leecode 解题总结：187. Repeated DNA Sequences

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using namespace std;
/*
问题:
All DNA is composed of a series of nucleotides abbreviated as A, C, G, and T, for example: "ACGAATTCCG". When studying DNA, 
it is sometimes useful to identify repeated sequences within the DNA.

Write a function to find all the 10-letter-long sequences (substrings) that occur more than once in a DNA molecule.

For example,

Given s = "AAAAACCCCCAAAAACCCCCCAAAAAGGGTTT",

Return:
["AAAAACCCCC", "CCCCCAAAAA"].

分析:nucleotides:核苷酸，abbreviated:简短的.
此题需要寻找出长度为10的重复出现的子串。
重复子串问题可以用后缀数组，对后缀数组排序，然后，寻找长度为10的后缀串，
判断相邻两个是字符串中是否包含另一个字符串，如果包含，返回
但是发现不行，后缀数组，用于找到最长重复子串用commLen。
但是发现答案提供的是那种子串不能连在一起的。

如果我每次设定起点和终点，然后遍历后续是否出现即可，设定起点和终点
时间复杂度为O(n)，每次寻找时间复杂度为O(n)

输入:
AAAAACCCCCAAAAACCCCCCAAAAAGGGTTT
AAAAACCCCCAAAAA
输出:
AAAAACCCCC CCCCCAAAAA
no result

报错:Memory Limit Exceeded，内存超出限制。
因为后缀数组的时间复杂度为O(n^3)
学习一下KMP算法

关键:
1 leecode解法:https://discuss.leetcode.com/topic/27517/7-lines-simple-java-o-n
从位置0开始，每次截取10个字符，压入到set中，如果重复就压入真正重复的集合中。
避免字符串搜索，本质上是把字符串搜索变为set的比较去重
2压入的时候仍然用set，可能存在重复压入
*/

class Solution {
public:
    vector findRepeatedDnaSequences(string s) {
		vector result;
		if(s.empty() || s.size() <= 10)
		{
			return result;
		}
		//产生后缀数组
		int len = s.length();
		unordered_map visited;
		string str;
		set setResult;
		for(int i = 0 ; i + 9 < len ; i++)
		{
			str = s.substr(i ,10);
			//重复，说明是所要求的结果
			if(visited.find(str) != visited.end())
			{
				//可能存在重复压入
				setResult.insert(str);
			}
			else
			{
				visited[str] = true;
			}
		}
		for(set::iterator it = setResult.begin() ; it != setResult.end() ; it++)
		{
			result.push_back(*it);
		}
		return result;
	}
};

void print(vector& result)
{
	if(result.empty())
	{
		cout << "no result" << endl;
		return;
	}
	int size = result.size();
	for(int i = 0 ; i < size ; i++)
	{
		cout << result.at(i) << " " ;
	}
	cout << endl;
}

void process()
{
	 string value;
	 Solution solution;
	 vector result;
	 while(cin >> value )
	 {
		 result = solution.findRepeatedDnaSequences(value);
		 print(result);
	 }
}

int main(int argc , char* argv[])
{
	process();
	getchar();
	return 0;
}