- 深度应用驱动的医学知识图谱构建(二)
Necther
知识图谱人工智能
更多分享请关注公众号系统之神与我同在数研院医学知识图谱构建1.模型建立医学领域的知识图谱由于其知识专业性强,行业通常采用自上而下的方式,先构建Schema,再抽取知识。数研院医学知识图谱Schema主要参考了UMLS语义网络、http://Schema.org、cnschema等建立,涉及四大领域2019年8月首次发布Schema,目前包含72种语义类型、493种语义关系。Schema查询和下载网
- 基于lstm+crf实现电子病历实体信息识别 完整的代码+数据集+说明 毕设
甜辣uu
python从入门到精通lstm课程设计人工智能图像识别电子病历
中文电子病历命名实体和实体关系标注体系建立通过分析电子病历,医生针对患者的诊疗活动可以概括为:通过检查手段(做什么检查)发现疾病的表现(什么症状),给出诊断结论(什么疾病),并基于诊断结论,给出治疗措施(如何治疗)。从这个过程可以看出,医疗活动主要涉及四类重要信息:检查、症状、疾病和治疗。这四类信息在UMLS中也具有明确对应的语义类型定义。中文病历中对患者症状和检查结果的描述占有相当大的比重,因此
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数学是算法的灵魂
人工智能lstm人工智能rnn图像识别信息抽取
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- UMLS—记录一些使用
zmcadlf
知识记录自然语言处理人工智能nlp
UMLS参考手册https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK9676/MetaMapMetaMap是一个把生物医学文本与UMLS超级词表中的概念匹配起来的程序MetaMap下载(需要UMLS许可):MainDownloadhttps://lhncbc.nlm.nih.gov/ii/tools/MetaMap/run-locally/MainDownload.html
- KBQA(知识图谱问答)-常用数据集:UMLS:医疗数据集; Kinship:亲属关系数据集
u013250861
数据集知识图谱人工智能
知识图谱数据集UMLS:医疗数据集Kinship:亲属关系数据集WN18RR:WordNet子集。描述英语单词之间关联特征的数据集,同时保留WordNet数据集中的对称、非对称和组合关系,去除了倒装关系FB15k-237:Freebase子集参考资料:知识图谱数据集下载KnowledgeGraphDatasets
- Mac下UMLS配置以及QuickUMLS项目使用方法(windows和Linux类似)
疯杜骗骗
大数据pycharmpythonmacmacos
Mac下UMLS配置以及QuickUMLS项目使用方法(windows和Linux类似)UMLS配置链接:UMLS下载地址(使用信息,接口等都在这里找).点击FullRelease后会让你申请许可,提交申请后,大概要等一到三个工作日。下载并解压完后得到如下图文件。文件中,需要对mmsys.zip进行解压,但mmsys.zip解压完不能消失,也就是解压完还得存在mmsys.zip这个文件(所以解压之
- 知识图谱数据集下载 KnowledgeGraphDatasets
土豆面包
知识图谱知识图谱
知识图谱数据集UMLS:医疗数据集Kinship:亲属关系数据集WN18RR:WordNet子集。描述英语单词之间关联特征的数据集,同时保留WordNet数据集中的对称、非对称和组合关系,去除了倒装关系FB15k-237:Freebase子集不同数据集的统计信息如下:DatasetEntitiesRelationsTrainValidTestTotalTriplesUMLS135465216652
- kg-bert github地址,bert用于知识图谱
搬砖老头
机器学习
https://github.com/autoliuweijie/K-BERThttps://github.com/yao8839836/kg-bert/tree/master/data/umls
- UMLS学习笔记
漱衣仁止
学习材料TheUMLSWhatisitandhowtouseit(PPT)UMLS及其在智能检索中的应用目标1.umls有哪些数据类型2.各种数据类型是如何组织的:有哪些资源抽象成了哪些概念;relationship的来源及是怎么组织的3.构想如何找一个实际的例子4.看UMLSRestfulAPI,怎样用python从API上取数据PPTOutline笔记一.简介UnifiedMedicalLan
