生物信息软件安装3：安装预编译版本的BLAST

由于我国特殊的网络环境，有时候我们通过conda无法顺利下载和安装生信软件，我们必须还得熟悉传统的软件安装方式，以备不时之需。

传统的软件安装方式包括：安装预编译版本的软件和从源代码安装软件。由于从源代码安装软件的编译过程非常缓慢，一般情况下优先安装预编译版本。

1.从ftp下载预编译版本的BLAST安装包

# 选择Linux系统安装包，复制链接地址，wget下载
# 也可使用浏览器下载后，通过FileZilla上传到服务器
wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/LATEST/ncbi-blast-2.7.1+-x64-linux.tar.gz`

复制BLAST下载链接

通过wget命令下载BLAST软件

2.解压缩软件

tar -zxvf ncbi-blast-2.7.1+-x64-linux.tar.gz

解压缩后，在安装目录下的bin文件夹下课看到可执行文件：

bin目录下的可执行文件

通过命令 ./blastp -help可以返回blastp的帮助文档，说明BLAST程序可成功执行：

image

3.把程序的可执行文件添加到环境变量中

我们手动安装的预编译版本的软件，默认情况下是不会把可执行文件添加到系统的环境变量中去的，每次我们执行程序时，都需要使用程序的绝对路径，这样就非常麻烦。我们可以手动添加到环境变量中：

# cd 进入home目录中
cd ~
# 打开.profile文件
vim .profile
# 在.profile中加入添加环境变量的命令，其中export PATH=$PATH:后面是blast可执行文件的绝对路径
export PATH=$PATH:/mnt/h/Workspace/Biosoft/ncbi-blast-2.7.1+/bin/
# 使添加的环境变量立即生效
source .profile

程序可直接执行

直接运行blastp程序，可以顺利执行，安装成功！