LAMP Designer:环介导等温扩增引物的设计


LAMP Designer可以为环介导的等温扩增分析设计有效的引物,在等温条件下扩增DNARNA序列,而无需建立PCR体系。这项技术依赖于自动循环和DNA聚合酶介导的链置换DNA合成,在不到一小时的时间内将几份DNA扩增到109份。反转录偶联LAMP可用于RNA序列的扩增。


LAMP Designer:环介导等温扩增引物的设计_第1张图片


LAMP使用了四个特别设计的引物(两个内引物和两个外引物),识别目标DNA中的六个不同区域。四个引物与目的DNA的杂交是LAMP效率的关键步骤。因此,这四个引物的设计是成功检测的关键。

避免交叉同源

LAMP Designer自动解释BLAST搜索结果,并避免那些区域设计与数据库有显著交叉同源性的引物。

验证BLAST

可以根据数据库对引物进行BLAST搜索,以验证其特异性。

复合LAMP引物组件

为一个序列设计的引物可以进行多路复用检查。此软件显示了所设计引物间最稳定的交叉同系物的自由能量。

导出结果

设计的引物集及其属性可以以标准csvexcel格式导出。

数据和数据库管理

可以创建多个项目。通过为每个实验创建单独的项目,可以方便地管理多个实验的数据。它为序列信息和搜索结果维护一个本地数据库。







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