下载line1序列

法一：

安装：

sudo apt install mysql-client-core-5.7

sudo apt install mariadb-client-core-10.1

下载：

mysql --user=genome --host=genome-mysql.cse.ucsc.edu -A -D mm10 -e 'select chrom,chromStart,chromEnd,name from nestedRepeats where repClass="LINE" ' > line1.bed

查看：

ref: https://www.biostars.org/p/127759/

法二：

查看：

ref：UCSC Genome Browser Public Support › LINE

比较下选择第二个mm10：

验证：

有的时候网速不好一定要检查文件完整性！

在igv中查看：