生信修炼手册
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circR2Disease:疾病相关的环状RNA数据库

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从名称可以看出,circR2Disease是一个疾病相关的环状RNA数据库,网址如下

http://bioinfo.snnu.edu.cn/CircR2Disease/

该数据库中包含以下3个物种的相关信息

  1. human

  2. mouse

  3. rat


最新版收录了661个环状RNA,100种疾病,739个环状RNA和疾病之间的关联数据。
通过导航栏的Browser菜单，可以根据以下两种类型查看相关数据

  1. circRNAs

  2. Diseases


以肺癌为例，结果如下所示

circR2Disease:疾病相关的环状RNA数据库_第1张图片

该数据库中的记录都是从文献中整理得到的,如果环状RNA来自circBase数据库,会给出对应的超链接,否则只会给出文献中的命名。

和同类型的数据库一样，都会给出疾病的名称，检测的方式，环状RNA在患病者中的表达趋势，相关文献的pubmed id等信息。

通过这种类型的数据库，我们不仅可以检索环状RNA和疾病之间的关系，还可以构建环状RNA和疾病之间的互作网络，示意如下

circR2Disease:疾病相关的环状RNA数据库_第2张图片

上图中矩形代表疾病名称,圆形代表环状RNA,通过不断丰富环状RNA和疾病之间的网络，可以对环状RNA在疾病中的作用有一个更加清楚，深入的理解。

·end·

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circR2Disease:疾病相关的环状RNA数据库_第3张图片

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