视化
开发语言
生信
医药
R 语言简介:数据分析与统计的强大工具
而
R语言
,作为一款专为数据分析和统计而设计的编程语言,以其强大的功能和灵活性,成为了众多数据分析师、研究人员以及统计学家的首选工具之一。什么是
R语言
?
Mikhail_G
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2025-06-29 21:28
python
数据分析
大数据
r语言
开发语言
R 语言中的判断语句
R语言
中的判断语句在
R语言
编程中,判断语句是执行条件逻辑的基础。它们允许程序根据特定的条件执行不同的代码块。
lsx202406
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2025-06-26 00:46
开发语言
从0开始学习
R语言
--Day31--概率图模型
在探究变量之间的相关性时,由于并不是每次分析数据时所用的样本集都能囊括所有的情况,所以单纯从样本集去下判断会有武断的嫌疑;同样的,我们有时候也想要在数据样本不够全面时就能对结果有个大概的了解。例如医生在给患者做诊断时,有些检查需要耗费的时间很久,但仅仅凭借一些其他的症状,他就可以对病人患某种病有个大概的猜想,从而先做出一些措施来降低风险,毕竟等到疾病真正发生时可能会来不及。概率图模型便是能够同时进
Chef_Chen
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2025-06-25 10:38
学习
Jmeter使用过程中的一些总结
以下总结使用的Jmeter版本为5.6.31、当把Jmete
r语言
转换为中文时,可能会出现jmeter日志不出现,当发现Jmeter不发送请求时,不显示日志,排查问题就会没有头绪,此时可以尝试将语言切换为英文
kanyun123
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2025-06-24 07:22
jmeter
分类树/装袋法/随机森林算法的
R语言
实现
原文首发于简书于[2018.06.12]本文是我自己动手用
R语言
写的实现分类树的代码,以及在此基础上写的袋装法(bagging)和随机森林(randomforest)的算法实现。
廖致君
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2025-06-23 11:11
R
flutter内容学习总结
Flutte
r语言
学习引言随着移动互联网的快速发展,移动应用开发已成为软件开发领域的一个重要分支。为了满足日益增长的应用需求,开发者们寻求更高效、更便捷的开发工具。
玖柒凯哲
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2025-06-22 06:28
学习
从0开始学习
R语言
--Day27--空间自相关
有的时候,我们在数据进行分组时,会发现用正常的聚类分析的方法和思维,分组的情况不是很理想。其实这是因为我们常常会忽略一个问题:假设我们正在分析的数据是真实的,那么它也肯定在一定程度上符合客观规律。而如果我们正在分析的数据中,有真实的客观空间数据时,可以考虑用空间自相关的方法去分析。例如我们在分析城市犯罪率的时候,用聚类分析的思维,我们可能会思考不同城市的犯罪特征是什么,是否有相似点,亦或是试图把城
Chef_Chen
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2025-06-22 06:56
学习
第100+42步 ChatGPT学习:
R语言
实现阈值调整
今天来说个机器学习分类的概念,阈值。一、何为阈值这个阈值(Threshold)在二分类问题中起到了关键作用,它决定了模型预测结果的分类边界。在二分类问题中,模型通常会输出一个概率值(介于0和1之间),表示样本属于某一类(通常为正类)的可能性。阈值的作用是将这个概率值转换为具体的分类结果(0或1)。如果预测概率**大于阈值**,则分类为正类(1)。如果预测概率**小于或等于阈值**,则分类为负类(0
Jet4505
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2025-06-20 14:38
《100+X
Steps
to
Get
ML》
学习
r语言
开发语言
chatgpt
从0开始学习
R语言
--Day26--因果推断
很多时候我们在探讨数据的相关性问题时,很容易会忽略到底是数据本身的特点还是真的是因为特征的区分导致的不同,从而误以为是特征起的效果比较大。这就好比测试一款新药是否真的能治病,假如吃药的患者康复的更快,那到底是因为药物本身的效果好,还是因为患者本身更健康,平时有控制饮食合理作息与运动,从而在患病后更快地凭借自身免疫力战胜病毒。这需要我们意识到对照试验还需要人为地补足某些条件,也就是探讨是否真的是X导
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2025-06-20 14:08
最新期刊影响因子,基本包含全部期刊
原文链接:2024年期刊最新影响因子(IF)2024年期刊最新影响因子(IF)BioinfoR生信筆記,注于分享生物信息学相关知识和
R语言
绘图教程。
Bioinfo科研生信筆記
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2025-06-19 10:17
影响因子
2024年期刊影响因子
期刊因子因子
IF
R语言
文本探索与预处理:入门指南
R语言
中的正则表达式(Regex)正则表达式(Regex)是定义文本模式的字符序列,用于搜索、模式匹配和文本替换等任务。在处理搜索引擎和垃圾邮件过滤等应用中的非结构化文本时至关重要。