- HL7 CDA笔记
smile_caijx
医疗工作日常医疗HL7CDA共享文档
特定域的消息或文档规格说明书能够通过迭代约束RIM到DMIM、RMIM来产生,并产生实施产物(XSD)HITSP医疗信息技术标准类别类别主要标准数据标准ICD、SNOMED、LOINC、UMLS信息内容标准HL7CDA、CCD信息交换标准HL7V2、HL7V3、DICOM3.0标识标准HIPAA、CMS隐私与安全标准HIPAA功能标准HER-SFM其他标准IHE、HIE、HTML、ActiveMQ
- 斯坦福大学-自然语言处理入门 笔记 第十课 关系抽取(relation extraction)
sansheng su
introductiontoNLP
一、简介关系抽取就是从文档中抽取关系,例子如下:为什么进行关系抽取创建新的关系型知识库(knowledgebases)增强目前的知识库(knowledgebases)支持问题回答(questionanswering)一些例子自动内容抽取(AutomatedContentExtraction(ACE))2008年关系抽取任务的17种关系UMLS:UnifiedMedicalLanguageSyste
- UMLS的语义类型和语义网络
thirsd
UMLS官方文档:https://www.nlm.nih.gov/research/umls/new_users/online_learning/OVR_001.html语义网络介绍页面:https://www.nlm.nih.gov/research/umls/new_users/online_learning/SEM_001.htmlUMLS定义的语义类型:https://www.nlm.ni
- 国内外知识图谱资源-国际(UMLS)
贾辛洪
知识图谱
•定义:统一医学语言系统(UnifiedMedicalLanguageSystem,UMLS)是美国国立医学图书馆(NationalLibraryofMedicine,NLM)于1986年开始建设的一体化医学知识语言,具有集成性、跨领域和工具化的特点。•应用:UMLS在信息检索(InformationRetrieval)、自然语言处理(NaturalLanguageProcessing)、电子病历
- macos下用python使用cx_Oracle连接oracle数据库,报错cx_Oracle.DatabaseError: DPI-1047: 64-bit Oracle Client librar
lucas-nlp
pythonoracle
File"/Users/lukezhi/Lucas/Lucas-Projects/PythonProj/hongDaoProjects/symptomCluster/extract_Dis_Sym_Umls.py",line8,inconn=cx_Oracle.connect('umls/
[email protected]:1521/orcl')#连接数据库cx_Oracle.Databa
- Agile software architecture design document style..( sketches and no UMLs)
Architecture
http://www.infoq.com/articles/agile-software-architecture-sketches-NoUML
If you're working in an agile software development team at the moment, take a look around at your environment. Whether
- iOS http封装
374016526
ios服务器交互http网络请求
程序开发避免不了与服务器的交互,这里打包了一个自己写的http交互库。希望可以帮到大家。
内置一个basehttp,当我们创建自己的service可以继承实现。
KuroAppBaseHttp *baseHttp = [[KuroAppBaseHttp alloc] init];
[baseHttp setDelegate:self];
[baseHttp
- lolcat :一个在 Linux 终端中输出彩虹特效的命令行工具
brotherlamp
linuxlinux教程linux视频linux自学linux资料
那些相信 Linux 命令行是单调无聊且没有任何乐趣的人们,你们错了,这里有一些有关 Linux 的文章,它们展示着 Linux 是如何的有趣和“淘气” 。
在本文中,我将讨论一个名为“lolcat”的小工具 – 它可以在终端中生成彩虹般的颜色。
何为 lolcat ?
