pandas－

1.load data

如读取：

xx.txt :23723rows 466columns 每列\t 分开

#sep 分节符读取 \t 分界 
 
  
 
  
import pandas as pd
data =  pd.read_csv('xx.txt',sep="\t",header = None)
print data时候 
  
 
  

    也是23723rows 466columns 
  
 
  
 
   
#sep 分节符读取 没有 分界
 
   
 
   
import pandas as pd
data =  pd.read_csv('xx.txt',sep="",header = None)
print data 时候  
  
 
  

    23723rows 1 columns 
  
 
  
 
   
 
  
 
  
2.存入文件
 
  
 
   
#当处理完dataframe，存入文件， 每列用"\t"隔开
 
   
df.to_csv('/Users/tangchao/Desktop/snp.txt',sep= "\t",header = None)
 
   
 
   
 
  
 
  
3. 格式dataframe
 
  

    index 是第一列 一般是0，1，2...... columns 第一行 一般可以为它赋一个 
  
 
  
 
   
>>> df = DataFrame(data,index=['one','two','three','four','five'],
               columns=['year','state','pop','debt'])
>>> df
       year   state  pop debt
one    2000   Ohino  1.5  NaN
two    2001   Ohino  1.7  NaN
three  2002   Ohino  3.6  NaN
four   2001  Nevada  2.4  NaN
five   2002  Nevada  2.9  NaN

[5 rows x 4 columns]
 
   
 
    
 
   
 
   
4.删除特征列
 
   

     axis =1 是列，axis ＝1 是行 
   
 
   

     还是loda xx.txt 文件 得到dataframe，格式如上。 
   
 
   
 
    
import pandas as pd
data =  pd.read_csv('xx.txt',sep="\t",header = None)
 
    
 
    
data.columns = list1  #list1是一个list，每一个单元是xx.txt的第一行"\t"隔开的字符。list = ["TargetID","Gene_Symbol".....]
new_data = data.drop(diff, axis = 1) #diff 也是一个list，每个单元是要删除的字符。diff = ["HG00096","HG00099"]
 
    
print data.TargetID[0] 第一行第一列
 
    
 
     
 
    
 
    
5。文件行操作
 
   
 
   
 
    
import pandas as pd
data =  pd.read_csv('xx.txt',sep="",header = None)
 
    
#此时data 23723rows 1 column
 
    
data.columns = ["aaa"]
 
    
print data.aaa[0]#第一行所有的
 
    
 
     
 
    
 
    
6文件的转置
 
    
 
     
print df.T
 
     
 
     
 
    
 
    
7提取文件多少行到多少列
 
   
 
   
 
    
#data是 文件的内容 data从aa.txt读取的
 
    
print data.ix[0:2,0:3] #第1-3行，1-4列