Morpheon
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2025-06-19 08:00
R
r语言
开发语言
文本聚类分析:基于相似性的文档分组
文本聚类分析通过内容相似性将文档分组,实现在
R语言
中自动对大型文本集合进行分类。什么是文本聚类分析?聚类分析将文档分组,使得同一组内的文档彼此之间的相似度高于与其他组中文档的相似度。
Morpheon
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2025-06-18 04:20
R
R
TextClustering
scanpy读取10x单细胞数据
在面对数据读取问题时,
R语言
Seurat包有Read10X函数,Python中scanpy包则对应scanpy.read_10x_mtx
木与长清
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2025-06-16 12:23
单细胞数据处理
python
Flutter 与原生技术(Objective-C/Swift,java)的关系
在iOS开发中,Flutter与原生技术(Objective-C/Swift)的关系一、技术定位与核心差异Flutte
r语言
:使用Dart语言开发,通过AOT(提前编译)将代码转换为原生ARM指令,无需依赖
BAGAE
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2025-06-15 12:14
cocoa
macos
objective-c
智慧城市
java
开发语言
hbase
R语言
非结构化文本挖掘入门指南
文本挖掘(TextMining),也称为文本分析(TextAnalytics),是从非结构化文本数据中提取有意义的见解。全球约80%的数据是非结构化的。本篇博客将探讨文本挖掘和网络爬取的关键概念及基于R的实用技术。什么是文本挖掘?文本挖掘利用计算技术从非结构化文本源(如书籍、报告、文章、博客和社交媒体帖子)中提取结构化信息。它能够自动化地从海量数据集中发现知识,实现文本摘要和分析。关键点:非结构化
Morpheon
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2025-06-15 06:33
R
r语言
开发语言
从0开始学习
R语言
--Day20-ARIMA与格兰杰因果检验
ARIMAARIMA模型的核心就藏在其名字里,AR(自回归)代表了要预测的数据可能跟历史数据有关系,I(差分)代表了历史数据点之间的差异,MA(移动平均)代表了在预测历史数据点产生的误差可以在预测未来数据时修正,这三个点加起来共同用历史数据来预测未来值。举个浅显的例子就是,假设要预测明天会不会下雨,首先我们查看过去的数据带你,如果过去连续三天都下雨,那么明天下雨的概率就会很高,对应着AR,即用过去
Chef_Chen
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2025-06-14 14:08
学习
r语言
开发语言
Anaconda 基础教程
Anaconda是一个开源的Python和
R语言
的发行版本,致力于为数据科学、机器学习、大数据处理和科学计算提供便利的包管理和环境管理工具。它包含了conda包管理器和超过1500个数据科学常用的库。
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2025-06-13 10:05
R语言
序列8——RMarkdown与数据报告自动化
目录写在开头1.RMarkdown基础1.1开始第一个RMarkdown1.1.1安装R和RStudio1.1.2.安装pandoc1.1.3.创建一个新的RMarkdown文档1.1.4.编辑RMarkdown文档1.1.5.渲染文档1.1.6.导出文档1.2文档结构与语法1.3不同输出格式的配置(HTML、PDF、Word)2.动态报告与参数化报告2.1插入R代码和结果2.2使用参数化报告定制
theskylife
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2025-06-13 03:17
R语言的修炼之路
r语言
自动化
开发语言
【科研绘图系列】
R语言
绘制论文组图(multiple plots)
禁止商业或二改转载,仅供自学使用,侵权必究,如需截取部分内容请后台联系作者!文章目录介绍加载R包数据下载导入数据数据预处理画图1画图2画图3画图4输出图片总结系统信息介绍一个用于分析和可视化博茨瓦纳婴儿微生物组研究(BotswanaInfantMicrobiomeStudy)中呼吸道病毒和细菌数据的R脚本。代码的主要目的是生成论文中的Figure1,包括三个子图(a、b、c),并保存相关的数据和图
生信学习者1
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2025-06-11 13:22
SCI科研绘图系列
r语言
数据分析
数据挖掘
数据可视化
从0开始学习
R语言
--Day20--Wilcoxon秩和检验
Wilcoxon秩和检验当数据不满足正态分布时,我们常常会苦恼于如何处理数据。即使是用缩进的方法,把数据缩进到(1-99%)或(1-95%)的范围内,假如有一些数据点集中在数据分布的尾端,这依然会影响到我们对数据特点的判断,尤其是需要探寻数据组之间的联系或关系的时候。而实际上,假设我们要探究的不是数据在统计上的数值关系,而是因果关系或比较,我们可以把数据处理成秩次的形式,从而去对比数据组,这样相当
Chef_Chen