Lolcat 是一个针对 Linux,BSD 和 OSX 平台的工具,它类似于 cat 命令,并为 cat
- MongoDB索引管理(1)——[九]
eksliang
mongodbMongoDB管理索引
转载请出自出处:http://eksliang.iteye.com/blog/2178427 一、概述
数据库的索引与书籍的索引类似,有了索引就不需要翻转整本书。数据库的索引跟这个原理一样,首先在索引中找,在索引中找到条目以后,就可以直接跳转到目标文档的位置,从而使查询速度提高几个数据量级。
不使用索引的查询称
- Informatica参数及变量
18289753290
Informatica参数变量
下面是本人通俗的理解,如有不对之处,希望指正 info参数的设置:在info中用到的参数都在server的专门的配置文件中(最好以parma)结尾 下面的GLOBAl就是全局的,$开头的是系统级变量,$$开头的变量是自定义变量。如果是在session中或者mapping中用到的变量就是局部变量,那就把global换成对应的session或者mapping名字。
[GLOBAL] $Par
- python 解析unicode字符串为utf8编码字符串
酷的飞上天空
unicode
php返回的json字符串如果包含中文,则会被转换成\uxx格式的unicode编码字符串返回。
在浏览器中能正常识别这种编码,但是后台程序却不能识别,直接输出显示的是\uxx的字符,并未进行转码。
转换方式如下
>>> import json
>>> q = '{"text":"\u4
- Hibernate的总结
永夜-极光
Hibernate
1.hibernate的作用,简化对数据库的编码,使开发人员不必再与复杂的sql语句打交道
做项目大部分都需要用JAVA来链接数据库,比如你要做一个会员注册的 页面,那么 获取到用户填写的 基本信后,你要把这些基本信息存入数据库对应的表中,不用hibernate还有mybatis之类的框架,都不用的话就得用JDBC,也就是JAVA自己的,用这个东西你要写很多的代码,比如保存注册信
- SyntaxError: Non-UTF-8 code starting with '\xc4'
随便小屋
python
刚开始看一下Python语言,传说听强大的,但我感觉还是没Java强吧!
写Hello World的时候就遇到一个问题,在Eclipse中写的,代码如下
'''
Created on 2014年10月27日
@author: Logic
'''
print("Hello World!");
运行结果
SyntaxError: Non-UTF-8
- 学会敬酒礼仪 不做酒席菜鸟
aijuans
菜鸟
俗话说,酒是越喝越厚,但在酒桌上也有很多学问讲究,以下总结了一些酒桌上的你不得不注意的小细节。
细节一:领导相互喝完才轮到自己敬酒。敬酒一定要站起来,双手举杯。
细节二:可以多人敬一人,决不可一人敬多人,除非你是领导。
细节三:自己敬别人,如果不碰杯,自己喝多少可视乎情况而定,比如对方酒量,对方喝酒态度,切不可比对方喝得少,要知道是自己敬人。
细节四:自己敬别人,如果碰杯,一
- 《创新者的基因》读书笔记
aoyouzi
读书笔记《创新者的基因》
创新者的基因
创新者的“基因”,即最具创意的企业家具备的五种“发现技能”:联想,观察,实验,发问,建立人脉。
第一部分破坏性创新,从你开始
第一章破坏性创新者的基因
如何获得启示:
发现以下的因素起到了催化剂的作用:(1) -个挑战现状的问题;(2)对某项技术、某个公司或顾客的观察;(3) -次尝试新鲜事物的经验或实验;(4)与某人进行了一次交谈,为他点醒
- 表单验证技术
百合不是茶
JavaScriptDOM对象String对象事件
js最主要的功能就是验证表单,下面是我对表单验证的一些理解,贴出来与大家交流交流 ,数显我们要知道表单验证需要的技术点, String对象,事件,函数
一:String对象;通常是对字符串的操作;
1,String的属性;
字符串.length;表示该字符串的长度;
