第一代测序技术原理

双脱氧法的核心技术就是在DNA聚合酶合成DNA链的过程中按一定比例掺入双脱氧核苷酸(ddNTP),导致DNA链在掺入ddNTP时终止延伸。理论上所有的位点均有可能掺入双脱氧核苷,从而产生终止于任何一个位点的寡核苷酸片段,每个片段的3’末端都是一个双脱氧的核苷酸残基,因为四种ddNTP上各有一种发光基团,在最后的识别中通过收集到的荧光信号就能够确定末端的ddNTP。

上机测序:先在毛细管中注入丙烯酰胺溶液,丙烯酰胺在紫外线的电离作用下发生聚合反应变成聚丙烯酰胺凝胶,将DNA片段混合物加入到有聚丙烯酰胺凝胶的一端,在毛细管的两端加上电压进行电泳,在毛细管的正极的末端用激光照射,经过光学传感器记录荧光信号。

BigDye试剂中包括四种荧光标记的ddNTP,dNTP,DNA聚合酶,镁离子,PH缓冲液等。

序列分析(Sanger 测序):

    1、荧光染料在ddNTP上;

    2、体系中含有荧光标记的ddNTP和未标记的dNTP;

    3、不同碱基用不同颜色的荧光进行标记;

    4、获得一系列长度相差为1bp的片段。

SNaPshot:

    1、荧光染料在ddNTP上;

    2、体系中只含有荧光标记的ddNTP;

    3、不同碱基用不同颜色的荧光进行标记;

    4、获得引物延伸1bp的产物片段。

片段分析:

    1、荧光染料结合在引物上;

    2、体系中只含有未标记的dNTP;

    3、片段长度相近的不同目的片段用不同颜色标记其引物;

    4、获得特定的目的片段。

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