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2025-06-11 01:22
学习
r语言
开发语言
从0开始学习
R语言
--Day19--连续变量的相关性检验
昨天我们学习了分类变量的检验方法,今天我们来看看连续性变量的相关性检验方法。Pearson一般来说,person适用于两个变量之间满足线性的单调关系,像我们常说的单调递增或单调递减,且我们的变量是连续且正态分布的。简单来说,就是变量拥有无限的可能性,比如身高可能是160.1,160.9,185.32等等,且大部分的值都在平均值附近(比如一个城市成年男性的平均身高)。听起来似乎很简单,但有时候可以有
Chef_Chen
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2025-06-11 01:52
学习
r语言
开发语言
从0开始学习
R语言
--Day21--Kruskal-Wallis检验与Friedman检验
Kruskal-Wallis检验Kruskal-Wallis检验一般用于比较常见的比较三个群体的水平,比如我们有一班、二班、三班的语文成绩,我们将三个班的学生成绩混合在一起进行排名,也就是我们平时所说的级排名。进一步通过计算班级的平均级排名来判断班级之间的班级水平,这个方法要求数据之间要独立分布,即不要有类似三个班之间会有互相辅导的情况,不互相影响。Friedman检验Friedman检验同样用于
Chef_Chen
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2025-06-11 01:52
学习
300+SCI科研绘图系列教程(R和python)提供完整的数据和代码
科研绘图系列:科研绘图系列:
R语言
分组柱状图三科研绘图系列:箱线图加百分比点图展示组间差异-CSDN博客科研绘图系列:箱线图加蜜蜂图展示组间数据分布-CSDN博客科研绘图系列:小提琴图和双侧小提琴图展示组间差异
生信学习者1
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2025-06-09 15:56
SCI科研绘图系列
r语言
python
数据可视化
【科研绘图系列】
R语言
绘制论文组图(multiple plots)
禁止商业或二改转载,仅供自学使用,侵权必究,如需截取部分内容请后台联系作者!文章目录介绍加载R包数据下载导入数据数据预处理画图1画图2画图3画图4画图5画图6输出图片总结系统信息介绍这段代码是用于分析和可视化博茨瓦纳婴儿微生物组研究(BotswanaInfantMicrobiomeStudy)中呼吸道病毒和细菌定植数据的R脚本。代码的主要目的是生成论文中的Figure3,包括五个子图(a、b、c、
生信学习者1
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2025-06-09 12:01
SCI科研绘图系列
r语言
数据分析
数据挖掘
数据可视化
【
R语言
编程——数据调用】
这里写自定义目录标题可用库及数据集外部数据导入方法查看数据集信息在
R语言
中,有多个库支持调用内置数据集或外部数据,包括studentdata等教学或示例数据集。
南瓜胖胖
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2025-06-08 12:42
r语言
开发语言
go语言 第三方包安装方法_GO富集分析可视化:
R语言
GOplot包
找
R语言
做弦图的教程的时候发现了这个包:GOplot。其主要功能是可视化GO富集分析的结果。自己应该会用得到。
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2025-06-07 22:07
实验设计与分析(第6版,Montgomery著,傅珏生译) 第10章拟合回归模型10.9节思考题10.6
R语言
解题
本文是实验设计与分析(第6版,Montgomery著,傅珏生译)第10章拟合回归模型10.9节思考题10.6
R语言
解题。主要涉及线性回归、回归的显著性。
lishaoan77
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2025-06-06 00:58
实验设计与分析思考题
回归
r语言
实验设计与数据分析‘
线性回归
回归显著性
实验设计与分析(第6版,Montgomery著,傅珏生译) 第10章拟合回归模型10.9节思考题10.12
R语言
解题
本文是实验设计与分析(第6版,Montgomery著,傅珏生译)第10章拟合回归模型10.9节思考题10.12
R语言
解题。主要涉及线性回归、回归的显著性、残差分析。
lishaoan77
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2025-06-06 00:25
实验设计与分析思考题
回归
r语言
实验设计与数据分析
线性回归
回归显著性
残差分析
R语言
入门-学习笔记记录
###第1章:基础入门##第1章-3.R扩展包的10个问题#安装某个扩展包#也可以在右下角的框中“packages”栏中的“install”项目中操作install.packages("devtools")#查看已安装的扩展包#也可以在右下角的框中“packages”栏中查看installed.packages()#更新:第一行查看未更新的扩展包;第二行执行更新指令。#也可以在右下角的框中“pac
小狗狗跑数据
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2025-06-03 19:56
r语言
【
R语言
编程绘图-mlbench】
mlbench库简介mlbench是一个用于机器学习的