var str= "java"
- web.xml配置详解之context-param
bijian1013
javaservletweb.xmlcontext-param
一.格式定义:
<context-param>
<param-name>contextConfigLocation</param-name>
<param-value>contextConfigLocationValue></param-value>
</context-param>
作用:该元
- Web系统常见编码漏洞(开发工程师知晓)
Bill_chen
sqlPHPWebfckeditor脚本
1.头号大敌:SQL Injection
原因:程序中对用户输入检查不严格,用户可以提交一段数据库查询代码,根据程序返回的结果,
获得某些他想得知的数据,这就是所谓的SQL Injection,即SQL注入。
本质:
对于输入检查不充分,导致SQL语句将用户提交的非法数据当作语句的一部分来执行。
示例:
String query = "SELECT id FROM users
- 【MongoDB学习笔记六】MongoDB修改器
bit1129
mongodb
本文首先介绍下MongoDB的基本的增删改查操作,然后,详细介绍MongoDB提供的修改器,以完成各种各样的文档更新操作 MongoDB的主要操作
show dbs 显示当前用户能看到哪些数据库
use foobar 将数据库切换到foobar
show collections 显示当前数据库有哪些集合
db.people.update,update不带参数,可
- 提高职业素养,做好人生规划
白糖_
人生
培训讲师是成都著名的企业培训讲师,他在讲课中提出的一些观点很新颖,在此我收录了一些分享一下。注:讲师的观点不代表本人的观点,这些东西大家自己揣摩。
1、什么是职业规划:职业规划并不完全代表你到什么阶段要当什么官要拿多少钱,这些都只是梦想。职业规划是清楚的认识自己现在缺什么,这个阶段该学习什么,下个阶段缺什么,又应该怎么去规划学习,这样才算是规划。
- 国外的网站你都到哪边看?
bozch
技术网站国外
学习软件开发技术,如果没有什么英文基础,最好还是看国内的一些技术网站,例如:开源OSchina,csdn,iteye,51cto等等。
个人感觉如果英语基础能力不错的话,可以浏览国外的网站来进行软件技术基础的学习,例如java开发中常用的到的网站有apache.org 里面有apache的很多Projects,springframework.org是spring相关的项目网站,还有几个感觉不错的
- 编程之美-光影切割问题
bylijinnan
编程之美
package a;
public class DisorderCount {
/**《编程之美》“光影切割问题”
* 主要是两个问题:
* 1.数学公式(设定没有三条以上的直线交于同一点):
* 两条直线最多一个交点,将平面分成了4个区域;
* 三条直线最多三个交点,将平面分成了7个区域;
* 可以推出:N条直线 M个交点,区域数为N+M+1。
- 关于Web跨站执行脚本概念
chenbowen00
Web安全跨站执行脚本
跨站脚本攻击(XSS)是web应用程序中最危险和最常见的安全漏洞之一。安全研究人员发现这个漏洞在最受欢迎的网站,包括谷歌、Facebook、亚马逊、PayPal,和许多其他网站。如果你看看bug赏金计划,大多数报告的问题属于 XSS。为了防止跨站脚本攻击,浏览器也有自己的过滤器,但安全研究人员总是想方设法绕过这些过滤器。这个漏洞是通常用于执行cookie窃取、恶意软件传播,会话劫持,恶意重定向。在
- [开源项目与投资]投资开源项目之前需要统计该项目已有的用户数
comsci
开源项目
现在国内和国外,特别是美国那边,突然出现很多开源项目,但是这些项目的用户有多少,有多少忠诚的粉丝,对于投资者来讲,完全是一个未知数,那么要投资开源项目,我们投资者必须准确无误的知道该项目的全部情况,包括项目发起人的情况,项目的维持时间..项目的技术水平,项目的参与者的势力,项目投入产出的效益.....