R语言
扩展包,主要用于提供经典的基准数据集和工具,常用于算法测试、教学演示或研究场景。该库包含多个知名数据集,涵盖分类、回归、聚类等任务。
南瓜胖胖
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2025-06-03 18:13
r语言
开发语言
机器学习
R语言
错误处理方法大全
在
R语言
的批量运行中,常需要自动跳过错误,继续向下运行。
weixin_49320263
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2025-06-03 18:13
常用方法
r语言
开发语言
R 语言数据类型转换与判断完全指南
在
R语言
的数据处理与分析中,准确地进行数据类型转换和判断是基础且关键的技能。本文将系统介绍
R语言
中数据类型操作的核心方法,并通过实例演示其应用场景。
晚风keeper
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2025-06-01 10:01
R
r语言
算法
学习
笔记
机器学习
数据结构
开发语言
R 语言科研绘图第 52 期 --- 网络图-分组
为了便于使用,本系列文章介绍的所有绘图都已收录到了sciRplot项目中,获取方式:
R语言
科研绘图模板---sciRplothttps://mp.weixin.qq.com/s/QA_8LVqjkdg4A16zLonw4w
TigerZ 生信宝库
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2025-05-30 16:29
r语言
开发语言
贴图
R语言
绘图——组间差异箱线图图,小提琴图、聚类热力图、相关系数热力图
展示聚类热图反映数据在多样本间的差异表达情况相关系数热力图:corrplot绘制相关系数图来展示数据间的相关性~相关性分析图:ggMarginal()绘制相关性分析图注:本文摘自于公众号:科研生信充电宝,
R语言
sta@ma@brain
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2025-05-29 15:31
神经科学工具箱
脑科学核磁共振成像
数据分析
r语言
【
R语言
编程绘图-调色】
绘制高质量期刊论文图表ggsci是一个
R语言
包,提供了一系列适合科研论文的配色方案,支持常见期刊(如Nature、Science、Lancet)的配色风格。
南瓜胖胖
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2025-05-28 11:35
R
r语言
开发语言
ggplot2绘图--
R语言
library(ggplot2)#加载包#基本数据datax<-c(0:99)*2*pi/100datay<-sin(datax)*4+cos(2*datax)*2dix<-c(rnorm(100))#Scatterplot散点图plot(datax,datay)#绘制散点图#LineGraph线图plot(datax,datay,type="l")#绘制线图points(datax[20:40]
小鱼鱼爱编程
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2025-05-28 10:33
r语言
r语言
开发语言
贴图
R语言
绘制箱图的详细教程
R语言
绘制箱图的详细教程箱图(BoxPlot),又称为盒须图或盒式图,是一种用于显示数值型数据分布情况的统计图表。它可以显示出数据集的中位数、上下四分位数以及异常值的存在与否。
HackMasterX
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2025-05-28 10:00
r语言
开发语言
R语言
从0开始学习
R语言
--Day09--方差分析
前两天我们学习了T检验来判断两组数据之间的差异是显著存在还是因为偶然,但如果存在多组数据,我们还是两两去对比作T检验的话,会存在假阳性(也就是把没有差异判断为有差异),虽然每次单独的T检验只有5%,但即使数据只是多了三组,也要作三次T检验,假阳性的概率就被叠加到了大概14%。方差分析而如果我们采用方差分析的方式,先判断是否存在差异,并在后续判断两两之间的差异时,考虑数据组内的差异性,因为存在即使两
Chef_Chen
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2025-05-28 10:30
学习
r语言
开发语言
【
R语言
编程绘图-折线图】
安装与加载GGPLOT2库确保已安装ggplot2库,若未安装可通过以下命令安装:install.packages("ggplot2")加载库:library(ggplot2)准备数据假设有一个包含时间序列数据的数据框df,包含两列:date(日期)和value(数值)。示例数据生成:df<-data.frame(date=seq(as.Date("2023-01-01"),as.Date("20
南瓜胖胖
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2025-05-28 10:59
r语言
开发语言
R语言
科研编程-柱状图
R语言
简介
R语言
是一种开源的统计计算和图形绘制编程语言,广泛应用于数据分析、机器学习、数据可视化等领域。
南瓜胖胖
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2025-05-25 14:46
R
r语言
开发语言
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