- oracle alert log file(告警日志文件)
daizj
oracle告警日志文件alert log file
The alert log is a chronological log of messages and errors, and includes the following items:
All internal errors (ORA-00600), block corruption errors (ORA-01578), and deadlock errors (ORA-00060)
- 关于 CAS SSO 文章声明
denger
SSO
由于几年前写了几篇 CAS 系列的文章,之后陆续有人参照文章去实现,可都遇到了各种问题,同时经常或多或少的收到不少人的求助。现在这时特此说明几点:
1. 那些文章发表于好几年前了,CAS 已经更新几个很多版本了,由于近年已经没有做该领域方面的事情,所有文章也没有持续更新。
2. 文章只是提供思路,尽管 CAS 版本已经发生变化,但原理和流程仍然一致。最重要的是明白原理,然后
- 初二上学期难记单词
dcj3sjt126com
englishword
lesson 课
traffic 交通
matter 要紧;事物
happy 快乐的,幸福的
second 第二的
idea 主意;想法;意见
mean 意味着
important 重要的,重大的
never 从来,决不
afraid 害怕 的
fifth 第五的
hometown 故乡,家乡
discuss 讨论;议论
east 东方的
agree 同意;赞成
bo
- uicollectionview 纯代码布局, 添加头部视图
dcj3sjt126com
Collection
#import <UIKit/UIKit.h>
@interface myHeadView : UICollectionReusableView
{
UILabel *TitleLable;
}
-(void)setTextTitle;
@end
#import "myHeadView.h"
@implementation m
- N 位随机数字串的 JAVA 生成实现
FX夜归人
javaMath随机数Random
/**
* 功能描述 随机数工具类<br />
* @author FengXueYeGuiRen
* 创建时间 2014-7-25<br />
*/
public class RandomUtil {
// 随机数生成器
private static java.util.Random random = new java.util.R
- Ehcache(09)——缓存Web页面
234390216
ehcache页面缓存
页面缓存
目录
1 SimplePageCachingFilter
1.1 calculateKey
1.2 可配置的初始化参数
1.2.1 cach
- spring中少用的注解@primary解析
jackyrong
primary
这次看下spring中少见的注解@primary注解,例子
@Component
public class MetalSinger implements Singer{
@Override
public String sing(String lyrics) {
return "I am singing with DIO voice
- Java几款性能分析工具的对比
lbwahoo
java
Java几款性能分析工具的对比
摘自:http://my.oschina.net/liux/blog/51800
在给客户的应用程序维护的过程中,我注意到在高负载下的一些性能问题。理论上,增加对应用程序的负载会使性能等比率的下降。然而,我认为性能下降的比率远远高于负载的增加。我也发现,性能可以通过改变应用程序的逻辑来提升,甚至达到极限。为了更详细的了解这一点,我们需要做一些性能
- JVM参数配置大全
nickys
jvm应用服务器
JVM参数配置大全
/usr/local/jdk/bin/java -Dresin.home=/usr/local/resin -server -Xms1800M -Xmx1800M -Xmn300M -Xss512K -XX:PermSize=300M -XX:MaxPermSize=300M -XX:SurvivorRatio=8 -XX:MaxTenuringThreshold=5 -
- 搭建 CentOS 6 服务器(14) - squid、Varnish
rensanning
varnish
(一)squid
安装
# yum install httpd-tools -y
# htpasswd -c -b /etc/squid/passwords squiduser 123456
# yum install squid -y
设置
# cp /etc/squid/squid.conf /etc/squid/squid.conf.bak
# vi /etc/
- Spring缓存注解@Cache使用
tom_seed
spring
参考资料
http://www.ibm.com/developerworks/cn/opensource/os-cn-spring-cache/
http://swiftlet.net/archives/774
缓存注解有以下三个:
@Cacheable @CacheEvict @CachePut
- dom4j解析XML时出现"java.lang.noclassdeffounderror: org/jaxen/jaxenexception"错误
xp9802
java.lang.NoClassDefFoundError: org/jaxen/JaxenExc
关键字: java.lang.noclassdeffounderror: org/jaxen/jaxenexception
使用dom4j解析XML时,要快速获取某个节点的数据,使用XPath是个不错的方法,dom4j的快速手册里也建议使用这种方式
执行时却抛出以下异常:
Exceptio